RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	NBR1	Q14596	966 aa		9.54	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		9.54	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	9.54	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		9.54	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		9.54	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		9.53	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	DLC1	Q96QB1	1528 aa		9.53	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	MTHFS	P49914	203 aa		9.53	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF10	O15013	1369 aa		9.53	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		9.53	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		9.53	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	RXRB	P28702	533 aa		9.52	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	NEUROD2	Q15784	382 aa		9.52	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	9.52	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		9.52	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	9.52	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		9.52	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	9.52	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		9.52	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		9.52	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	9.52	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		9.51	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		9.5	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	LRP6	O75581	1613 aa		9.5	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	9.5	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	PLCB2	Q00722	1185 aa		9.5	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	PHLPP1	O60346	1717 aa		9.5	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	ANP32C	O43423	234 aa		9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	PDE4C	Q08493	712 aa		9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	PDE3B	Q13370	1112 aa		9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	POLK	Q9UBT6	870 aa		9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	UTRN	P46939	3433 aa		9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	PXDN	Q92626	1479 aa		9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		9.49	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	FGD1	P98174	961 aa		9.48	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		9.48	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		9.48	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXC9	P31274	260 aa		9.48	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	SBNO1	A3KN83	1393 aa		9.47	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		9.47	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		9.47	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		9.47	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	NBPF4	Q96M43	638 aa		9.47	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	USP32	Q8NFA0	1604 aa		9.47	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		9.47	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		9.46	□□□□□ -0.89
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC184	Q52MB2	194 aa		9.46	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		9.46	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	MRS2	Q9HD23	443 aa		9.45	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		9.45	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		9.45	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNQ4	P56696	695 aa		9.45	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		9.44	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	DDB1	Q16531	1140 aa		9.44	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP2R1A	P30153	589 aa		9.44	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	AAMP	Q13685	434 aa		9.44	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		9.44	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	IP6K1	Q92551	441 aa		9.44	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP53	Q96M91	514 aa		9.44	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	ERBB3	P21860	1342 aa		9.43	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM37	O94972	964 aa		9.43	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	EYA1	Q99502	592 aa		9.43	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		9.43	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		9.43	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	EXOC5	O00471	708 aa		9.42	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	9.42	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		9.42	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		9.42	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	USP19	O94966	1318 aa		9.41	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		9.41	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	ARX	Q96QS3	562 aa		9.41	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		9.41	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		9.41	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		9.4	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	ADGRB2	O60241	1585 aa		9.4	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNQ2	O43526	872 aa		9.4	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	IL2RB	P14784	551 aa		9.4	□□□□□ -0.9
LETMD1-238	ENST00000623495	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9

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