RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613358.4

PGRMC2-208, Transcript of progesterone receptor membrane component 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC2, Length 3,783 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC2-208ENST00000613358 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.57■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 PLCH2O75038 1416 aa21.56■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 NEK4P51957 841 aa21.56■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.55■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.55■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 USP26Q9BXU7 913 aa21.55■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 ADCY5O95622 1261 aa21.55■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.54■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 VGLL3A8MV65 326 aa21.54■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.54■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 PHF14O94880 888 aa21.53■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 SPC24Q8NBT2 197 aa21.52■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.52■■□□□ 1.04
PGRMC2-208ENST00000613358 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.52■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 ERVK-7P63135 1459 aa21.51■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.039e-9■■■□□ 19.1
PGRMC2-208ENST00000613358 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.51■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.5■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.5■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 STAC3Q96MF2 364 aa21.49■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.49■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.49■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.49■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 ASXL2Q76L83 1435 aa21.49■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 REC8O95072 547 aa21.48■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 RAPGEF3O95398 923 aa21.48■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 TTC22Q5TAA0 569 aa21.48■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 CFAP44Q96MT7 982 aa21.48■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 ABCC11Q96J66 1382 aa21.48■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 ZBTB22O15209 634 aa21.48■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.48■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 TMX3Q96JJ7 454 aa21.47■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 SDSP20132 328 aa21.46■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 FANCAO15360 1455 aa21.46■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.45■■□□□ 1.03
PGRMC2-208ENST00000613358 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.44■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.44■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.43■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.43■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.43■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 MYOM1P52179 1685 aa21.43■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 USP48Q86UV5 1035 aa21.43■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 MADDQ8WXG6 1647 aa21.43■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 TSPYL6Q8N831 410 aa21.43■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 ADGRL1O94910 1474 aa21.42■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.42■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.42■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 IQGAP1P46940 1657 aa21.42■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 PLCD3Q8N3E9 789 aa21.42■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 CABP2Q9NPB3 220 aa21.42■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 PTPRTO14522 1441 aa21.41■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 NOS1P29475 1434 aa21.41■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 CD109Q6YHK3 1445 aa21.41■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 ERC2O15083 957 aa21.41■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 MLECQ14165 292 aa21.41■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.022e-7■■■□□ 15.7
PGRMC2-208ENST00000613358 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 DRC7Q8IY82 874 aa21.4■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.4■■□□□ 1.02
PGRMC2-208ENST00000613358 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.39■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 BRD1O95696 1058 aa21.39■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 KCNJ4P48050 445 aa21.39■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.39■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 UVSSAQ2YD98 709 aa21.38■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.38■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 FIBPO43427 364 aa21.38■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 HMOX1P09601 288 aa21.38■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.37■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.37■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 ZNF592Q92610 1267 aa21.37■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 MCCP23508 829 aa21.37■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 PRKAR2BP31323 418 aa21.37■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.37■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 IL16Q14005 1332 aa21.37■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.37■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.37■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PGRMC2-208ENST00000613358 IFT57Q9NWB7 429 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms