RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610893.4

LTBP4-232, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP4, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-232ENST00000610893 SOX12O15370 315 aa28.02■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 TESK2Q96S53 571 aa28.01■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.01■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 APBA3O96018 575 aa28■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.99■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 NME9Q86XW9 330 aa27.98■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.98■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 COL18A1P39060 1754 aa27.98■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.97■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 DDB1Q16531 1140 aa27.97■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.97■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.96■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.95■■■□□ 2.07
LTBP4-232ENST00000610893 NFAT5O94916 1531 aa27.94■■■□□ 2.06
LTBP4-232ENST00000610893 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
LTBP4-232ENST00000610893 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
LTBP4-232ENST00000610893 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.93■■■□□ 2.06
LTBP4-232ENST00000610893 A0A1W2PP64 1363 aa27.93■■■□□ 2.06
LTBP4-232ENST00000610893 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
LTBP4-232ENST00000610893 ABCC6O95255 1503 aa27.91■■■□□ 2.06
LTBP4-232ENST00000610893 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.91■■■□□ 2.06
LTBP4-232ENST00000610893 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.91■■■□□ 2.06
LTBP4-232ENST00000610893 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.91■■■□□ 2.06
LTBP4-232ENST00000610893 CCDC7Q96M83 1385 aa27.89■■■□□ 2.06
LTBP4-232ENST00000610893 TMF1P82094 1093 aa27.88■■■□□ 2.05
LTBP4-232ENST00000610893 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
LTBP4-232ENST00000610893 EXOC5O00471 708 aa27.87■■■□□ 2.05
LTBP4-232ENST00000610893 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.87■■■□□ 2.05
LTBP4-232ENST00000610893 USP54Q70EL1 1684 aa27.85■■■□□ 2.05
LTBP4-232ENST00000610893 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
LTBP4-232ENST00000610893 ERBB3P21860 1342 aa27.85■■■□□ 2.05
LTBP4-232ENST00000610893 USP47Q96K76 1375 aa27.85■■■□□ 2.05
LTBP4-232ENST00000610893 BCL9O00512 1426 aa27.84■■■□□ 2.05
LTBP4-232ENST00000610893 CDCA8Q53HL2 280 aa27.83■■■□□ 2.05
LTBP4-232ENST00000610893 NBPF14Q5TI25 921 aa27.83■■■□□ 2.05
LTBP4-232ENST00000610893 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
LTBP4-232ENST00000610893 PLSCR1O15162 318 aa27.82■■■□□ 2.04
LTBP4-232ENST00000610893 COG3Q96JB2 828 aa27.82■■■□□ 2.04
LTBP4-232ENST00000610893 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.82■■■□□ 2.04
LTBP4-232ENST00000610893 LRRC37A3O60309 1634 aa27.81■■■□□ 2.04
LTBP4-232ENST00000610893 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.8■■■□□ 2.04
LTBP4-232ENST00000610893 IP6K1Q92551 441 aa27.8■■■□□ 2.04
LTBP4-232ENST00000610893 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.8■■■□□ 2.04
LTBP4-232ENST00000610893 RGPD5Q99666 1765 aa27.8■■■□□ 2.04
LTBP4-232ENST00000610893 PEAK1Q9H792 1746 aa27.79■■■□□ 2.04
LTBP4-232ENST00000610893 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.79■■■□□ 2.04
LTBP4-232ENST00000610893 IL2RBP14784 551 aa27.76■■■□□ 2.03
LTBP4-232ENST00000610893 LRP5O75197 1615 aa27.76■■■□□ 2.03
LTBP4-232ENST00000610893 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.73■■■□□ 2.03
LTBP4-232ENST00000610893 FYB1O15117 783 aa27.72■■■□□ 2.03
LTBP4-232ENST00000610893 TNS2Q63HR2 1409 aa27.72■■■□□ 2.03
LTBP4-232ENST00000610893 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.71■■■□□ 2.03
LTBP4-232ENST00000610893 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.71■■■□□ 2.03
LTBP4-232ENST00000610893 RREB1Q92766 1687 aa27.71■■■□□ 2.03
LTBP4-232ENST00000610893 AMPHP49418 695 aa27.7■■■□□ 2.02
LTBP4-232ENST00000610893 LTN1O94822 1766 aa27.7■■■□□ 2.02
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LTBP4-232ENST00000610893 SBF2Q86WG5 1849 aa27.67■■■□□ 2.02
LTBP4-232ENST00000610893 PROM2Q8N271 834 aa27.67■■■□□ 2.02
LTBP4-232ENST00000610893 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
LTBP4-232ENST00000610893 FBLN1P23142 703 aa27.66■■■□□ 2.02
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LTBP4-232ENST00000610893 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.65■■■□□ 2.02
LTBP4-232ENST00000610893 KCNQ2O43526 872 aa27.64■■■□□ 2.02
LTBP4-232ENST00000610893 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
LTBP4-232ENST00000610893 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.63■■■□□ 2.01
LTBP4-232ENST00000610893 RTL1A6NKG5 1358 aa27.62■■■□□ 2.01
LTBP4-232ENST00000610893 TXNRD1Q16881 649 aa27.62■■■□□ 2.01
LTBP4-232ENST00000610893 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
LTBP4-232ENST00000610893 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.6■■■□□ 2.01
LTBP4-232ENST00000610893 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.59■■■□□ 2.01
LTBP4-232ENST00000610893 SPON1Q9HCB6 807 aa27.59■■■□□ 2.01
LTBP4-232ENST00000610893 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 STK32BQ9NY57 414 aa27.55■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.55■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.53■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 NBPF4Q96M43 638 aa27.53■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.52■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.52■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.52■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 SLC15A2Q16348 729 aa27.52■■■□□ 2
LTBP4-232ENST00000610893 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
LTBP4-232ENST00000610893 INSRP06213 1382 aa27.51■■□□□ 1.99
LTBP4-232ENST00000610893 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.51■■□□□ 1.99
LTBP4-232ENST00000610893 FLT4P35916 1363 aa27.5■■□□□ 1.99
LTBP4-232ENST00000610893 NHSQ6T4R5 1651 aa27.5■■□□□ 1.99
LTBP4-232ENST00000610893 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.49■■□□□ 1.99
LTBP4-232ENST00000610893 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
LTBP4-232ENST00000610893 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
LTBP4-232ENST00000610893 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
LTBP4-232ENST00000610893 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
LTBP4-232ENST00000610893 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.44■■□□□ 1.98
LTBP4-232ENST00000610893 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.44■■□□□ 1.98
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