RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
MBD3-211ENST00000592965 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa32.87■■■□□ 2.85
MBD3-211ENST00000592965 AXIN2Q9Y2T1 843 aa32.87■■■□□ 2.85
MBD3-211ENST00000592965 WDR17Q8IZU2 1322 aa32.86■■■□□ 2.85
MBD3-211ENST00000592965 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa32.86■■■□□ 2.85
MBD3-211ENST00000592965 A0A1W2PP64 1363 aa32.85■■■□□ 2.85
MBD3-211ENST00000592965 NINLQ9Y2I6 1382 aa32.85■■■□□ 2.85
MBD3-211ENST00000592965 LRRC37A3O60309 1634 aa32.85■■■□□ 2.85
MBD3-211ENST00000592965 SLC24A1O60721 1099 aa32.85■■■□□ 2.85
MBD3-211ENST00000592965 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.85■■■□□ 2.85
MBD3-211ENST00000592965 TERF2IPQ9NYB0 399 aa32.85■■■□□ 2.85
MBD3-211ENST00000592965 SOX12O15370 315 aa32.84■■■□□ 2.85
MBD3-211ENST00000592965 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
MBD3-211ENST00000592965 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa32.82■■■□□ 2.84
MBD3-211ENST00000592965 NME9Q86XW9 330 aa32.82■■■□□ 2.84
MBD3-211ENST00000592965 TRIM37O94972 964 aa32.81■■■□□ 2.84
MBD3-211ENST00000592965 LTN1O94822 1766 aa32.81■■■□□ 2.84
MBD3-211ENST00000592965 PEAK1Q9H792 1746 aa32.8■■■□□ 2.84
MBD3-211ENST00000592965 USP47Q96K76 1375 aa32.78■■■□□ 2.84
MBD3-211ENST00000592965 PARD3Q8TEW0 1356 aa32.77■■■□□ 2.84
MBD3-211ENST00000592965 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa32.77■■■□□ 2.84
MBD3-211ENST00000592965 OVOS2Q6IE36 1432 aa32.77■■■□□ 2.84
MBD3-211ENST00000592965 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP32.76■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.76■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 CARD10Q9BWT7 1032 aa32.75■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa32.75■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 RREB1Q92766 1687 aa32.73■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 SBF2Q86WG5 1849 aa32.73■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa32.73■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 CAMKK2Q96RR4 588 aa32.73■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.73■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 DDB1Q16531 1140 aa32.72■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 LRP5O75197 1615 aa32.71■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 APBA3O96018 575 aa32.71■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 CCDC7Q96M83 1385 aa32.7■■■□□ 2.83
MBD3-211ENST00000592965 ERBB3P21860 1342 aa32.68■■■□□ 2.82
MBD3-211ENST00000592965 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa32.68■■■□□ 2.82
MBD3-211ENST00000592965 TMF1P82094 1093 aa32.67■■■□□ 2.82
MBD3-211ENST00000592965 NUP188Q5SRE5 1749 aa32.66■■■□□ 2.82
MBD3-211ENST00000592965 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
MBD3-211ENST00000592965 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
MBD3-211ENST00000592965 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa32.65■■■□□ 2.82
MBD3-211ENST00000592965 BCL9O00512 1426 aa32.65■■■□□ 2.82
MBD3-211ENST00000592965 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.63■■■□□ 2.81
MBD3-211ENST00000592965 TNS2Q63HR2 1409 aa32.61■■■□□ 2.81
MBD3-211ENST00000592965 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
MBD3-211ENST00000592965 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
MBD3-211ENST00000592965 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
MBD3-211ENST00000592965 CDCA8Q53HL2 280 aa32.59■■■□□ 2.81
MBD3-211ENST00000592965 COG3Q96JB2 828 aa32.58■■■□□ 2.81
MBD3-211ENST00000592965 ANKRD24Q8TF21 1146 aa32.57■■■□□ 2.8
MBD3-211ENST00000592965 NLRP2Q9NX02 1062 aa32.57■■■□□ 2.8
MBD3-211ENST00000592965 EXOC5O00471 708 aa32.55■■■□□ 2.8
MBD3-211ENST00000592965 IP6K1Q92551 441 aa32.55■■■□□ 2.8
MBD3-211ENST00000592965 MYOM1P52179 1685 aa32.55■■■□□ 2.8
MBD3-211ENST00000592965 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
MBD3-211ENST00000592965 KIF20BQ96Q89 1820 aa32.53■■■□□ 2.8
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MBD3-211ENST00000592965 MAP3K19Q56UN5 1328 aa32.51■■■□□ 2.79
MBD3-211ENST00000592965 IL2RBP14784 551 aa32.5■■■□□ 2.79
MBD3-211ENST00000592965 NHSQ6T4R5 1651 aa32.48■■■□□ 2.79
MBD3-211ENST00000592965 FYB1O15117 783 aa32.48■■■□□ 2.79
MBD3-211ENST00000592965 PTF1AQ7RTS3 328 aa32.48■■■□□ 2.79
MBD3-211ENST00000592965 RTL1A6NKG5 1358 aa32.47■■■□□ 2.79
MBD3-211ENST00000592965 NBPF14Q5TI25 921 aa32.47■■■□□ 2.79
MBD3-211ENST00000592965 HOXC9P31274 260 aa32.45■■■□□ 2.79
MBD3-211ENST00000592965 AMPHP49418 695 aa32.43■■■□□ 2.78
MBD3-211ENST00000592965 GGNBP2Q9H3C7 697 aa32.43■■■□□ 2.78
MBD3-211ENST00000592965 RGPD2P0DJD1 1756 aa32.42■■■□□ 2.78
MBD3-211ENST00000592965 FBLN1P23142 703 aa32.42■■■□□ 2.78
MBD3-211ENST00000592965 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
MBD3-211ENST00000592965 NSD3Q9BZ95 1437 aa32.38■■■□□ 2.77
MBD3-211ENST00000592965 KAT6BQ8WYB5 2073 aa32.38■■■□□ 2.77
MBD3-211ENST00000592965 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
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MBD3-211ENST00000592965 KCNQ2O43526 872 aa32.35■■■□□ 2.77
MBD3-211ENST00000592965 PROM2Q8N271 834 aa32.35■■■□□ 2.77
MBD3-211ENST00000592965 BTAF1O14981 1849 aa32.35■■■□□ 2.77
MBD3-211ENST00000592965 KIF24Q5T7B8 1368 aa32.34■■■□□ 2.77
MBD3-211ENST00000592965 SHANK3Q9BYB0 1731 aa32.33■■■□□ 2.77
MBD3-211ENST00000592965 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
MBD3-211ENST00000592965 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
MBD3-211ENST00000592965 TXNRD1Q16881 649 aa32.31■■■□□ 2.76
MBD3-211ENST00000592965 ACSBG1Q96GR2 724 aa32.31■■■□□ 2.76
MBD3-211ENST00000592965 FLT4P35916 1363 aa32.31■■■□□ 2.76
MBD3-211ENST00000592965 CASZ1Q86V15 1759 aa32.3■■■□□ 2.76
MBD3-211ENST00000592965 MEGF6O75095 1541 aa32.3■■■□□ 2.76
MBD3-211ENST00000592965 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa32.29■■■□□ 2.76
MBD3-211ENST00000592965 INSRP06213 1382 aa32.29■■■□□ 2.76
MBD3-211ENST00000592965 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.28■■■□□ 2.76
MBD3-211ENST00000592965 NBPF6Q5VWK0 638 aa32.26■■■□□ 2.75
MBD3-211ENST00000592965 NBPF4Q96M43 638 aa32.26■■■□□ 2.75
MBD3-211ENST00000592965 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
MBD3-211ENST00000592965 CGNL1Q0VF96 1302 aa32.25■■■□□ 2.75
MBD3-211ENST00000592965 DOT1LQ8TEK3 1739 aa32.24■■■□□ 2.75
MBD3-211ENST00000592965 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
MBD3-211ENST00000592965 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa32.24■■■□□ 2.75
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