RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589235.5

CIRBP-222, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,073 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-222	ENST00000589235	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	29.91	■■■□□ 2.38
CIRBP-222	ENST00000589235	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		29.9	■■■□□ 2.38
CIRBP-222	ENST00000589235	DISP2	A7MBM2	1401 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CIRBP-222	ENST00000589235	APBA3	O96018	575 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CIRBP-222	ENST00000589235	TESK2	Q96S53	571 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CIRBP-222	ENST00000589235	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CIRBP-222	ENST00000589235	DDB1	Q16531	1140 aa		29.88	■■■□□ 2.37
CIRBP-222	ENST00000589235	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	29.88	■■■□□ 2.37
CIRBP-222	ENST00000589235	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-222	ENST00000589235	NME9	Q86XW9	330 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-222	ENST00000589235	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CIRBP-222	ENST00000589235	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		29.86	■■■□□ 2.37
CIRBP-222	ENST00000589235	TMF1	P82094	1093 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CIRBP-222	ENST00000589235		A0A1W2PP64	1363 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CIRBP-222	ENST00000589235	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		29.83	■■■□□ 2.37
CIRBP-222	ENST00000589235	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		29.83	■■■□□ 2.37
CIRBP-222	ENST00000589235	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
CIRBP-222	ENST00000589235	COL18A1	P39060	1754 aa		29.82	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	NFAT5	O94916	1531 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	ABCC6	O95255	1503 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	CDCA8	Q53HL2	280 aa		29.8	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	USP47	Q96K76	1375 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	CCDC7	Q96M83	1385 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	EXOC5	O00471	708 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.36
CIRBP-222	ENST00000589235	COG3	Q96JB2	828 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CIRBP-222	ENST00000589235	NBPF14	Q5TI25	921 aa		29.74	■■■□□ 2.35
CIRBP-222	ENST00000589235	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		29.74	■■■□□ 2.35
CIRBP-222	ENST00000589235	USP54	Q70EL1	1684 aa		29.74	■■■□□ 2.35
CIRBP-222	ENST00000589235	ERBB3	P21860	1342 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-222	ENST00000589235	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-222	ENST00000589235	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-222	ENST00000589235	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		29.71	■■■□□ 2.35
CIRBP-222	ENST00000589235	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	29.69	■■■□□ 2.34
CIRBP-222	ENST00000589235	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	29.69	■■■□□ 2.34
CIRBP-222	ENST00000589235	LRRC37A3	O60309	1634 aa		29.69	■■■□□ 2.34
CIRBP-222	ENST00000589235	IP6K1	Q92551	441 aa		29.68	■■■□□ 2.34
CIRBP-222	ENST00000589235	RGPD5	Q99666	1765 aa		29.67	■■■□□ 2.34
CIRBP-222	ENST00000589235	BCL9	O00512	1426 aa		29.66	■■■□□ 2.34
CIRBP-222	ENST00000589235	PLSCR1	O15162	318 aa		29.66	■■■□□ 2.34
CIRBP-222	ENST00000589235	IL2RB	P14784	551 aa		29.65	■■■□□ 2.34
CIRBP-222	ENST00000589235	AMPH	P49418	695 aa		29.63	■■■□□ 2.33
CIRBP-222	ENST00000589235	PEAK1	Q9H792	1746 aa		29.62	■■■□□ 2.33
CIRBP-222	ENST00000589235	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		29.61	■■■□□ 2.33
CIRBP-222	ENST00000589235	LTN1	O94822	1766 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CIRBP-222	ENST00000589235	TNS2	Q63HR2	1409 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CIRBP-222	ENST00000589235	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	29.59	■■■□□ 2.33
CIRBP-222	ENST00000589235	LRP5	O75197	1615 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CIRBP-222	ENST00000589235	FYB1	O15117	783 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CIRBP-222	ENST00000589235	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		29.58	■■■□□ 2.33
CIRBP-222	ENST00000589235	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	29.58	■■■□□ 2.33
CIRBP-222	ENST00000589235	HOXC9	P31274	260 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CIRBP-222	ENST00000589235	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CIRBP-222	ENST00000589235	RREB1	Q92766	1687 aa		29.55	■■■□□ 2.32
CIRBP-222	ENST00000589235	RTL1	A6NKG5	1358 aa		29.52	■■■□□ 2.32
CIRBP-222	ENST00000589235	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		29.51	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	FBLN1	P23142	703 aa		29.5	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	SBF2	Q86WG5	1849 aa		29.5	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		29.49	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	29.49	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		29.49	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	29.49	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		29.49	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	29.47	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	29.47	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	KCNQ2	O43526	872 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	TXNRD1	Q16881	649 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	29.46	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	29.46	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		29.45	■■■□□ 2.31
CIRBP-222	ENST00000589235	PROM2	Q8N271	834 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CIRBP-222	ENST00000589235	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CIRBP-222	ENST00000589235	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CIRBP-222	ENST00000589235	SPON1	Q9HCB6	807 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CIRBP-222	ENST00000589235	STK32B	Q9NY57	414 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CIRBP-222	ENST00000589235	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CIRBP-222	ENST00000589235	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	29.41	■■■□□ 2.3
CIRBP-222	ENST00000589235	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		29.41	■■■□□ 2.3
CIRBP-222	ENST00000589235	INSR	P06213	1382 aa		29.39	■■■□□ 2.3
CIRBP-222	ENST00000589235	FLT4	P35916	1363 aa		29.39	■■■□□ 2.3
CIRBP-222	ENST00000589235	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		29.39	■■■□□ 2.3
CIRBP-222	ENST00000589235	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		29.38	■■■□□ 2.29
CIRBP-222	ENST00000589235	NBPF4	Q96M43	638 aa		29.38	■■■□□ 2.29
CIRBP-222	ENST00000589235	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	29.38	■■■□□ 2.29
CIRBP-222	ENST00000589235	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	29.38	■■■□□ 2.29
CIRBP-222	ENST00000589235	NHS	Q6T4R5	1651 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-222	ENST00000589235	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-222	ENST00000589235	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
CIRBP-222	ENST00000589235	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		29.36	■■■□□ 2.29
CIRBP-222	ENST00000589235	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	29.35	■■■□□ 2.29
CIRBP-222	ENST00000589235	SLC15A2	Q16348	729 aa		29.35	■■■□□ 2.29
CIRBP-222	ENST00000589235	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29

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