RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574899.1

PHF23-211, Transcript of PHD finger protein 23, human

TSL 3

Gene PHF23, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF23-211	ENST00000574899	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PHF23-211	ENST00000574899	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PHF23-211	ENST00000574899	LTN1	O94822	1766 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PHF23-211	ENST00000574899	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PHF23-211	ENST00000574899	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
PHF23-211	ENST00000574899	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PHF23-211	ENST00000574899	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PHF23-211	ENST00000574899	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PHF23-211	ENST00000574899	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PHF23-211	ENST00000574899	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PHF23-211	ENST00000574899	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PHF23-211	ENST00000574899	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PHF23-211	ENST00000574899	BAG6	P46379	1132 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PHF23-211	ENST00000574899	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PHF23-211	ENST00000574899	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PHF23-211	ENST00000574899	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PHF23-211	ENST00000574899	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		32.7	■■■□□ 2.82
PHF23-211	ENST00000574899	ABCC6	O95255	1503 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PHF23-211	ENST00000574899	TRIM37	O94972	964 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PHF23-211	ENST00000574899	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PHF23-211	ENST00000574899	PEAK1	Q9H792	1746 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PHF23-211	ENST00000574899	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PHF23-211	ENST00000574899	TMF1	P82094	1093 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PHF23-211	ENST00000574899	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PHF23-211	ENST00000574899	SLC24A1	O60721	1099 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PHF23-211	ENST00000574899	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PHF23-211	ENST00000574899	MYOM1	P52179	1685 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PHF23-211	ENST00000574899	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PHF23-211	ENST00000574899	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PHF23-211	ENST00000574899	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
PHF23-211	ENST00000574899	DDB1	Q16531	1140 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	ERBB3	P21860	1342 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	APBA3	O96018	575 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	FBLN1	P23142	703 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	RREB1	Q92766	1687 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.51	■■■□□ 2.8
PHF23-211	ENST00000574899	COG3	Q96JB2	828 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	FYB1	O15117	783 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	IP6K1	Q92551	441 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	CDCA8	Q53HL2	280 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
PHF23-211	ENST00000574899	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
PHF23-211	ENST00000574899	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PHF23-211	ENST00000574899	EXOC5	O00471	708 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PHF23-211	ENST00000574899	HOXC9	P31274	260 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PHF23-211	ENST00000574899	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
PHF23-211	ENST00000574899	BCL9	O00512	1426 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PHF23-211	ENST00000574899	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
PHF23-211	ENST00000574899	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PHF23-211	ENST00000574899	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PHF23-211	ENST00000574899	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PHF23-211	ENST00000574899	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PHF23-211	ENST00000574899	LRP5	O75197	1615 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PHF23-211	ENST00000574899	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PHF23-211	ENST00000574899	IL2RB	P14784	551 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PHF23-211	ENST00000574899	AMPH	P49418	695 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PHF23-211	ENST00000574899	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PHF23-211	ENST00000574899	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PHF23-211	ENST00000574899	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.33	■■■□□ 2.77	9e-6	■□□□□ 10.1
PHF23-211	ENST00000574899	RTL1	A6NKG5	1358 aa		32.32	■■■□□ 2.77
PHF23-211	ENST00000574899	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PHF23-211	ENST00000574899	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PHF23-211	ENST00000574899	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PHF23-211	ENST00000574899	KCNQ2	O43526	872 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PHF23-211	ENST00000574899	PLSCR1	O15162	318 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PHF23-211	ENST00000574899	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PHF23-211	ENST00000574899	PROM2	Q8N271	834 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PHF23-211	ENST00000574899	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.76
PHF23-211	ENST00000574899	BTAF1	O14981	1849 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	MEGF6	O75095	1541 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	INSR	P06213	1382 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	FLT4	P35916	1363 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
PHF23-211	ENST00000574899	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PHF23-211	ENST00000574899	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		32.18	■■■□□ 2.74

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