RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-207ENST00000572043 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-207ENST00000572043 NFAT5O94916 1531 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRB1P82279 1406 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDCA8Q53HL2 280 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-207ENST00000572043 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDE3BQ13370 1112 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-207ENST00000572043 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1-207ENST00000572043 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-207ENST00000572043 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL18A1P39060 1754 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-207ENST00000572043 COG3Q96JB2 828 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-207ENST00000572043 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 FBLN1P23142 703 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRIM37O94972 964 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 BAG6P46379 1132 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP54Q70EL1 1684 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 FYB1O15117 783 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 EP400Q96L91 3159 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-207ENST00000572043 ERBB3P21860 1342 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDB1Q16531 1140 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.68■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCC6O95255 1503 aa24.68■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.68■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 AMPHP49418 695 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 IP6K1Q92551 441 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGPD5Q99666 1765 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC7Q96M83 1385 aa24.66■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 APBA3O96018 575 aa24.65■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
CTDNEP1-207ENST00000572043 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYOM1P52179 1685 aa24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 LTN1O94822 1766 aa24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 HOXC9P31274 260 aa24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRRC37A3O60309 1634 aa24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 DISP2A7MBM2 1401 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 EXOC5O00471 708 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 IL2RBP14784 551 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNS2Q63HR2 1409 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 PANK3Q9H999 370 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 RTL1A6NKG5 1358 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 PEAK1Q9H792 1746 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-207ENST00000572043 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 FLT4P35916 1363 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF4Q96M43 638 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 INSRP06213 1382 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNQ2O43526 872 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCL9O00512 1426 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1-207ENST00000572043 MEGF6O75095 1541 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLKQ9UBT6 870 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLSCR1O15162 318 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF14Q5TI25 921 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-207ENST00000572043 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-207ENST00000572043 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDNEP1-207ENST00000572043 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-207ENST00000572043 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-207ENST00000572043 MORC1Q86VD1 984 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-207ENST00000572043 SBF2Q86WG5 1849 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-207ENST00000572043 PROM2Q8N271 834 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-207ENST00000572043 RREB1Q92766 1687 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms