RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570280.5

RHOT2-226, Transcript of ras homolog family member T2, human

TSL 3

Gene RHOT2, Length 708 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOT2-226	ENST00000570280	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		29.73	■■■□□ 2.35
RHOT2-226	ENST00000570280	DDB1	Q16531	1140 aa		29.73	■■■□□ 2.35
RHOT2-226	ENST00000570280	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		29.73	■■■□□ 2.35
RHOT2-226	ENST00000570280	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		29.73	■■■□□ 2.35
RHOT2-226	ENST00000570280	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		29.72	■■■□□ 2.35
RHOT2-226	ENST00000570280	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	29.7	■■■□□ 2.35
RHOT2-226	ENST00000570280	PLSCR1	O15162	318 aa		29.7	■■■□□ 2.35
RHOT2-226	ENST00000570280	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		29.69	■■■□□ 2.34
RHOT2-226	ENST00000570280	BCL9	O00512	1426 aa		29.69	■■■□□ 2.34
RHOT2-226	ENST00000570280	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		29.69	■■■□□ 2.34
RHOT2-226	ENST00000570280	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	29.67	■■■□□ 2.34
RHOT2-226	ENST00000570280	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	29.67	■■■□□ 2.34
RHOT2-226	ENST00000570280	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	29.67	■■■□□ 2.34
RHOT2-226	ENST00000570280	NFAT5	O94916	1531 aa		29.66	■■■□□ 2.34
RHOT2-226	ENST00000570280	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		29.66	■■■□□ 2.34
RHOT2-226	ENST00000570280	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		29.66	■■■□□ 2.34
RHOT2-226	ENST00000570280	RGPD5	Q99666	1765 aa		29.66	■■■□□ 2.34
RHOT2-226	ENST00000570280	SPON1	Q9HCB6	807 aa		29.64	■■■□□ 2.34
RHOT2-226	ENST00000570280	KCNQ2	O43526	872 aa		29.63	■■■□□ 2.33
RHOT2-226	ENST00000570280	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	29.62	■■■□□ 2.33
RHOT2-226	ENST00000570280	ABCC6	O95255	1503 aa		29.61	■■■□□ 2.33
RHOT2-226	ENST00000570280	SOX12	O15370	315 aa		29.61	■■■□□ 2.33
RHOT2-226	ENST00000570280	NEUROD1	Q13562	356 aa		29.61	■■■□□ 2.33
RHOT2-226	ENST00000570280	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	29.61	■■■□□ 2.33
RHOT2-226	ENST00000570280	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		29.6	■■■□□ 2.33
RHOT2-226	ENST00000570280	PROM2	Q8N271	834 aa		29.6	■■■□□ 2.33
RHOT2-226	ENST00000570280	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		29.6	■■■□□ 2.33
RHOT2-226	ENST00000570280	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		29.58	■■■□□ 2.33
RHOT2-226	ENST00000570280	CASZ1	Q86V15	1759 aa		29.57	■■■□□ 2.32
RHOT2-226	ENST00000570280	USP31	Q70CQ4	1352 aa		29.57	■■■□□ 2.32
RHOT2-226	ENST00000570280	USP54	Q70EL1	1684 aa		29.56	■■■□□ 2.32
RHOT2-226	ENST00000570280	CCDC7	Q96M83	1385 aa		29.56	■■■□□ 2.32
RHOT2-226	ENST00000570280	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		29.55	■■■□□ 2.32
RHOT2-226	ENST00000570280	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		29.54	■■■□□ 2.32
RHOT2-226	ENST00000570280	EXOC5	O00471	708 aa		29.54	■■■□□ 2.32
RHOT2-226	ENST00000570280	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	29.54	■■■□□ 2.32
RHOT2-226	ENST00000570280	TNS2	Q63HR2	1409 aa		29.53	■■■□□ 2.32
RHOT2-226	ENST00000570280	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	29.51	■■■□□ 2.31
RHOT2-226	ENST00000570280	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	29.5	■■■□□ 2.31
RHOT2-226	ENST00000570280	TXNRD1	Q16881	649 aa		29.49	■■■□□ 2.31
RHOT2-226	ENST00000570280	ERBB3	P21860	1342 aa		29.48	■■■□□ 2.31
RHOT2-226	ENST00000570280	NME9	Q86XW9	330 aa		29.48	■■■□□ 2.31
RHOT2-226	ENST00000570280	YY1	P25490	414 aa		29.46	■■■□□ 2.31
RHOT2-226	ENST00000570280	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		29.46	■■■□□ 2.31
RHOT2-226	ENST00000570280	NHS	Q6T4R5	1651 aa		29.45	■■■□□ 2.31
RHOT2-226	ENST00000570280	LTN1	O94822	1766 aa		29.44	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		29.43	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	ZBTB7A	O95365	584 aa		29.42	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	PTGER2	P43116	358 aa		29.42	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	SLC15A2	Q16348	729 aa		29.42	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	STK32B	Q9NY57	414 aa		29.42	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	29.42	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	29.41	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	TMC1	Q8TDI8	760 aa		29.41	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		29.41	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	IL2RB	P14784	551 aa		29.39	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		29.39	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	29.39	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280	MYOM1	P52179	1685 aa		29.39	■■■□□ 2.3
RHOT2-226	ENST00000570280		A0A1W2PP64	1363 aa		29.38	■■■□□ 2.29
RHOT2-226	ENST00000570280	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		29.37	■■■□□ 2.29
RHOT2-226	ENST00000570280	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		29.37	■■■□□ 2.29
RHOT2-226	ENST00000570280	PAPPA	Q13219	1627 aa		29.35	■■■□□ 2.29
RHOT2-226	ENST00000570280	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		29.35	■■■□□ 2.29
RHOT2-226	ENST00000570280	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	29.35	■■■□□ 2.29
RHOT2-226	ENST00000570280	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		29.33	■■■□□ 2.29
RHOT2-226	ENST00000570280	UTRN	P46939	3433 aa		29.33	■■■□□ 2.29
RHOT2-226	ENST00000570280	BTAF1	O14981	1849 aa		29.32	■■■□□ 2.28
RHOT2-226	ENST00000570280	MTFR1L	Q9H019	292 aa		29.32	■■■□□ 2.28
RHOT2-226	ENST00000570280	IP6K1	Q92551	441 aa		29.31	■■■□□ 2.28
RHOT2-226	ENST00000570280	TONSL	Q96HA7	1378 aa		29.29	■■■□□ 2.28
RHOT2-226	ENST00000570280	TESK2	Q96S53	571 aa		29.29	■■■□□ 2.28
RHOT2-226	ENST00000570280	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
RHOT2-226	ENST00000570280	SYT17	Q9BSW7	474 aa		29.26	■■■□□ 2.27
RHOT2-226	ENST00000570280	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	29.26	■■■□□ 2.27
RHOT2-226	ENST00000570280	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		29.26	■■■□□ 2.27
RHOT2-226	ENST00000570280	ZNF827	Q17R98	1081 aa		29.24	■■■□□ 2.27
RHOT2-226	ENST00000570280	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		29.21	■■■□□ 2.27
RHOT2-226	ENST00000570280	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		29.2	■■■□□ 2.27
RHOT2-226	ENST00000570280	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		29.2	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	AKT1S1	Q96B36	256 aa		29.19	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	COG3	Q96JB2	828 aa		29.19	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	MAP3K5	Q99683	1374 aa		29.18	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	HOXC9	P31274	260 aa		29.18	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		29.18	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	ARX	Q96QS3	562 aa		29.18	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	SLC24A1	O60721	1099 aa		29.16	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	FBLN1	P23142	703 aa		29.16	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		29.16	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		29.14	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		29.14	■■■□□ 2.26
RHOT2-226	ENST00000570280	NSD2	O96028	1365 aa		29.13	■■■□□ 2.25
RHOT2-226	ENST00000570280	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		29.13	■■■□□ 2.25
RHOT2-226	ENST00000570280	AMPH	P49418	695 aa		29.13	■■■□□ 2.25
RHOT2-226	ENST00000570280	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
RHOT2-226	ENST00000570280	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		29.12	■■■□□ 2.25
RHOT2-226	ENST00000570280	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		29.11	■■■□□ 2.25
RHOT2-226	ENST00000570280	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.11	■■■□□ 2.25

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