RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 PDE3BQ13370 1112 aa32.07■■■□□ 2.72
PPP4C-212ENST00000567828 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
PPP4C-212ENST00000567828 A0A1W2PP64 1363 aa32.07■■■□□ 2.72
PPP4C-212ENST00000567828 FAM196AQ6ZSG2 479 aa32.06■■■□□ 2.72
PPP4C-212ENST00000567828 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
PPP4C-212ENST00000567828 NME9Q86XW9 330 aa32.05■■■□□ 2.72
PPP4C-212ENST00000567828 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
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PPP4C-212ENST00000567828 DISP2A7MBM2 1401 aa32.04■■■□□ 2.72
PPP4C-212ENST00000567828 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa32.04■■■□□ 2.72
PPP4C-212ENST00000567828 WDR17Q8IZU2 1322 aa32.03■■■□□ 2.72
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PPP4C-212ENST00000567828 OVOS2Q6IE36 1432 aa31.95■■■□□ 2.71
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PPP4C-212ENST00000567828 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa31.92■■■□□ 2.7
PPP4C-212ENST00000567828 NUP188Q5SRE5 1749 aa31.92■■■□□ 2.7
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PPP4C-212ENST00000567828 SLC24A1O60721 1099 aa31.92■■■□□ 2.7
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PPP4C-212ENST00000567828 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa31.86■■■□□ 2.69
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PPP4C-212ENST00000567828 MYOM1P52179 1685 aa31.86■■■□□ 2.69
PPP4C-212ENST00000567828 PARD3Q8TEW0 1356 aa31.85■■■□□ 2.69
PPP4C-212ENST00000567828 ERBB3P21860 1342 aa31.85■■■□□ 2.69
PPP4C-212ENST00000567828 KIF20BQ96Q89 1820 aa31.85■■■□□ 2.69
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PPP4C-212ENST00000567828 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
PPP4C-212ENST00000567828 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
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PPP4C-212ENST00000567828 NLRP2Q9NX02 1062 aa31.8■■■□□ 2.68
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PPP4C-212ENST00000567828 TNS2Q63HR2 1409 aa31.79■■■□□ 2.68
PPP4C-212ENST00000567828 COG3Q96JB2 828 aa31.79■■■□□ 2.68
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PPP4C-212ENST00000567828 MAP3K19Q56UN5 1328 aa31.72■■■□□ 2.67
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PPP4C-212ENST00000567828 PLSCR1O15162 318 aa31.66■■■□□ 2.66
PPP4C-212ENST00000567828 AMPHP49418 695 aa31.66■■■□□ 2.66
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PPP4C-212ENST00000567828 RTL1A6NKG5 1358 aa31.63■■■□□ 2.65
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PPP4C-212ENST00000567828 CARD14Q9BXL6 1004 aa31.6■■■□□ 2.65
PPP4C-212ENST00000567828 ACSBG1Q96GR2 724 aa31.59■■■□□ 2.65
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PPP4C-212ENST00000567828 DOT1LQ8TEK3 1739 aa31.55■■■□□ 2.64
PPP4C-212ENST00000567828 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.54■■■□□ 2.64
PPP4C-212ENST00000567828 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa31.54■■■□□ 2.64
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PPP4C-212ENST00000567828 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
PPP4C-212ENST00000567828 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.51■■■□□ 2.63
PPP4C-212ENST00000567828 TXNRD1Q16881 649 aa31.5■■■□□ 2.63
PPP4C-212ENST00000567828 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
PPP4C-212ENST00000567828 FLT4P35916 1363 aa31.49■■■□□ 2.63
PPP4C-212ENST00000567828 USHBP1Q8N6Y0 703 aa31.49■■■□□ 2.63
PPP4C-212ENST00000567828 INSRP06213 1382 aa31.48■■■□□ 2.63
PPP4C-212ENST00000567828 NBPF6Q5VWK0 638 aa31.48■■■□□ 2.63
PPP4C-212ENST00000567828 NBPF4Q96M43 638 aa31.48■■■□□ 2.63
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