RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
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SPNS1-209ENST00000567771 CAMKK2Q96RR4 588 aa35.99■■■■□ 3.35
SPNS1-209ENST00000567771 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
SPNS1-209ENST00000567771 NME9Q86XW9 330 aa35.98■■■■□ 3.35
SPNS1-209ENST00000567771 USP31Q70CQ4 1352 aa35.98■■■■□ 3.35
SPNS1-209ENST00000567771 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.96■■■■□ 3.35
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SPNS1-209ENST00000567771 RGPD5Q99666 1765 aa35.94■■■■□ 3.34
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SPNS1-209ENST00000567771 A0A1W2PP64 1363 aa35.91■■■■□ 3.34
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SPNS1-209ENST00000567771 USP54Q70EL1 1684 aa35.89■■■■□ 3.34
SPNS1-209ENST00000567771 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
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SPNS1-209ENST00000567771 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.87■■■■□ 3.33
SPNS1-209ENST00000567771 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
SPNS1-209ENST00000567771 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
SPNS1-209ENST00000567771 ABCC6O95255 1503 aa35.86■■■■□ 3.33
SPNS1-209ENST00000567771 PEAK1Q9H792 1746 aa35.86■■■■□ 3.33
SPNS1-209ENST00000567771 WNK3Q9BYP7 1800 aa35.85■■■■□ 3.33
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SPNS1-209ENST00000567771 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
SPNS1-209ENST00000567771 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.8■■■■□ 3.32
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SPNS1-209ENST00000567771 ERBB3P21860 1342 aa35.78■■■■□ 3.32
SPNS1-209ENST00000567771 USP47Q96K76 1375 aa35.76■■■■□ 3.32
SPNS1-209ENST00000567771 LTN1O94822 1766 aa35.76■■■■□ 3.32
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SPNS1-209ENST00000567771 SBF2Q86WG5 1849 aa35.74■■■■□ 3.31
SPNS1-209ENST00000567771 PTF1AQ7RTS3 328 aa35.74■■■■□ 3.31
SPNS1-209ENST00000567771 NLRP2Q9NX02 1062 aa35.74■■■■□ 3.31
SPNS1-209ENST00000567771 NUP188Q5SRE5 1749 aa35.74■■■■□ 3.31
SPNS1-209ENST00000567771 TMF1P82094 1093 aa35.72■■■■□ 3.31
SPNS1-209ENST00000567771 ANKRD24Q8TF21 1146 aa35.72■■■■□ 3.31
SPNS1-209ENST00000567771 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
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SPNS1-209ENST00000567771 NBPF14Q5TI25 921 aa35.7■■■■□ 3.31
SPNS1-209ENST00000567771 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.69■■■■□ 3.3
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SPNS1-209ENST00000567771 TNS2Q63HR2 1409 aa35.66■■■■□ 3.3
SPNS1-209ENST00000567771 IP6K1Q92551 441 aa35.66■■■■□ 3.3
SPNS1-209ENST00000567771 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.66■■■■□ 3.3
SPNS1-209ENST00000567771 IL2RBP14784 551 aa35.64■■■■□ 3.3
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SPNS1-209ENST00000567771 CDCA8Q53HL2 280 aa35.57■■■■□ 3.28
SPNS1-209ENST00000567771 HOXC9P31274 260 aa35.56■■■■□ 3.28
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SPNS1-209ENST00000567771 KAT6BQ8WYB5 2073 aa35.34■■■■□ 3.25
SPNS1-209ENST00000567771 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
SPNS1-209ENST00000567771 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
SPNS1-209ENST00000567771 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
SPNS1-209ENST00000567771 INSRP06213 1382 aa35.32■■■■□ 3.24
SPNS1-209ENST00000567771 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
SPNS1-209ENST00000567771 FLT4P35916 1363 aa35.3■■■■□ 3.24
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