RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566749.5

PPP4C-209, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,490 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-209	ENST00000566749	USP35	Q9P2H5	1018 aa		34.11	■■■■□ 3.05
PPP4C-209	ENST00000566749	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		34.1	■■■■□ 3.05
PPP4C-209	ENST00000566749	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	34.09	■■■■□ 3.05
PPP4C-209	ENST00000566749	FYB1	O15117	783 aa		34.09	■■■■□ 3.05
PPP4C-209	ENST00000566749	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		34.08	■■■■□ 3.05
PPP4C-209	ENST00000566749	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		34.08	■■■■□ 3.05
PPP4C-209	ENST00000566749	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		34.07	■■■■□ 3.04
PPP4C-209	ENST00000566749	LTN1	O94822	1766 aa		34.07	■■■■□ 3.04
PPP4C-209	ENST00000566749	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	34.07	■■■■□ 3.04
PPP4C-209	ENST00000566749	RGPD5	Q99666	1765 aa		34.06	■■■■□ 3.04
PPP4C-209	ENST00000566749	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		34.06	■■■■□ 3.04
PPP4C-209	ENST00000566749	ABCC6	O95255	1503 aa		34.03	■■■■□ 3.04
PPP4C-209	ENST00000566749	CRB1	P82279	1406 aa		34.03	■■■■□ 3.04
PPP4C-209	ENST00000566749	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		34.02	■■■■□ 3.04
PPP4C-209	ENST00000566749	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		34.01	■■■■□ 3.04
PPP4C-209	ENST00000566749	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		34.01	■■■■□ 3.03
PPP4C-209	ENST00000566749	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		34.01	■■■■□ 3.03
PPP4C-209	ENST00000566749	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		34	■■■■□ 3.03
PPP4C-209	ENST00000566749	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PPP4C-209	ENST00000566749	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PPP4C-209	ENST00000566749	PANK3	Q9H999	370 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PPP4C-209	ENST00000566749	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.99	■■■■□ 3.03
PPP4C-209	ENST00000566749	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PPP4C-209	ENST00000566749	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PPP4C-209	ENST00000566749	FBLN1	P23142	703 aa		33.97	■■■■□ 3.03
PPP4C-209	ENST00000566749	EP400	Q96L91	3159 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PPP4C-209	ENST00000566749	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PPP4C-209	ENST00000566749	IP6K1	Q92551	441 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PPP4C-209	ENST00000566749	AMPH	P49418	695 aa		33.92	■■■■□ 3.02
PPP4C-209	ENST00000566749	ERBB3	P21860	1342 aa		33.91	■■■■□ 3.02
PPP4C-209	ENST00000566749	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.91	■■■■□ 3.02
PPP4C-209	ENST00000566749	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
PPP4C-209	ENST00000566749	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PPP4C-209	ENST00000566749	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PPP4C-209	ENST00000566749	HOXC9	P31274	260 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PPP4C-209	ENST00000566749	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.86	■■■■□ 3.01
PPP4C-209	ENST00000566749	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PPP4C-209	ENST00000566749	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PPP4C-209	ENST00000566749	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.85	■■■■□ 3.01
PPP4C-209	ENST00000566749	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PPP4C-209	ENST00000566749	CCDC7	Q96M83	1385 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PPP4C-209	ENST00000566749	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
PPP4C-209	ENST00000566749	CCDC125	Q86Z20	511 aa		33.82	■■■■□ 3.01
PPP4C-209	ENST00000566749	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.82	■■■■□ 3.01
PPP4C-209	ENST00000566749	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.81	■■■■□ 3
PPP4C-209	ENST00000566749	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.81	■■■■□ 3
PPP4C-209	ENST00000566749	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
PPP4C-209	ENST00000566749	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.8	■■■■□ 3
PPP4C-209	ENST00000566749	NSD2	O96028	1365 aa		33.78	■■■■□ 3
PPP4C-209	ENST00000566749	DDB1	Q16531	1140 aa		33.77	■■■■□ 3
PPP4C-209	ENST00000566749	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
PPP4C-209	ENST00000566749	FLT4	P35916	1363 aa		33.76	■■■■□ 3
PPP4C-209	ENST00000566749	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.76	■■■■□ 3
PPP4C-209	ENST00000566749	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.76	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	INSR	P06213	1382 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	IL2RB	P14784	551 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PPP4C-209	ENST00000566749	EXOC5	O00471	708 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PPP4C-209	ENST00000566749	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PPP4C-209	ENST00000566749	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PPP4C-209	ENST00000566749	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
PPP4C-209	ENST00000566749	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
PPP4C-209	ENST00000566749	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PPP4C-209	ENST00000566749	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PPP4C-209	ENST00000566749	TRIM37	O94972	964 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PPP4C-209	ENST00000566749	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PPP4C-209	ENST00000566749	NBPF4	Q96M43	638 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PPP4C-209	ENST00000566749	TNS2	Q63HR2	1409 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PPP4C-209	ENST00000566749	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PPP4C-209	ENST00000566749	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
PPP4C-209	ENST00000566749	BAG6	P46379	1132 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PPP4C-209	ENST00000566749	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PPP4C-209	ENST00000566749	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
PPP4C-209	ENST00000566749	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
PPP4C-209	ENST00000566749	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
PPP4C-209	ENST00000566749	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
PPP4C-209	ENST00000566749	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP4C-209	ENST00000566749	APBA3	O96018	575 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PPP4C-209	ENST00000566749	MEGF6	O75095	1541 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PPP4C-209	ENST00000566749	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.51	■■■□□ 2.96
PPP4C-209	ENST00000566749	SBF2	Q86WG5	1849 aa		33.51	■■■□□ 2.96
PPP4C-209	ENST00000566749	BCL9	O00512	1426 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PPP4C-209	ENST00000566749	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
PPP4C-209	ENST00000566749	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
PPP4C-209	ENST00000566749	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
PPP4C-209	ENST00000566749	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
PPP4C-209	ENST00000566749	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
PPP4C-209	ENST00000566749	EYA1	Q99502	592 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PPP4C-209	ENST00000566749	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PPP4C-209	ENST00000566749	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.43	■■■□□ 2.94

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