RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP45.49■■■■■ 4.87
TTC7B-202ENST00000553948 NME9Q86XW9 330 aa45.48■■■■■ 4.87
TTC7B-202ENST00000553948 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
TTC7B-202ENST00000553948 WDR17Q8IZU2 1322 aa45.47■■■■■ 4.87
TTC7B-202ENST00000553948 USP54Q70EL1 1684 aa45.47■■■■■ 4.87
TTC7B-202ENST00000553948 A0A1W2PP64 1363 aa45.46■■■■■ 4.87
TTC7B-202ENST00000553948 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
TTC7B-202ENST00000553948 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.45■■■■■ 4.87
TTC7B-202ENST00000553948 RGPD5Q99666 1765 aa45.45■■■■■ 4.87
TTC7B-202ENST00000553948 NINLQ9Y2I6 1382 aa45.45■■■■■ 4.87
TTC7B-202ENST00000553948 TRIM37O94972 964 aa45.43■■■■■ 4.86
TTC7B-202ENST00000553948 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
TTC7B-202ENST00000553948 USP47Q96K76 1375 aa45.42■■■■■ 4.86
TTC7B-202ENST00000553948 CLSPNQ9HAW4 1339 aa45.41■■■■■ 4.86
TTC7B-202ENST00000553948 DISP2A7MBM2 1401 aa45.41■■■■■ 4.86
TTC7B-202ENST00000553948 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa45.4■■■■■ 4.86
TTC7B-202ENST00000553948 ABCC6O95255 1503 aa45.39■■■■■ 4.86
TTC7B-202ENST00000553948 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa45.38■■■■■ 4.86
TTC7B-202ENST00000553948 TMF1P82094 1093 aa45.33■■■■■ 4.85
TTC7B-202ENST00000553948 CARD10Q9BWT7 1032 aa45.33■■■■■ 4.85
TTC7B-202ENST00000553948 WNK3Q9BYP7 1800 aa45.33■■■■■ 4.85
TTC7B-202ENST00000553948 LRRC37A3O60309 1634 aa45.32■■■■■ 4.85
TTC7B-202ENST00000553948 DDB1Q16531 1140 aa45.31■■■■■ 4.84
TTC7B-202ENST00000553948 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP45.3■■■■■ 4.84
TTC7B-202ENST00000553948 APBA3O96018 575 aa45.3■■■■■ 4.84
TTC7B-202ENST00000553948 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP45.3■■■■■ 4.84
TTC7B-202ENST00000553948 LTN1O94822 1766 aa45.3■■■■■ 4.84
TTC7B-202ENST00000553948 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa45.28■■■■■ 4.84
TTC7B-202ENST00000553948 OVOS2Q6IE36 1432 aa45.28■■■■■ 4.84
TTC7B-202ENST00000553948 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
TTC7B-202ENST00000553948 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa45.26■■■■■ 4.84
TTC7B-202ENST00000553948 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa45.26■■■■■ 4.84
TTC7B-202ENST00000553948 CAMKK2Q96RR4 588 aa45.25■■■■■ 4.83
TTC7B-202ENST00000553948 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa45.23■■■■■ 4.83
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC7Q96M83 1385 aa45.23■■■■■ 4.83
TTC7B-202ENST00000553948 PEAK1Q9H792 1746 aa45.23■■■■■ 4.83
TTC7B-202ENST00000553948 PARD3Q8TEW0 1356 aa45.21■■■■■ 4.83
TTC7B-202ENST00000553948 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP45.2■■■■■ 4.83
TTC7B-202ENST00000553948 ERBB3P21860 1342 aa45.2■■■■■ 4.83
TTC7B-202ENST00000553948 CDCA8Q53HL2 280 aa45.19■■■■■ 4.82
TTC7B-202ENST00000553948 COG3Q96JB2 828 aa45.18■■■■■ 4.82
TTC7B-202ENST00000553948 NLRP2Q9NX02 1062 aa45.15■■■■■ 4.82
TTC7B-202ENST00000553948 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP45.13■■■■■ 4.82
TTC7B-202ENST00000553948 ANKRD24Q8TF21 1146 aa45.13■■■■■ 4.82
TTC7B-202ENST00000553948 SBF2Q86WG5 1849 aa45.12■■■■■ 4.81
TTC7B-202ENST00000553948 EXOC5O00471 708 aa45.11■■■■■ 4.81
TTC7B-202ENST00000553948 RREB1Q92766 1687 aa45.09■■■■■ 4.81
TTC7B-202ENST00000553948 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
TTC7B-202ENST00000553948 IP6K1Q92551 441 aa45.09■■■■■ 4.81
TTC7B-202ENST00000553948 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
TTC7B-202ENST00000553948 BCL9O00512 1426 aa45.05■■■■■ 4.8
TTC7B-202ENST00000553948 TNS2Q63HR2 1409 aa45.04■■■■■ 4.8
TTC7B-202ENST00000553948 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
TTC7B-202ENST00000553948 LRP5O75197 1615 aa45.03■■■■■ 4.8
TTC7B-202ENST00000553948 NUP188Q5SRE5 1749 aa45.03■■■■■ 4.8
TTC7B-202ENST00000553948 MAP3K19Q56UN5 1328 aa45.01■■■■■ 4.8
TTC7B-202ENST00000553948 FYB1O15117 783 aa45.01■■■■■ 4.8
TTC7B-202ENST00000553948 IL2RBP14784 551 aa45.01■■■■■ 4.8
TTC7B-202ENST00000553948 FBLN1P23142 703 aa44.98■■■■■ 4.79
TTC7B-202ENST00000553948 AMPHP49418 695 aa44.98■■■■■ 4.79
TTC7B-202ENST00000553948 GGNBP2Q9H3C7 697 aa44.98■■■■■ 4.79
TTC7B-202ENST00000553948 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
TTC7B-202ENST00000553948 MYOM1P52179 1685 aa44.97■■■■■ 4.79
TTC7B-202ENST00000553948 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP44.97■■■■■ 4.79
TTC7B-202ENST00000553948 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP44.97■■■■■ 4.79
TTC7B-202ENST00000553948 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa44.97■■■■■ 4.79
TTC7B-202ENST00000553948 PLSCR1O15162 318 aa44.96■■■■■ 4.79
TTC7B-202ENST00000553948 NBPF14Q5TI25 921 aa44.96■■■■■ 4.79
TTC7B-202ENST00000553948 PTF1AQ7RTS3 328 aa44.96■■■■■ 4.79
TTC7B-202ENST00000553948 HOXC9P31274 260 aa44.95■■■■■ 4.79
TTC7B-202ENST00000553948 KIF20BQ96Q89 1820 aa44.94■■■■■ 4.78
TTC7B-202ENST00000553948 RTL1A6NKG5 1358 aa44.89■■■■■ 4.78
TTC7B-202ENST00000553948 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
TTC7B-202ENST00000553948 CARD14Q9BXL6 1004 aa44.88■■■■■ 4.78
TTC7B-202ENST00000553948 NSD3Q9BZ95 1437 aa44.84■■■■■ 4.77
TTC7B-202ENST00000553948 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP44.82■■■■■ 4.77
TTC7B-202ENST00000553948 NHSQ6T4R5 1651 aa44.8■■■■■ 4.76
TTC7B-202ENST00000553948 KCNQ2O43526 872 aa44.8■■■■■ 4.76
TTC7B-202ENST00000553948 RGPD2P0DJD1 1756 aa44.79■■■■■ 4.76
TTC7B-202ENST00000553948 ACSBG1Q96GR2 724 aa44.78■■■■■ 4.76
TTC7B-202ENST00000553948 POLR3GLQ9BT43 218 aa44.78■■■■■ 4.76
TTC7B-202ENST00000553948 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
TTC7B-202ENST00000553948 PROM2Q8N271 834 aa44.75■■■■■ 4.75
TTC7B-202ENST00000553948 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
TTC7B-202ENST00000553948 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP44.73■■■■■ 4.75
TTC7B-202ENST00000553948 KIF24Q5T7B8 1368 aa44.71■■■■■ 4.75
TTC7B-202ENST00000553948 FLT4P35916 1363 aa44.7■■■■■ 4.75
TTC7B-202ENST00000553948 TXNRD1Q16881 649 aa44.7■■■■■ 4.75
TTC7B-202ENST00000553948 CGNL1Q0VF96 1302 aa44.7■■■■■ 4.75
TTC7B-202ENST00000553948 INSRP06213 1382 aa44.69■■■■■ 4.75
TTC7B-202ENST00000553948 NBPF6Q5VWK0 638 aa44.69■■■■■ 4.74
TTC7B-202ENST00000553948 NBPF4Q96M43 638 aa44.69■■■■■ 4.74
TTC7B-202ENST00000553948 KAT6BQ8WYB5 2073 aa44.68■■■■■ 4.74
TTC7B-202ENST00000553948 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa44.68■■■■■ 4.74
TTC7B-202ENST00000553948 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
TTC7B-202ENST00000553948 MEGF6O75095 1541 aa44.65■■■■■ 4.74
TTC7B-202ENST00000553948 BTAF1O14981 1849 aa44.65■■■■■ 4.74
TTC7B-202ENST00000553948 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
TTC7B-202ENST00000553948 USHBP1Q8N6Y0 703 aa44.62■■■■■ 4.73
TTC7B-202ENST00000553948 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa44.62■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms