RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 LIMD1Q9UGP4 676 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 ANKRD62A6NC57 917 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 AP1G2O75843 785 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 CLSTN1O94985 981 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 CD46P15529 392 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 ABL2P42684 1182 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 SLC4A3P48751 1232 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 UBXN4Q92575 508 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
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CS-232ENST00000552331 MOXD2PA6NHM9 499 aa5.05□□□□□ -1.6
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CS-232ENST00000552331 SMPD1P17405 629 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 VEGFBP49765 207 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 TXNDC2Q86VQ3 553 aa5.05□□□□□ -1.6
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CS-232ENST00000552331 ZNF592Q92610 1267 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 SPTLC1O15269 473 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 KDM4AO75164 1064 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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CS-232ENST00000552331 TMEM134Q9H6X4 195 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 PPP2R2DQ66LE6 453 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 TICAM2Q86XR7 235 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-232ENST00000552331 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa5.03□□□□□ -1.6
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CS-232ENST00000552331 QPCTQ16769 361 aa5.02□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 LCE3BQ5TA77 95 aa5.02□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 MTMR14Q8NCE2 650 aa5.02□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.01□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 LILRB3O75022 631 aa5.01□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 ATG7O95352 703 aa5.01□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 FDX1P10109 184 aa5.01□□□□□ -1.61
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CS-232ENST00000552331 USP46P62068 366 aa5.01□□□□□ -1.61
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CS-232ENST00000552331 VSIG8P0DPA2 414 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 GJA5P36382 358 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 FOXK2Q01167 660 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 WASHC4Q2M389 1173 aa4.99□□□□□ -1.61
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CS-232ENST00000552331 J3QL48 77 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 NR1I2O75469 434 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 VAMP1P23763 118 aa4.98□□□□□ -1.61
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CS-232ENST00000552331 HPS1Q92902 700 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 BCL11AQ9H165 835 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
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CS-232ENST00000552331 MTMR2Q13614 643 aa4.97□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CS-232ENST00000552331 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CS-232ENST00000552331 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa4.96□□□□□ -1.62
CS-232ENST00000552331 HLA-CQ95604 372 aa4.96□□□□□ -1.62
CS-232ENST00000552331 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.96□□□□□ -1.62
CS-232ENST00000552331 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa4.96□□□□□ -1.62
CS-232ENST00000552331 ATP6V1AP38606 617 aa4.95□□□□□ -1.62
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