RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551549.1

GCN1-208, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 2

Gene GCN1, Length 258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-208	ENST00000551549		A0A1W2PP64	1363 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-208	ENST00000551549	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-208	ENST00000551549	COL18A1	P39060	1754 aa		13.71	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	NFAT5	O94916	1531 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	APBA3	O96018	575 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	USP47	Q96K76	1375 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	DISP2	A7MBM2	1401 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	SLC24A1	O60721	1099 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	DDB1	Q16531	1140 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	TMF1	P82094	1093 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GCN1-208	ENST00000551549	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	FBLN1	P23142	703 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	COG3	Q96JB2	828 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	ERBB3	P21860	1342 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	EXOC5	O00471	708 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	IP6K1	Q92551	441 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	ABCC6	O95255	1503 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	RGPD5	Q99666	1765 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	LRRC37A3	O60309	1634 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	FYB1	O15117	783 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	PEAK1	Q9H792	1746 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	CDCA8	Q53HL2	280 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GCN1-208	ENST00000551549	BCL9	O00512	1426 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	PLSCR1	O15162	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	IL2RB	P14784	551 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	HOXC9	P31274	260 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	KCNQ2	O43526	872 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	AMPH	P49418	695 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	TNS2	Q63HR2	1409 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	LTN1	O94822	1766 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	NBPF14	Q5TI25	921 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	PROM2	Q8N271	834 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	UTRN	P46939	3433 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	RREB1	Q92766	1687 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GCN1-208	ENST00000551549	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	LRP5	O75197	1615 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	RTL1	A6NKG5	1358 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	NBPF4	Q96M43	638 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	INSR	P06213	1382 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	MYOM1	P52179	1685 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	MEGF6	O75095	1541 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	FLT4	P35916	1363 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GCN1-208	ENST00000551549	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
GCN1-208	ENST00000551549	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GCN1-208	ENST00000551549	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GCN1-208	ENST00000551549	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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