RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.32■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.32■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 LRRC37A3O60309 1634 aa24.32■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 PLSCR1O15162 318 aa24.31■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 PEAK1Q9H792 1746 aa24.31■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 SPON1Q9HCB6 807 aa24.3■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.3■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 SBF2Q86WG5 1849 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 KCNQ2O43526 872 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 AKAP12Q02952 1782 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.27■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.27■■□□□ 1.48
CS-214ENST00000548849 RGPD5Q99666 1765 aa24.26■■□□□ 1.47
CS-214ENST00000548849 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-214ENST00000548849 EXOC5O00471 708 aa24.24■■□□□ 1.47
CS-214ENST00000548849 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CS-214ENST00000548849 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.23■■□□□ 1.47
CS-214ENST00000548849 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
CS-214ENST00000548849 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CS-214ENST00000548849 BCL9O00512 1426 aa24.2■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 PROM2Q8N271 834 aa24.2■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 NFAT5O94916 1531 aa24.2■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 CCDC7Q96M83 1385 aa24.19■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.18■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 TMC1Q8TDI8 760 aa24.18■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.18■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 YY1P25490 414 aa24.17■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.16■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 TXNRD1Q16881 649 aa24.16■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 NME9Q86XW9 330 aa24.16■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 USP31Q70CQ4 1352 aa24.16■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.15■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.15■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.15■■□□□ 1.46
CS-214ENST00000548849 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 STK32BQ9NY57 414 aa24.14■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 ABCC6O95255 1503 aa24.14■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 ZBTB7AO95365 584 aa24.13■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 TNS2Q63HR2 1409 aa24.12■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.12■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 ERBB3P21860 1342 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 CASZ1Q86V15 1759 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 SLC15A2Q16348 729 aa24.1■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 IL2RBP14784 551 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-214ENST00000548849 LTN1O94822 1766 aa24.08■■□□□ 1.44
CS-214ENST00000548849 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-214ENST00000548849 USP54Q70EL1 1684 aa24.07■■□□□ 1.44
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CS-214ENST00000548849 NHSQ6T4R5 1651 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-214ENST00000548849 PTGER2P43116 358 aa24.04■■□□□ 1.44
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PP64 1363 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-214ENST00000548849 MYOM1P52179 1685 aa24.02■■□□□ 1.44
CS-214ENST00000548849 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CS-214ENST00000548849 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CS-214ENST00000548849 MTFR1LQ9H019 292 aa24.01■■□□□ 1.43
CS-214ENST00000548849 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24■■□□□ 1.43
CS-214ENST00000548849 IP6K1Q92551 441 aa24■■□□□ 1.43
CS-214ENST00000548849 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CS-214ENST00000548849 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CS-214ENST00000548849 SYT17Q9BSW7 474 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-214ENST00000548849 BTAF1O14981 1849 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-214ENST00000548849 COG3Q96JB2 828 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-214ENST00000548849 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-214ENST00000548849 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-214ENST00000548849 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-214ENST00000548849 ZNF827Q17R98 1081 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-214ENST00000548849 TESK2Q96S53 571 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-214ENST00000548849 FBLN1P23142 703 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-214ENST00000548849 AMPHP49418 695 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-214ENST00000548849 ARXQ96QS3 562 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-214ENST00000548849 PAPPAQ13219 1627 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-214ENST00000548849 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.91■■□□□ 1.42
CS-214ENST00000548849 HOXC9P31274 260 aa23.91■■□□□ 1.42
CS-214ENST00000548849 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
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CS-214ENST00000548849 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.88■■□□□ 1.41
CS-214ENST00000548849 AKT1S1Q96B36 256 aa23.87■■□□□ 1.41
CS-214ENST00000548849 UTRNP46939 3433 aa23.86■■□□□ 1.41
CS-214ENST00000548849 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CS-214ENST00000548849 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.84■■□□□ 1.41
CS-214ENST00000548849 KCNQ4P56696 695 aa23.84■■□□□ 1.41
CS-214ENST00000548849 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.84■■□□□ 1.41
CS-214ENST00000548849 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.84■■□□□ 1.41
CS-214ENST00000548849 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CS-214ENST00000548849 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.83■■□□□ 1.4
CS-214ENST00000548849 KLHL34Q8N239 644 aa23.82■■□□□ 1.4
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