RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 LRRC37A3O60309 1634 aa26.61■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 USP31Q70CQ4 1352 aa26.6■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 BCL9O00512 1426 aa26.6■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.6■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 TRIM37O94972 964 aa26.59■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.59■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.58■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
LTBR-211ENST00000543190 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.56■■□□□ 1.84
LTBR-211ENST00000543190 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.56■■□□□ 1.84
LTBR-211ENST00000543190 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.56■■□□□ 1.84
LTBR-211ENST00000543190 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.56■■□□□ 1.84
LTBR-211ENST00000543190 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
LTBR-211ENST00000543190 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.55■■□□□ 1.84
LTBR-211ENST00000543190 TONSLQ96HA7 1378 aa26.54■■□□□ 1.84
LTBR-211ENST00000543190 APBA3O96018 575 aa26.53■■□□□ 1.84
LTBR-211ENST00000543190 SLC24A1O60721 1099 aa26.51■■□□□ 1.83
LTBR-211ENST00000543190 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.51■■□□□ 1.83
LTBR-211ENST00000543190 LTN1O94822 1766 aa26.51■■□□□ 1.83
LTBR-211ENST00000543190 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
LTBR-211ENST00000543190 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
LTBR-211ENST00000543190 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.5■■□□□ 1.83
LTBR-211ENST00000543190 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.49■■□□□ 1.83
LTBR-211ENST00000543190 DDB1Q16531 1140 aa26.49■■□□□ 1.83
LTBR-211ENST00000543190 CCDC7Q96M83 1385 aa26.48■■□□□ 1.83
LTBR-211ENST00000543190 PLSCR1O15162 318 aa26.47■■□□□ 1.83
LTBR-211ENST00000543190 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
LTBR-211ENST00000543190 TESK2Q96S53 571 aa26.44■■□□□ 1.82
LTBR-211ENST00000543190 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.44■■□□□ 1.82
LTBR-211ENST00000543190 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
LTBR-211ENST00000543190 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
LTBR-211ENST00000543190 A0A1W2PP64 1363 aa26.42■■□□□ 1.82
LTBR-211ENST00000543190 ERBB3P21860 1342 aa26.41■■□□□ 1.82
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.41■■□□□ 1.82
LTBR-211ENST00000543190 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.41■■□□□ 1.82
LTBR-211ENST00000543190 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
LTBR-211ENST00000543190 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
LTBR-211ENST00000543190 TNS2Q63HR2 1409 aa26.39■■□□□ 1.82
LTBR-211ENST00000543190 NBPF14Q5TI25 921 aa26.39■■□□□ 1.82
LTBR-211ENST00000543190 NME9Q86XW9 330 aa26.38■■□□□ 1.81
LTBR-211ENST00000543190 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
LTBR-211ENST00000543190 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
LTBR-211ENST00000543190 NHSQ6T4R5 1651 aa26.35■■□□□ 1.81
LTBR-211ENST00000543190 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.35■■□□□ 1.81
LTBR-211ENST00000543190 TMC1Q8TDI8 760 aa26.35■■□□□ 1.81
LTBR-211ENST00000543190 EXOC5O00471 708 aa26.34■■□□□ 1.81
LTBR-211ENST00000543190 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.33■■□□□ 1.81
LTBR-211ENST00000543190 CASZ1Q86V15 1759 aa26.33■■□□□ 1.8
LTBR-211ENST00000543190 SOX12O15370 315 aa26.32■■□□□ 1.8
LTBR-211ENST00000543190 PROM2Q8N271 834 aa26.29■■□□□ 1.8
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.29■■□□□ 1.8
LTBR-211ENST00000543190 IP6K1Q92551 441 aa26.28■■□□□ 1.8
LTBR-211ENST00000543190 IL2RBP14784 551 aa26.27■■□□□ 1.8
LTBR-211ENST00000543190 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.27■■□□□ 1.8
LTBR-211ENST00000543190 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.27■■□□□ 1.8
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.26■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.25■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.24■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 BTAF1O14981 1849 aa26.23■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 USP47Q96K76 1375 aa26.23■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.23■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 SPON1Q9HCB6 807 aa26.23■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 KCNQ2O43526 872 aa26.22■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 RTL1A6NKG5 1358 aa26.21■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 TMF1P82094 1093 aa26.21■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 COG3Q96JB2 828 aa26.21■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 PAPPAQ13219 1627 aa26.21■■□□□ 1.79
LTBR-211ENST00000543190 TXNRD1Q16881 649 aa26.2■■□□□ 1.78
LTBR-211ENST00000543190 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.18■■□□□ 1.78
LTBR-211ENST00000543190 CDCA8Q53HL2 280 aa26.18■■□□□ 1.78
LTBR-211ENST00000543190 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.18■■□□□ 1.78
LTBR-211ENST00000543190 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.18■■□□□ 1.78
LTBR-211ENST00000543190 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.17■■□□□ 1.78
LTBR-211ENST00000543190 MYOM1P52179 1685 aa26.16■■□□□ 1.78
LTBR-211ENST00000543190 HOXC9P31274 260 aa26.16■■□□□ 1.78
LTBR-211ENST00000543190 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.16■■□□□ 1.78
LTBR-211ENST00000543190 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.15■■□□□ 1.78
LTBR-211ENST00000543190 FYB1O15117 783 aa26.15■■□□□ 1.78
LTBR-211ENST00000543190 SLC15A2Q16348 729 aa26.13■■□□□ 1.77
LTBR-211ENST00000543190 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.11■■□□□ 1.77
LTBR-211ENST00000543190 STK32BQ9NY57 414 aa26.1■■□□□ 1.77
LTBR-211ENST00000543190 LY75O60449 1722 aa26.09■■□□□ 1.77
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.09■■□□□ 1.77
LTBR-211ENST00000543190 AMPHP49418 695 aa26.08■■□□□ 1.77
LTBR-211ENST00000543190 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.08■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 PTGER2P43116 358 aa26.07■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.06■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 INSRP06213 1382 aa26.06■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 MEGF6O75095 1541 aa26.05■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.05■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.05■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.04■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 FBLN1P23142 703 aa26.03■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 MTFR1LQ9H019 292 aa26.03■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 FLT4P35916 1363 aa26.03■■□□□ 1.76
LTBR-211ENST00000543190 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
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