RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527118.5

RBBP4-218, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 3

Gene RBBP4, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-218ENST00000527118 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RBBP4-218ENST00000527118 A0A1W2PP64 1363 aa22.01■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 PDE3BQ13370 1112 aa22.01■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 LRRC37A3O60309 1634 aa22■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 USP31Q70CQ4 1352 aa21.99■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 TRIM37O94972 964 aa21.99■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.99■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.98■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 USP47Q96K76 1375 aa21.98■■□□□ 1.11
RBBP4-218ENST00000527118 SBF2Q86WG5 1849 aa21.95■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.95■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 DISP2A7MBM2 1401 aa21.95■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 ABCC6O95255 1503 aa21.95■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 PEAK1Q9H792 1746 aa21.94■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.94■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.93■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 SLC24A1O60721 1099 aa21.92■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.91■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.91■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 APBA3O96018 575 aa21.91■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 DDB1Q16531 1140 aa21.91■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.9■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 TMF1P82094 1093 aa21.9■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.9■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 RREB1Q92766 1687 aa21.9■■□□□ 1.1
RBBP4-218ENST00000527118 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.89■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.88■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.88■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.88■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.87■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.86■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 CCDC7Q96M83 1385 aa21.86■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 MYOM1P52179 1685 aa21.85■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 ERBB3P21860 1342 aa21.85■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.84■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.83■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 COG3Q96JB2 828 aa21.83■■□□□ 1.09
RBBP4-218ENST00000527118 LRP5O75197 1615 aa21.83■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.83■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.82■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 FBLN1P23142 703 aa21.81■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.81■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 EXOC5O00471 708 aa21.8■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 CDCA8Q53HL2 280 aa21.8■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 TNS2Q63HR2 1409 aa21.8■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.79■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 IP6K1Q92551 441 aa21.79■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.78■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.78■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.78■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 FYB1O15117 783 aa21.77■■□□□ 1.08
RBBP4-218ENST00000527118 BCL9O00512 1426 aa21.76■■□□□ 1.07
RBBP4-218ENST00000527118 IL2RBP14784 551 aa21.76■■□□□ 1.07
RBBP4-218ENST00000527118 HOXC9P31274 260 aa21.75■■□□□ 1.07
RBBP4-218ENST00000527118 AMPHP49418 695 aa21.75■■□□□ 1.07
RBBP4-218ENST00000527118 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RBBP4-218ENST00000527118 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RBBP4-218ENST00000527118 NHSQ6T4R5 1651 aa21.74■■□□□ 1.07
RBBP4-218ENST00000527118 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.72■■□□□ 1.07
RBBP4-218ENST00000527118 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.72■■□□□ 1.07
RBBP4-218ENST00000527118 PLSCR1O15162 318 aa21.71■■□□□ 1.07
RBBP4-218ENST00000527118 NBPF14Q5TI25 921 aa21.71■■□□□ 1.07
RBBP4-218ENST00000527118 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.71■■□□□ 1.07
RBBP4-218ENST00000527118 BTAF1O14981 1849 aa21.69■■□□□ 1.06
RBBP4-218ENST00000527118 KCNQ2O43526 872 aa21.69■■□□□ 1.06
RBBP4-218ENST00000527118 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.69■■□□□ 1.06
RBBP4-218ENST00000527118 RTL1A6NKG5 1358 aa21.69■■□□□ 1.06
RBBP4-218ENST00000527118 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.69■■□□□ 1.06
RBBP4-218ENST00000527118 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
RBBP4-218ENST00000527118 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
RBBP4-218ENST00000527118 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
RBBP4-218ENST00000527118 PROM2Q8N271 834 aa21.66■■□□□ 1.06
RBBP4-218ENST00000527118 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 MEGF6O75095 1541 aa21.64■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.63■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.63■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.63■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.63■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 NBPF4Q96M43 638 aa21.63■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 TXNRD1Q16881 649 aa21.62■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.62■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 FLT4P35916 1363 aa21.61■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 CASZ1Q86V15 1759 aa21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.3 ms