RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 CRB1P82279 1406 aa25.78■■□□□ 1.72
TSPAN4-216ENST00000526055 COL18A1P39060 1754 aa25.77■■□□□ 1.72
TSPAN4-216ENST00000526055 USP35Q9P2H5 1018 aa25.76■■□□□ 1.71
TSPAN4-216ENST00000526055 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
TSPAN4-216ENST00000526055 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPAN4-216ENST00000526055 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPAN4-216ENST00000526055 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPAN4-216ENST00000526055 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPAN4-216ENST00000526055 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPAN4-216ENST00000526055 SOX12O15370 315 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPAN4-216ENST00000526055 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPAN4-216ENST00000526055 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
TSPAN4-216ENST00000526055 PDE3BQ13370 1112 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPAN4-216ENST00000526055 COG3Q96JB2 828 aa25.68■■□□□ 1.7
TSPAN4-216ENST00000526055 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
TSPAN4-216ENST00000526055 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
TSPAN4-216ENST00000526055 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPAN4-216ENST00000526055 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPAN4-216ENST00000526055 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.66■■□□□ 1.7
TSPAN4-216ENST00000526055 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC7Q96M83 1385 aa25.64■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 BAG6P46379 1132 aa25.63■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 ERBB3P21860 1342 aa25.63■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM182BQ5T319 152 aa25.62■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 FYB1O15117 783 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 RGPD5Q99666 1765 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.6■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 LTN1O94822 1766 aa25.6■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.6■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 DISP2A7MBM2 1401 aa25.6■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 DDB1Q16531 1140 aa25.59■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 IP6K1Q92551 441 aa25.59■■□□□ 1.69
TSPAN4-216ENST00000526055 MYOM1P52179 1685 aa25.58■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.56■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.55■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.55■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.55■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.55■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 LRRC37A3O60309 1634 aa25.55■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 RTL1A6NKG5 1358 aa25.55■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIM37O94972 964 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 AMPHP49418 695 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 BCL9O00512 1426 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 EXOC5O00471 708 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 HOXC9P31274 260 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 PEAK1Q9H792 1746 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 IL2RBP14784 551 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 TNS2Q63HR2 1409 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 APBA3O96018 575 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN4-216ENST00000526055 FBLN1P23142 703 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN4-216ENST00000526055 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
TSPAN4-216ENST00000526055 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TSPAN4-216ENST00000526055 FLT4P35916 1363 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPAN4-216ENST00000526055 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TSPAN4-216ENST00000526055 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TSPAN4-216ENST00000526055 INSRP06213 1382 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPAN4-216ENST00000526055 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TSPAN4-216ENST00000526055 PANK3Q9H999 370 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPAN4-216ENST00000526055 SBF2Q86WG5 1849 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 PLSCR1O15162 318 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 NSD2O96028 1365 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.35■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.34■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.33■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 NBPF4Q96M43 638 aa25.33■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.33■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 LRP5O75197 1615 aa25.33■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.33■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 RREB1Q92766 1687 aa25.32■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.32■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 NBPF14Q5TI25 921 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 POLKQ9UBT6 870 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 MEGF6O75095 1541 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 NHSQ6T4R5 1651 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPAN4-216ENST00000526055 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TSPAN4-216ENST00000526055 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms