RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 CRB1P82279 1406 aa25.78■■□□□ 1.72
TSPAN4-216ENST00000526055 COL18A1P39060 1754 aa25.77■■□□□ 1.72
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TSPAN4-216ENST00000526055 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.74■■□□□ 1.71
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TSPAN4-216ENST00000526055 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.73■■□□□ 1.71
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TSPAN4-216ENST00000526055 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.71■■□□□ 1.71
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TSPAN4-216ENST00000526055 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.67■■□□□ 1.7
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TSPAN4-216ENST00000526055 RTL1A6NKG5 1358 aa25.55■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.54■■□□□ 1.68
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TSPAN4-216ENST00000526055 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 AMPHP49418 695 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-216ENST00000526055 BCL9O00512 1426 aa25.52■■□□□ 1.68
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TSPAN4-216ENST00000526055 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.51■■□□□ 1.67
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TSPAN4-216ENST00000526055 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.5■■□□□ 1.67
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TSPAN4-216ENST00000526055 FBLN1P23142 703 aa25.45■■□□□ 1.66
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TSPAN4-216ENST00000526055 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TSPAN4-216ENST00000526055 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
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TSPAN4-216ENST00000526055 SBF2Q86WG5 1849 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 PLSCR1O15162 318 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 NSD2O96028 1365 aa25.37■■□□□ 1.65
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TSPAN4-216ENST00000526055 NBPF4Q96M43 638 aa25.33■■□□□ 1.65
TSPAN4-216ENST00000526055 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.33■■□□□ 1.65
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TSPAN4-216ENST00000526055 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.32■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.31■■□□□ 1.64
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TSPAN4-216ENST00000526055 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 MEGF6O75095 1541 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPAN4-216ENST00000526055 NHSQ6T4R5 1651 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPAN4-216ENST00000526055 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TSPAN4-216ENST00000526055 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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