RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 CABLES1Q8TDN4 633 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 INSRP06213 1382 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 SLC4A10Q6U841 1118 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 EYA1Q99502 592 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC27Q2M243 656 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 PDE3AQ14432 1141 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 SLC4A3P48751 1232 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 GNAI1P63096 354 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 ATF3P18847 181 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 ATP7BP35670 1465 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-216ENST00000524481 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 USP6P35125 1406 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 C3P01024 1663 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 VAMP4O75379 141 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 CHRNA2Q15822 529 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 HOXC9P31274 260 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 SLC4A2P04920 1241 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 CFAP44Q96MT7 982 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 DLC1Q96QB1 1528 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 BACH2Q9BYV9 841 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 F6X3S4 739 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 LNPKQ9C0E8 428 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 GCP02774 474 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 USP35Q9P2H5 1018 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-216ENST00000524481 IFT57Q9NWB7 429 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 TECPR2O15040 1411 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 NBPF6Q5VWK0 638 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 NBPF4Q96M43 638 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 MS4A1P11836 297 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 KIF16BQ96L93 1317 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 A0A0G2JS52 829 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 SHPRHQ149N8 1683 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 ANXA1P04083 346 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 FLT4P35916 1363 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 LGR6Q9HBX8 967 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 TEFQ10587 303 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 FAM161AQ3B820 660 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 IL16Q14005 1332 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 G2E3Q7L622 706 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 STK31Q9BXU1 1019 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-216ENST00000524481 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-216ENST00000524481 SEC24BO95487 1268 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-216ENST00000524481 IL17REQ8NFR9 667 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-216ENST00000524481 MED14O60244 1454 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-216ENST00000524481 SBNO1A3KN83 1393 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-216ENST00000524481 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-216ENST00000524481 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM94Q12767 1356 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-216ENST00000524481 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms