RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	9.68	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	PSMA5	P28066	241 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	9.68	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	NOS1	P29475	1434 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	TRIM29	Q14134	588 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf34	Q49A92	452 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	HOMER1	Q86YM7	354 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	TRIM5	Q9C035	493 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	KDM4A	O75164	1064 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	SSFA2	P28290	1259 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	ABCC11	Q96J66	1382 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	STK3	Q13188	491 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	ATP10B	O94823	1461 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	FAM83G	A6ND36	823 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	TPM3	P06753	285 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	RLBP1	P12271	317 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	SPC24	Q8NBT2	197 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	9.66	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	9.66	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	PDC	P20941	246 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	CLSTN1	O94985	981 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NEK1-208	ENST00000512193	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	9.65	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		9.65	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	SYCE3	A1L190	88 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	ADGRL1	O94910	1474 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	MYL6B	P14649	208 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	SEC24B	O95487	1268 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	AACS	Q86V21	672 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	FYB1	O15117	783 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	ATF3	P18847	181 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	MX1	P20591	662 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	CD109	Q6YHK3	1445 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	ATP2B1	P20020	1258 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	FERMT3	Q86UX7	667 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	MBIP	Q9NS73	344 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	HIP1	O00291	1037 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	MARCH6	O60337	910 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	TPM2	P07951	284 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	FAM177B	A6PVY3	158 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	KRT85	P78386	507 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	BTBD11	A6QL63	1104 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	TPM1	P09493	284 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC192	P0DO97	292 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	PZP	P20742	1482 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	VPS37D	Q86XT2	251 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	NUCB1	Q02818	461 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	TNMD	Q9H2S6	317 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NEK1-208	ENST00000512193	ERICH2	A1L162	156 aa		9.59	□□□□□ -0.87

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