RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 ABCC6O95255 1503 aa34.91■■■■□ 3.18
ALYREF-203ENST00000511412 TMC1Q8TDI8 760 aa34.91■■■■□ 3.18
ALYREF-203ENST00000511412 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.91■■■■□ 3.18
ALYREF-203ENST00000511412 LRP5O75197 1615 aa34.91■■■■□ 3.18
ALYREF-203ENST00000511412 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
ALYREF-203ENST00000511412 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP34.89■■■■□ 3.18
ALYREF-203ENST00000511412 USP31Q70CQ4 1352 aa34.88■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 PARD3Q8TEW0 1356 aa34.87■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 APBA3O96018 575 aa34.87■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 PEAK1Q9H792 1746 aa34.86■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 RREB1Q92766 1687 aa34.86■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa34.86■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.86■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.86■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 CAMKK2Q96RR4 588 aa34.84■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa34.84■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1W2PP64 1363 aa34.84■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.83■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 NME9Q86XW9 330 aa34.83■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 LTN1O94822 1766 aa34.82■■■■□ 3.17
ALYREF-203ENST00000511412 DDB1Q16531 1140 aa34.82■■■■□ 3.16
ALYREF-203ENST00000511412 TERF2IPQ9NYB0 399 aa34.82■■■■□ 3.16
ALYREF-203ENST00000511412 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.8■■■■□ 3.16
ALYREF-203ENST00000511412 TESK2Q96S53 571 aa34.8■■■■□ 3.16
ALYREF-203ENST00000511412 NUP188Q5SRE5 1749 aa34.8■■■■□ 3.16
ALYREF-203ENST00000511412 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.79■■■■□ 3.16
ALYREF-203ENST00000511412 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
ALYREF-203ENST00000511412 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.78■■■■□ 3.16
ALYREF-203ENST00000511412 SBF2Q86WG5 1849 aa34.77■■■■□ 3.16
ALYREF-203ENST00000511412 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC7Q96M83 1385 aa34.75■■■■□ 3.15
ALYREF-203ENST00000511412 SLC24A1O60721 1099 aa34.75■■■■□ 3.15
ALYREF-203ENST00000511412 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
ALYREF-203ENST00000511412 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa34.73■■■■□ 3.15
ALYREF-203ENST00000511412 ERBB3P21860 1342 aa34.71■■■■□ 3.15
ALYREF-203ENST00000511412 USP47Q96K76 1375 aa34.69■■■■□ 3.14
ALYREF-203ENST00000511412 BCL9O00512 1426 aa34.67■■■■□ 3.14
ALYREF-203ENST00000511412 TNS2Q63HR2 1409 aa34.67■■■■□ 3.14
ALYREF-203ENST00000511412 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.63■■■■□ 3.13
ALYREF-203ENST00000511412 EXOC5O00471 708 aa34.63■■■■□ 3.13
ALYREF-203ENST00000511412 NBPF14Q5TI25 921 aa34.63■■■■□ 3.13
ALYREF-203ENST00000511412 NLRP2Q9NX02 1062 aa34.62■■■■□ 3.13
ALYREF-203ENST00000511412 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
ALYREF-203ENST00000511412 TMF1P82094 1093 aa34.61■■■■□ 3.13
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD24Q8TF21 1146 aa34.61■■■■□ 3.13
ALYREF-203ENST00000511412 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
ALYREF-203ENST00000511412 PLSCR1O15162 318 aa34.58■■■■□ 3.13
ALYREF-203ENST00000511412 COG3Q96JB2 828 aa34.58■■■■□ 3.13
ALYREF-203ENST00000511412 PTF1AQ7RTS3 328 aa34.55■■■■□ 3.12
ALYREF-203ENST00000511412 NHSQ6T4R5 1651 aa34.54■■■■□ 3.12
ALYREF-203ENST00000511412 IL2RBP14784 551 aa34.54■■■■□ 3.12
ALYREF-203ENST00000511412 IP6K1Q92551 441 aa34.53■■■■□ 3.12
ALYREF-203ENST00000511412 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.52■■■■□ 3.12
ALYREF-203ENST00000511412 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.52■■■■□ 3.12
ALYREF-203ENST00000511412 CDCA8Q53HL2 280 aa34.5■■■■□ 3.11
ALYREF-203ENST00000511412 KIF20BQ96Q89 1820 aa34.49■■■■□ 3.11
ALYREF-203ENST00000511412 MAP3K19Q56UN5 1328 aa34.49■■■■□ 3.11
ALYREF-203ENST00000511412 MYOM1P52179 1685 aa34.47■■■■□ 3.11
ALYREF-203ENST00000511412 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.47■■■■□ 3.11
ALYREF-203ENST00000511412 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
ALYREF-203ENST00000511412 HOXC9P31274 260 aa34.45■■■■□ 3.11
ALYREF-203ENST00000511412 AMPHP49418 695 aa34.45■■■■□ 3.11
ALYREF-203ENST00000511412 RTL1A6NKG5 1358 aa34.45■■■■□ 3.11
ALYREF-203ENST00000511412 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
ALYREF-203ENST00000511412 FYB1O15117 783 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-203ENST00000511412 KCNQ2O43526 872 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-203ENST00000511412 FBLN1P23142 703 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-203ENST00000511412 ACSBG1Q96GR2 724 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-203ENST00000511412 GGNBP2Q9H3C7 697 aa34.41■■■■□ 3.1
ALYREF-203ENST00000511412 PROM2Q8N271 834 aa34.4■■■■□ 3.1
ALYREF-203ENST00000511412 RGPD2P0DJD1 1756 aa34.4■■■■□ 3.1
ALYREF-203ENST00000511412 CASZ1Q86V15 1759 aa34.4■■■■□ 3.1
ALYREF-203ENST00000511412 TXNRD1Q16881 649 aa34.39■■■■□ 3.1
ALYREF-203ENST00000511412 BTAF1O14981 1849 aa34.39■■■■□ 3.1
ALYREF-203ENST00000511412 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
ALYREF-203ENST00000511412 SPON1Q9HCB6 807 aa34.36■■■■□ 3.09
ALYREF-203ENST00000511412 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
ALYREF-203ENST00000511412 NSD3Q9BZ95 1437 aa34.32■■■■□ 3.08
ALYREF-203ENST00000511412 SHANK3Q9BYB0 1731 aa34.32■■■■□ 3.08
ALYREF-203ENST00000511412 STK32BQ9NY57 414 aa34.31■■■■□ 3.08
ALYREF-203ENST00000511412 MEGF6O75095 1541 aa34.3■■■■□ 3.08
ALYREF-203ENST00000511412 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
ALYREF-203ENST00000511412 DOT1LQ8TEK3 1739 aa34.3■■■■□ 3.08
ALYREF-203ENST00000511412 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
ALYREF-203ENST00000511412 PAPPAQ13219 1627 aa34.29■■■■□ 3.08
ALYREF-203ENST00000511412 KAT6BQ8WYB5 2073 aa34.28■■■■□ 3.08
ALYREF-203ENST00000511412 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.27■■■■□ 3.08
ALYREF-203ENST00000511412 FLT4P35916 1363 aa34.26■■■■□ 3.08
ALYREF-203ENST00000511412 KIF24Q5T7B8 1368 aa34.26■■■■□ 3.08
ALYREF-203ENST00000511412 SLC15A2Q16348 729 aa34.25■■■■□ 3.07
ALYREF-203ENST00000511412 INSRP06213 1382 aa34.24■■■■□ 3.07
ALYREF-203ENST00000511412 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.23■■■■□ 3.07
ALYREF-203ENST00000511412 NBPF4Q96M43 638 aa34.23■■■■□ 3.07
ALYREF-203ENST00000511412 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms