RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 TTC21AQ8NDW8 1320 aa10.65□□□□□ -0.7
PDE4D-208ENST00000502484 USP31Q70CQ4 1352 aa10.65□□□□□ -0.7
PDE4D-208ENST00000502484 PIK3C2AO00443 1686 aa10.65□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 PEAK1Q9H792 1746 aa10.65□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 IL16Q14005 1332 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 MST1RQ04912 1400 aa10.64□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 RIPK4P57078 832 aa10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 PRKAR2BP31323 418 aa10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.63□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf167Q5SNV9 1468 aa10.62□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 NEFMP07197 916 aa10.62□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 RARSP54136 660 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 PDE3AQ14432 1141 aa10.62□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa10.62□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.62□□□□□ -0.71
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PDE4D-208ENST00000502484 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa10.61□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 HMOX1P09601 288 aa10.61□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 BRINP3Q76B58 766 aa10.61□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 NFE2L2Q16236 605 aa10.6□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 KDM2BQ8NHM5 1336 aa10.59□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO41Q8TF61 875 aa10.59□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 PHACTR3Q96KR7 559 aa10.59□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.59□□□□□ -0.71
PDE4D-208ENST00000502484 FOXO3O43524 673 aa10.58□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 CANXP27824 592 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 SBNO1A3KN83 1393 aa10.57□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 KIF1AQ12756 1690 aa10.57□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 FLT4P35916 1363 aa10.57□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 LTN1O94822 1766 aa10.56□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 LMOD3Q0VAK6 560 aa10.56□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.56□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 MAP3K19Q56UN5 1328 aa10.56□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 PSME1Q06323 249 aa10.56□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 AAMPQ13685 434 aa10.56□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 PANK1Q8TE04 598 aa10.56□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.55□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.55□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 BCL2L13Q9BXK5 485 aa10.55□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF10O15013 1369 aa10.55□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 COG6Q9Y2V7 657 aa10.55□□□□□ -0.72
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PDE4D-208ENST00000502484 MS4A1P11836 297 aa10.54□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 NLRP6P59044 892 aa10.54□□□□□ -0.72
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PDE4D-208ENST00000502484 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.54□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 IFT57Q9NWB7 429 aa10.54□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 NHSL1Q5SYE7 1610 aa10.54□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF853P0CG23 659 aa10.53□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 GNAI1P63096 354 aa10.53□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa10.53□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 CLUAP1Q96AJ1 413 aa10.53□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF428Q96B54 188 aa10.53□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 SOX12O15370 315 aa10.53□□□□□ -0.72
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PDE4D-208ENST00000502484 ALDH1L2Q3SY69 923 aa10.53□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.53□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 SSH1Q8WYL5 1049 aa10.53□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 SMC4Q9NTJ3 1288 aa10.53□□□□□ -0.72
PDE4D-208ENST00000502484 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
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PDE4D-208ENST00000502484 CFAP44Q96MT7 982 aa10.52□□□□□ -0.73
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PDE4D-208ENST00000502484 NFAT5O94916 1531 aa10.51□□□□□ -0.73
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PDE4D-208ENST00000502484 RTL1A6NKG5 1358 aa10.5□□□□□ -0.73
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PDE4D-208ENST00000502484 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-208ENST00000502484 MBIPQ9NS73 344 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-208ENST00000502484 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-208ENST00000502484 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-208ENST00000502484 FAM83GA6ND36 823 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM27P14373 513 aa10.5□□□□□ -0.73
PDE4D-208ENST00000502484 HOXC9P31274 260 aa10.5□□□□□ -0.73
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