RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.79□□□□□ -0.84
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UBE2B-202ENST00000499038 UPP2O95045 317 aa9.78□□□□□ -0.84
UBE2B-202ENST00000499038 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.78□□□□□ -0.84
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UBE2B-202ENST00000499038 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
UBE2B-202ENST00000499038 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.76□□□□□ -0.85
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UBE2B-202ENST00000499038 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-202ENST00000499038 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
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UBE2B-202ENST00000499038 BANK1Q8NDB2 785 aa9.7□□□□□ -0.86
UBE2B-202ENST00000499038 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.7□□□□□ -0.86
UBE2B-202ENST00000499038 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
UBE2B-202ENST00000499038 SOBPA7XYQ1 873 aa9.69□□□□□ -0.86
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UBE2B-202ENST00000499038 ESPNB1AK53 854 aa9.62□□□□□ -0.87
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UBE2B-202ENST00000499038 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
UBE2B-202ENST00000499038 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.59□□□□□ -0.87
UBE2B-202ENST00000499038 ADH1AP07327 375 aa9.58□□□□□ -0.88
UBE2B-202ENST00000499038 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
UBE2B-202ENST00000499038 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
UBE2B-202ENST00000499038 CYLDQ9NQC7 956 aa9.58□□□□□ -0.88
UBE2B-202ENST00000499038 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
UBE2B-202ENST00000499038 RNF20Q5VTR2 975 aa9.57□□□□□ -0.88
UBE2B-202ENST00000499038 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
UBE2B-202ENST00000499038 GPR37L1O60883 481 aa9.56□□□□□ -0.88
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UBE2B-202ENST00000499038 RNF217Q8TC41 542 aa9.5□□□□□ -0.89
UBE2B-202ENST00000499038 STK17AQ9UEE5 414 aa9.5□□□□□ -0.89
UBE2B-202ENST00000499038 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
UBE2B-202ENST00000499038 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBE2B-202ENST00000499038 MEN1O00255 615 aa9.48□□□□□ -0.89
UBE2B-202ENST00000499038 ERVK-9P63128 1117 aa9.48□□□□□ -0.89
UBE2B-202ENST00000499038 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.48□□□□□ -0.89
UBE2B-202ENST00000499038 ABL2P42684 1182 aa9.47□□□□□ -0.89
UBE2B-202ENST00000499038 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
UBE2B-202ENST00000499038 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.47□□□□□ -0.89
UBE2B-202ENST00000499038 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.47□□□□□ -0.89
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