RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498623.6

ARPC4-208, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 4, human

TSL 2 BASIC

Gene ARPC4, Length 942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARPC4-208	ENST00000498623	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		32.14	■■■□□ 2.74
ARPC4-208	ENST00000498623	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
ARPC4-208	ENST00000498623	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		32.14	■■■□□ 2.74
ARPC4-208	ENST00000498623	LTN1	O94822	1766 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ARPC4-208	ENST00000498623	TMF1	P82094	1093 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ARPC4-208	ENST00000498623	NME9	Q86XW9	330 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ARPC4-208	ENST00000498623	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
ARPC4-208	ENST00000498623	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ARPC4-208	ENST00000498623	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ARPC4-208	ENST00000498623	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ARPC4-208	ENST00000498623	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ARPC4-208	ENST00000498623	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ARPC4-208	ENST00000498623	SOX12	O15370	315 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ARPC4-208	ENST00000498623	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		32.07	■■■□□ 2.73
ARPC4-208	ENST00000498623	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ARPC4-208	ENST00000498623	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ARPC4-208	ENST00000498623	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ARPC4-208	ENST00000498623	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ARPC4-208	ENST00000498623	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ARPC4-208	ENST00000498623	CDCA8	Q53HL2	280 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ARPC4-208	ENST00000498623	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ARPC4-208	ENST00000498623	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ARPC4-208	ENST00000498623	BAG6	P46379	1132 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ARPC4-208	ENST00000498623	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
ARPC4-208	ENST00000498623	MYOM1	P52179	1685 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ARPC4-208	ENST00000498623	PEAK1	Q9H792	1746 aa		32	■■■□□ 2.71
ARPC4-208	ENST00000498623	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ARPC4-208	ENST00000498623	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
ARPC4-208	ENST00000498623	ERBB3	P21860	1342 aa		31.96	■■■□□ 2.71
ARPC4-208	ENST00000498623	CCDC7	Q96M83	1385 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ARPC4-208	ENST00000498623	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
ARPC4-208	ENST00000498623	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ARPC4-208	ENST00000498623	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		31.94	■■■□□ 2.7
ARPC4-208	ENST00000498623	SBF2	Q86WG5	1849 aa		31.93	■■■□□ 2.7
ARPC4-208	ENST00000498623	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
ARPC4-208	ENST00000498623	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		31.92	■■■□□ 2.7
ARPC4-208	ENST00000498623	COG3	Q96JB2	828 aa		31.92	■■■□□ 2.7
ARPC4-208	ENST00000498623	TRIM37	O94972	964 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ARPC4-208	ENST00000498623	DDB1	Q16531	1140 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ARPC4-208	ENST00000498623	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
ARPC4-208	ENST00000498623	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		31.88	■■■□□ 2.69
ARPC4-208	ENST00000498623	BCL9	O00512	1426 aa		31.86	■■■□□ 2.69
ARPC4-208	ENST00000498623	FYB1	O15117	783 aa		31.86	■■■□□ 2.69
ARPC4-208	ENST00000498623	IP6K1	Q92551	441 aa		31.86	■■■□□ 2.69
ARPC4-208	ENST00000498623	RREB1	Q92766	1687 aa		31.86	■■■□□ 2.69
ARPC4-208	ENST00000498623	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		31.84	■■■□□ 2.69
ARPC4-208	ENST00000498623	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
ARPC4-208	ENST00000498623	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		31.84	■■■□□ 2.69
ARPC4-208	ENST00000498623	TNS2	Q63HR2	1409 aa		31.83	■■■□□ 2.69
ARPC4-208	ENST00000498623	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		31.83	■■■□□ 2.69
ARPC4-208	ENST00000498623	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.82	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	APBA3	O96018	575 aa		31.82	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.81	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		31.81	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.81	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		31.79	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	EXOC5	O00471	708 aa		31.77	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	HOXC9	P31274	260 aa		31.77	■■■□□ 2.68
ARPC4-208	ENST00000498623	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
ARPC4-208	ENST00000498623	IL2RB	P14784	551 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ARPC4-208	ENST00000498623	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ARPC4-208	ENST00000498623	FBLN1	P23142	703 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ARPC4-208	ENST00000498623	AMPH	P49418	695 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ARPC4-208	ENST00000498623	LRP5	O75197	1615 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ARPC4-208	ENST00000498623	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ARPC4-208	ENST00000498623	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
ARPC4-208	ENST00000498623	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		31.7	■■■□□ 2.67
ARPC4-208	ENST00000498623	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		31.7	■■■□□ 2.67
ARPC4-208	ENST00000498623	NHS	Q6T4R5	1651 aa		31.7	■■■□□ 2.66
ARPC4-208	ENST00000498623	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
ARPC4-208	ENST00000498623	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
ARPC4-208	ENST00000498623	PLSCR1	O15162	318 aa		31.67	■■■□□ 2.66
ARPC4-208	ENST00000498623	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
ARPC4-208	ENST00000498623	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		31.66	■■■□□ 2.66
ARPC4-208	ENST00000498623	FLT4	P35916	1363 aa		31.65	■■■□□ 2.66
ARPC4-208	ENST00000498623	INSR	P06213	1382 aa		31.64	■■■□□ 2.66
ARPC4-208	ENST00000498623	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
ARPC4-208	ENST00000498623	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		31.63	■■■□□ 2.65
ARPC4-208	ENST00000498623	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
ARPC4-208	ENST00000498623	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
ARPC4-208	ENST00000498623	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		31.62	■■■□□ 2.65
ARPC4-208	ENST00000498623	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		31.61	■■■□□ 2.65
ARPC4-208	ENST00000498623	MEGF6	O75095	1541 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ARPC4-208	ENST00000498623	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		31.57	■■■□□ 2.64
ARPC4-208	ENST00000498623	NBPF14	Q5TI25	921 aa		31.57	■■■□□ 2.64
ARPC4-208	ENST00000498623	BTAF1	O14981	1849 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ARPC4-208	ENST00000498623	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ARPC4-208	ENST00000498623	NBPF4	Q96M43	638 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ARPC4-208	ENST00000498623	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ARPC4-208	ENST00000498623	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		31.54	■■■□□ 2.64
ARPC4-208	ENST00000498623	KCNQ2	O43526	872 aa		31.53	■■■□□ 2.64
ARPC4-208	ENST00000498623	PANK3	Q9H999	370 aa		31.53	■■■□□ 2.64
ARPC4-208	ENST00000498623	NSD2	O96028	1365 aa		31.52	■■■□□ 2.64
ARPC4-208	ENST00000498623	PROM2	Q8N271	834 aa		31.51	■■■□□ 2.63
ARPC4-208	ENST00000498623	NCAPD2	Q15021	1401 aa		31.5	■■■□□ 2.63

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