RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 SOX12O15370 315 aa33.13■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 PDE3BQ13370 1112 aa33.13■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM196AQ6ZSG2 479 aa33.13■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 ZRANB1Q9UGI0 708 aa33.13■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR17Q8IZU2 1322 aa33.12■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa33.12■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 NFAT5O94916 1531 aa33.1■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 BAG6P46379 1132 aa33.09■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 COL18A1P39060 1754 aa33.09■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 DEFB132Q7Z7B7 95 aa33.08■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.08■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCC6O95255 1503 aa33.07■■■□□ 2.89
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM182BQ5T319 152 aa33.07■■■□□ 2.88
CTDSP1-211ENST00000492545 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
CTDSP1-211ENST00000492545 USP54Q70EL1 1684 aa33.06■■■□□ 2.88
CTDSP1-211ENST00000492545 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa33.05■■■□□ 2.88
CTDSP1-211ENST00000492545 CARD10Q9BWT7 1032 aa33.05■■■□□ 2.88
CTDSP1-211ENST00000492545 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa33.02■■■□□ 2.88
CTDSP1-211ENST00000492545 OVOS2Q6IE36 1432 aa33.02■■■□□ 2.88
CTDSP1-211ENST00000492545 COG3Q96JB2 828 aa33.01■■■□□ 2.87
CTDSP1-211ENST00000492545 DDB1Q16531 1140 aa32.98■■■□□ 2.87
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC7Q96M83 1385 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDSP1-211ENST00000492545 DISP2A7MBM2 1401 aa32.97■■■□□ 2.87
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM37O94972 964 aa32.96■■■□□ 2.87
CTDSP1-211ENST00000492545 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
CTDSP1-211ENST00000492545 RGPD1P0DJD0 1748 aa32.95■■■□□ 2.87
CTDSP1-211ENST00000492545 ERBB3P21860 1342 aa32.95■■■□□ 2.86
CTDSP1-211ENST00000492545 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
CTDSP1-211ENST00000492545 IP6K1Q92551 441 aa32.92■■■□□ 2.86
CTDSP1-211ENST00000492545 FYB1O15117 783 aa32.91■■■□□ 2.86
CTDSP1-211ENST00000492545 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.91■■■□□ 2.86
CTDSP1-211ENST00000492545 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa32.89■■■□□ 2.86
CTDSP1-211ENST00000492545 APBA3O96018 575 aa32.89■■■□□ 2.86
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD24Q8TF21 1146 aa32.89■■■□□ 2.86
CTDSP1-211ENST00000492545 NLRP2Q9NX02 1062 aa32.89■■■□□ 2.86
CTDSP1-211ENST00000492545 RGPD5Q99666 1765 aa32.88■■■□□ 2.85
CTDSP1-211ENST00000492545 PARD3Q8TEW0 1356 aa32.88■■■□□ 2.85
CTDSP1-211ENST00000492545 EXOC5O00471 708 aa32.88■■■□□ 2.85
CTDSP1-211ENST00000492545 CAMKK2Q96RR4 588 aa32.85■■■□□ 2.85
CTDSP1-211ENST00000492545 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa32.85■■■□□ 2.85
CTDSP1-211ENST00000492545 LTN1O94822 1766 aa32.84■■■□□ 2.85
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP3K19Q56UN5 1328 aa32.83■■■□□ 2.85
CTDSP1-211ENST00000492545 AMPHP49418 695 aa32.83■■■□□ 2.85
CTDSP1-211ENST00000492545 GGNBP2Q9H3C7 697 aa32.83■■■□□ 2.85
CTDSP1-211ENST00000492545 BCL9O00512 1426 aa32.83■■■□□ 2.85
CTDSP1-211ENST00000492545 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.85
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRC37A3O60309 1634 aa32.82■■■□□ 2.84
CTDSP1-211ENST00000492545 IL2RBP14784 551 aa32.81■■■□□ 2.84
CTDSP1-211ENST00000492545 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
CTDSP1-211ENST00000492545 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
CTDSP1-211ENST00000492545 CARD14Q9BXL6 1004 aa32.81■■■□□ 2.84
CTDSP1-211ENST00000492545 HOXC9P31274 260 aa32.8■■■□□ 2.84
CTDSP1-211ENST00000492545 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
CTDSP1-211ENST00000492545 RTL1A6NKG5 1358 aa32.78■■■□□ 2.84
CTDSP1-211ENST00000492545 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
CTDSP1-211ENST00000492545 WNK3Q9BYP7 1800 aa32.77■■■□□ 2.84
CTDSP1-211ENST00000492545 PEAK1Q9H792 1746 aa32.76■■■□□ 2.83
CTDSP1-211ENST00000492545 TNS2Q63HR2 1409 aa32.75■■■□□ 2.83
CTDSP1-211ENST00000492545 FBLN1P23142 703 aa32.74■■■□□ 2.83
CTDSP1-211ENST00000492545 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
CTDSP1-211ENST00000492545 NSD3Q9BZ95 1437 aa32.74■■■□□ 2.83
CTDSP1-211ENST00000492545 PLSCR1O15162 318 aa32.73■■■□□ 2.83
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF24Q5T7B8 1368 aa32.72■■■□□ 2.83
CTDSP1-211ENST00000492545 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
CTDSP1-211ENST00000492545 CGNL1Q0VF96 1302 aa32.72■■■□□ 2.83
CTDSP1-211ENST00000492545 POLR3GLQ9BT43 218 aa32.71■■■□□ 2.83
CTDSP1-211ENST00000492545 MYOM1P52179 1685 aa32.71■■■□□ 2.83
CTDSP1-211ENST00000492545 NBPF14Q5TI25 921 aa32.68■■■□□ 2.82
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
CTDSP1-211ENST00000492545 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
CTDSP1-211ENST00000492545 INSRP06213 1382 aa32.64■■■□□ 2.82
CTDSP1-211ENST00000492545 FLT4P35916 1363 aa32.64■■■□□ 2.82
CTDSP1-211ENST00000492545 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
CTDSP1-211ENST00000492545 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF20BQ96Q89 1820 aa32.64■■■□□ 2.82
CTDSP1-211ENST00000492545 SBF2Q86WG5 1849 aa32.63■■■□□ 2.81
CTDSP1-211ENST00000492545 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa32.61■■■□□ 2.81
CTDSP1-211ENST00000492545 PTF1AQ7RTS3 328 aa32.6■■■□□ 2.81
CTDSP1-211ENST00000492545 PANK3Q9H999 370 aa32.6■■■□□ 2.81
CTDSP1-211ENST00000492545 NBPF6Q5VWK0 638 aa32.59■■■□□ 2.81
CTDSP1-211ENST00000492545 NBPF4Q96M43 638 aa32.59■■■□□ 2.81
CTDSP1-211ENST00000492545 RREB1Q92766 1687 aa32.57■■■□□ 2.8
CTDSP1-211ENST00000492545 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
CTDSP1-211ENST00000492545 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa32.56■■■□□ 2.8
CTDSP1-211ENST00000492545 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
CTDSP1-211ENST00000492545 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNQ2O43526 872 aa32.54■■■□□ 2.8
CTDSP1-211ENST00000492545 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa32.54■■■□□ 2.8
CTDSP1-211ENST00000492545 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa32.54■■■□□ 2.8
CTDSP1-211ENST00000492545 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.52■■■□□ 2.8
CTDSP1-211ENST00000492545 ACSBG1Q96GR2 724 aa32.52■■■□□ 2.8
CTDSP1-211ENST00000492545 NSD2O96028 1365 aa32.51■■■□□ 2.79
CTDSP1-211ENST00000492545 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
CTDSP1-211ENST00000492545 PROM2Q8N271 834 aa32.51■■■□□ 2.79
CTDSP1-211ENST00000492545 NUP188Q5SRE5 1749 aa32.5■■■□□ 2.79
CTDSP1-211ENST00000492545 TATP17735 454 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
CTDSP1-211ENST00000492545 TXNRD1Q16881 649 aa32.49■■■□□ 2.79
CTDSP1-211ENST00000492545 POLKQ9UBT6 870 aa32.49■■■□□ 2.79
CTDSP1-211ENST00000492545 LRP5O75197 1615 aa32.48■■■□□ 2.79
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