RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	USP47	Q96K76	1375 aa		24.22	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		24.21	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	DISP2	A7MBM2	1401 aa		24.21	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE3B	Q13370	1112 aa		24.21	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM182B	Q5T319	152 aa		24.21	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PP64	1363 aa		24.2	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	USP35	Q9P2H5	1018 aa		24.2	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		24.2	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	USP54	Q70EL1	1684 aa		24.2	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	24.19	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	NFAT5	O94916	1531 aa		24.19	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		24.18	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	COL18A1	P39060	1754 aa		24.18	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		24.17	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		24.16	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	NME9	Q86XW9	330 aa		24.16	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		24.16	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		24.15	■■□□□ 1.46
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		24.14	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC7	Q96M83	1385 aa		24.14	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		24.13	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		24.13	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	RGPD5	Q99666	1765 aa		24.11	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL9	O00512	1426 aa		24.11	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	DDB1	Q16531	1140 aa		24.11	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	24.1	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	24.1	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	COG3	Q96JB2	828 aa		24.1	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		24.09	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	ERBB3	P21860	1342 aa		24.09	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	SOX12	O15370	315 aa		24.08	■■□□□ 1.45
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM37	O94972	964 aa		24.07	■■□□□ 1.44
HDAC10-216	ENST00000489424	IP6K1	Q92551	441 aa		24.07	■■□□□ 1.44
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		24.07	■■□□□ 1.44
HDAC10-216	ENST00000489424	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		24.07	■■□□□ 1.44
HDAC10-216	ENST00000489424	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	24.06	■■□□□ 1.44
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOC5	O00471	708 aa		24.04	■■□□□ 1.44
HDAC10-216	ENST00000489424	FYB1	O15117	783 aa		24.03	■■□□□ 1.44
HDAC10-216	ENST00000489424	APBA3	O96018	575 aa		24.03	■■□□□ 1.44
HDAC10-216	ENST00000489424	PLSCR1	O15162	318 aa		24.01	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		24.01	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	24	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	24	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	24	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		24	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		23.99	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		23.99	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	RTL1	A6NKG5	1358 aa		23.99	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		23.99	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	IL2RB	P14784	551 aa		23.98	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	23.98	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	23.98	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		23.97	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	PEAK1	Q9H792	1746 aa		23.96	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC37A3	O60309	1634 aa		23.96	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	SBF2	Q86WG5	1849 aa		23.96	■■□□□ 1.43
HDAC10-216	ENST00000489424	TNS2	Q63HR2	1409 aa		23.95	■■□□□ 1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXC9	P31274	260 aa		23.95	■■□□□ 1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	AMPH	P49418	695 aa		23.95	■■□□□ 1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	LTN1	O94822	1766 aa		23.94	■■□□□ 1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF14	Q5TI25	921 aa		23.93	■■□□□ 1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		23.92	■■□□□ 1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		23.92	■■□□□ 1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	RREB1	Q92766	1687 aa		23.9	■■□□□ 1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		23.89	■■□□□ 1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	LRP5	O75197	1615 aa		23.89	■■□□□ 1.42
HDAC10-216	ENST00000489424	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	23.89	■■□□□ 1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		23.88	■■□□□ 1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	23.88	■■□□□ 1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	23.88	■■□□□ 1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	INSR	P06213	1382 aa		23.87	■■□□□ 1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	23.86	■■□□□ 1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		23.86	■■□□□ 1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		23.85	■■□□□ 1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	FLT4	P35916	1363 aa		23.85	■■□□□ 1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		23.85	■■□□□ 1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	23.84	■■□□□ 1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	23.83	■■□□□ 1.41
HDAC10-216	ENST00000489424	FBLN1	P23142	703 aa		23.82	■■□□□ 1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	MYOM1	P52179	1685 aa		23.82	■■□□□ 1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	23.81	■■□□□ 1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		23.8	■■□□□ 1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF4	Q96M43	638 aa		23.8	■■□□□ 1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	PROM2	Q8N271	834 aa		23.79	■■□□□ 1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	23.79	■■□□□ 1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		23.79	■■□□□ 1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	NSD2	O96028	1365 aa		23.78	■■□□□ 1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		23.78	■■□□□ 1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		23.78	■■□□□ 1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		23.77	■■□□□ 1.4
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		23.76	■■□□□ 1.39
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNRD1	Q16881	649 aa		23.76	■■□□□ 1.39
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNQ2	O43526	872 aa		23.75	■■□□□ 1.39
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		23.75	■■□□□ 1.39
HDAC10-216	ENST00000489424	PANK3	Q9H999	370 aa		23.74	■■□□□ 1.39
HDAC10-216	ENST00000489424	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		23.73	■■□□□ 1.39
HDAC10-216	ENST00000489424	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	23.73	■■□□□ 1.39
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	23.73	■■□□□ 1.39
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	23.73	■■□□□ 1.39
HDAC10-216	ENST00000489424	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		23.73	■■□□□ 1.39

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