RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487034.5

RPL13-208, Transcript of ribosomal protein L13, human

TSL 1 (best)

Gene RPL13, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL13-208	ENST00000487034	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		31.56	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.55	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		31.55	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		31.54	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		31.54	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		31.54	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	LTN1	O94822	1766 aa		31.53	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		31.53	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	BAG6	P46379	1132 aa		31.53	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	NME9	Q86XW9	330 aa		31.53	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	RREB1	Q92766	1687 aa		31.51	■■■□□ 2.64
RPL13-208	ENST00000487034	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		31.51	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	31.51	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	SOX12	O15370	315 aa		31.5	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	USP47	Q96K76	1375 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	TMC1	Q8TDI8	760 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	TRIM37	O94972	964 aa		31.48	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	SBF2	Q86WG5	1849 aa		31.47	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	LRP5	O75197	1615 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	PDE3B	Q13370	1112 aa		31.45	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		31.45	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
RPL13-208	ENST00000487034	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RPL13-208	ENST00000487034	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RPL13-208	ENST00000487034	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RPL13-208	ENST00000487034	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		31.42	■■■□□ 2.62
RPL13-208	ENST00000487034	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
RPL13-208	ENST00000487034	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RPL13-208	ENST00000487034	MYOM1	P52179	1685 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RPL13-208	ENST00000487034	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
RPL13-208	ENST00000487034	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		31.39	■■■□□ 2.62
RPL13-208	ENST00000487034	ERBB3	P21860	1342 aa		31.39	■■■□□ 2.62
RPL13-208	ENST00000487034	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		31.39	■■■□□ 2.62
RPL13-208	ENST00000487034	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		31.38	■■■□□ 2.61
RPL13-208	ENST00000487034	BCL9	O00512	1426 aa		31.37	■■■□□ 2.61
RPL13-208	ENST00000487034	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
RPL13-208	ENST00000487034	TNS2	Q63HR2	1409 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RPL13-208	ENST00000487034	CCDC7	Q96M83	1385 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RPL13-208	ENST00000487034	APBA3	O96018	575 aa		31.34	■■■□□ 2.61
RPL13-208	ENST00000487034	DDB1	Q16531	1140 aa		31.34	■■■□□ 2.61
RPL13-208	ENST00000487034	SLC24A1	O60721	1099 aa		31.32	■■■□□ 2.6
RPL13-208	ENST00000487034	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
RPL13-208	ENST00000487034	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
RPL13-208	ENST00000487034	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		31.31	■■■□□ 2.6
RPL13-208	ENST00000487034	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
RPL13-208	ENST00000487034	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		31.29	■■■□□ 2.6
RPL13-208	ENST00000487034	TMF1	P82094	1093 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RPL13-208	ENST00000487034	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RPL13-208	ENST00000487034	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
RPL13-208	ENST00000487034	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
RPL13-208	ENST00000487034	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		31.25	■■■□□ 2.59
RPL13-208	ENST00000487034	NHS	Q6T4R5	1651 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RPL13-208	ENST00000487034	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RPL13-208	ENST00000487034	IP6K1	Q92551	441 aa		31.22	■■■□□ 2.59
RPL13-208	ENST00000487034	FBLN1	P23142	703 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RPL13-208	ENST00000487034	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPL13-208	ENST00000487034	COG3	Q96JB2	828 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPL13-208	ENST00000487034	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPL13-208	ENST00000487034	FYB1	O15117	783 aa		31.19	■■■□□ 2.58
RPL13-208	ENST00000487034	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.19	■■■□□ 2.58
RPL13-208	ENST00000487034	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
RPL13-208	ENST00000487034	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		31.17	■■■□□ 2.58
RPL13-208	ENST00000487034	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.17	■■■□□ 2.58
RPL13-208	ENST00000487034	EXOC5	O00471	708 aa		31.16	■■■□□ 2.58
RPL13-208	ENST00000487034	PLSCR1	O15162	318 aa		31.16	■■■□□ 2.58
RPL13-208	ENST00000487034	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
RPL13-208	ENST00000487034	HOXC9	P31274	260 aa		31.16	■■■□□ 2.58
RPL13-208	ENST00000487034	IL2RB	P14784	551 aa		31.15	■■■□□ 2.58
RPL13-208	ENST00000487034	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		31.14	■■■□□ 2.58
RPL13-208	ENST00000487034	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		31.14	■■■□□ 2.58
RPL13-208	ENST00000487034	CDCA8	Q53HL2	280 aa		31.13	■■■□□ 2.57
RPL13-208	ENST00000487034	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		31.12	■■■□□ 2.57
RPL13-208	ENST00000487034	CASZ1	Q86V15	1759 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPL13-208	ENST00000487034	PROM2	Q8N271	834 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPL13-208	ENST00000487034	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPL13-208	ENST00000487034	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
RPL13-208	ENST00000487034	BTAF1	O14981	1849 aa		31.1	■■■□□ 2.57
RPL13-208	ENST00000487034	MEGF6	O75095	1541 aa		31.09	■■■□□ 2.57
RPL13-208	ENST00000487034	KCNQ2	O43526	872 aa		31.09	■■■□□ 2.57
RPL13-208	ENST00000487034	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
RPL13-208	ENST00000487034	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
RPL13-208	ENST00000487034	PAPPA	Q13219	1627 aa		31.07	■■■□□ 2.56
RPL13-208	ENST00000487034	AMPH	P49418	695 aa		31.04	■■■□□ 2.56
RPL13-208	ENST00000487034	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		31.02	■■■□□ 2.56
RPL13-208	ENST00000487034	NBPF14	Q5TI25	921 aa		31.02	■■■□□ 2.56
RPL13-208	ENST00000487034	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		31	■■■□□ 2.55
RPL13-208	ENST00000487034	INSR	P06213	1382 aa		31	■■■□□ 2.55
RPL13-208	ENST00000487034	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		31	■■■□□ 2.55
RPL13-208	ENST00000487034	FLT4	P35916	1363 aa		30.99	■■■□□ 2.55
RPL13-208	ENST00000487034	TXNRD1	Q16881	649 aa		30.98	■■■□□ 2.55
RPL13-208	ENST00000487034	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		30.98	■■■□□ 2.55
RPL13-208	ENST00000487034	NBPF4	Q96M43	638 aa		30.98	■■■□□ 2.55
RPL13-208	ENST00000487034	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		30.96	■■■□□ 2.55
RPL13-208	ENST00000487034	NCAPD2	Q15021	1401 aa		30.96	■■■□□ 2.55
RPL13-208	ENST00000487034	NSD2	O96028	1365 aa		30.94	■■■□□ 2.54
RPL13-208	ENST00000487034	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	30.94	■■■□□ 2.54

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