RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 WNK3Q9BYP7 1800 aa17.99■□□□□ 0.47
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PRAME-212ENST00000485532 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
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PRAME-212ENST00000485532 CD163L1Q9NR16 1453 aa17.97■□□□□ 0.47
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PRAME-212ENST00000485532 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa17.94■□□□□ 0.46
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PRAME-212ENST00000485532 RGPD2P0DJD1 1756 aa17.76■□□□□ 0.43
PRAME-212ENST00000485532 IP6K1Q92551 441 aa17.76■□□□□ 0.43
PRAME-212ENST00000485532 SPON1Q9HCB6 807 aa17.76■□□□□ 0.43
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PRAME-212ENST00000485532 NINLQ9Y2I6 1382 aa17.75■□□□□ 0.43
PRAME-212ENST00000485532 BTAF1O14981 1849 aa17.75■□□□□ 0.43
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PRAME-212ENST00000485532 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
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PRAME-212ENST00000485532 SHANK3Q9BYB0 1731 aa17.69■□□□□ 0.42
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PRAME-212ENST00000485532 KIF20BQ96Q89 1820 aa17.68■□□□□ 0.42
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PRAME-212ENST00000485532 USHBP1Q8N6Y0 703 aa17.66■□□□□ 0.42
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF827Q17R98 1081 aa17.65■□□□□ 0.42
PRAME-212ENST00000485532 NBPF6Q5VWK0 638 aa17.65■□□□□ 0.42
PRAME-212ENST00000485532 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
PRAME-212ENST00000485532 NBPF4Q96M43 638 aa17.65■□□□□ 0.42
PRAME-212ENST00000485532 KCNQ4P56696 695 aa17.64■□□□□ 0.41
PRAME-212ENST00000485532 CARD14Q9BXL6 1004 aa17.64■□□□□ 0.41
PRAME-212ENST00000485532 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
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