RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRE11P49959 708 aa20.01■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.01■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PZPP20742 1482 aa20.01■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FIBPO43427 364 aa20■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.99■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCM10Q7L590 875 aa19.97■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa19.97■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SDF4Q9BRK5 362 aa19.96■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP2B1P20020 1258 aa19.96■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DISP3Q9P2K9 1392 aa19.95■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEX14Q8IWB6 1497 aa19.95■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTMR7Q9Y216 660 aa19.95■□□□□ 0.78
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOMER1Q86YM7 354 aa19.94■□□□□ 0.78
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCA8O94911 1581 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NME9Q86XW9 330 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERICH2A1L162 156 aa19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMA5P28066 241 aa19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STK3Q13188 491 aa19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FMNL2Q96PY5 1086 aa19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.78
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TATP17735 454 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AMOTL1Q8IY63 956 aa19.89■□□□□ 0.77
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCM4P33991 863 aa19.88■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM5Q9C035 493 aa19.86■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GCC2Q8IWJ2 1684 aa19.86■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUTM1Q86Y26 1132 aa19.86■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STK11IPQ8N1F8 1099 aa19.86■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AACSQ86V21 672 aa19.85■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa19.85■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDCP20941 246 aa19.85■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa19.85■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USHBP1Q8N6Y0 703 aa19.85■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP7AQ04656 1500 aa19.84■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CABP4P57796 275 aa19.84■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM27P14373 513 aa19.84■□□□□ 0.77
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