RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-209ENST00000479976 TERF2IPQ9NYB0 399 aa40.13■■■■■ 4.01
CHTF18-209ENST00000479976 USP31Q70CQ4 1352 aa40.11■■■■■ 4.01
CHTF18-209ENST00000479976 WDR17Q8IZU2 1322 aa40.11■■■■■ 4.01
CHTF18-209ENST00000479976 DISP2A7MBM2 1401 aa40.09■■■■■ 4.01
CHTF18-209ENST00000479976 NME9Q86XW9 330 aa40.09■■■■■ 4.01
CHTF18-209ENST00000479976 NFAT5O94916 1531 aa40.09■■■■■ 4.01
CHTF18-209ENST00000479976 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
CHTF18-209ENST00000479976 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
CHTF18-209ENST00000479976 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
CHTF18-209ENST00000479976 A0A1W2PP64 1363 aa40.05■■■■■ 4
CHTF18-209ENST00000479976 RGPD5Q99666 1765 aa40.05■■■■■ 4
CHTF18-209ENST00000479976 APBA3O96018 575 aa40.02■■■■■ 4
CHTF18-209ENST00000479976 USP54Q70EL1 1684 aa40.02■■■■■ 4
CHTF18-209ENST00000479976 NINLQ9Y2I6 1382 aa40.01■■■■■ 4
CHTF18-209ENST00000479976 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa40.01■■■■■ 4
CHTF18-209ENST00000479976 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
CHTF18-209ENST00000479976 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
CHTF18-209ENST00000479976 CAMKK2Q96RR4 588 aa40■■■■□ 3.99
CHTF18-209ENST00000479976 CARD10Q9BWT7 1032 aa40■■■■□ 3.99
CHTF18-209ENST00000479976 DDB1Q16531 1140 aa39.99■■■■□ 3.99
CHTF18-209ENST00000479976 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
CHTF18-209ENST00000479976 ABCC6O95255 1503 aa39.97■■■■□ 3.99
CHTF18-209ENST00000479976 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.97■■■■□ 3.99
CHTF18-209ENST00000479976 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.96■■■■□ 3.99
CHTF18-209ENST00000479976 USP47Q96K76 1375 aa39.96■■■■□ 3.99
CHTF18-209ENST00000479976 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
CHTF18-209ENST00000479976 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.93■■■■□ 3.98
CHTF18-209ENST00000479976 TMF1P82094 1093 aa39.92■■■■□ 3.98
CHTF18-209ENST00000479976 PARD3Q8TEW0 1356 aa39.92■■■■□ 3.98
CHTF18-209ENST00000479976 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa39.91■■■■□ 3.98
CHTF18-209ENST00000479976 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa39.91■■■■□ 3.98
CHTF18-209ENST00000479976 OVOS2Q6IE36 1432 aa39.91■■■■□ 3.98
CHTF18-209ENST00000479976 LRRC37A3O60309 1634 aa39.91■■■■□ 3.98
CHTF18-209ENST00000479976 WNK3Q9BYP7 1800 aa39.88■■■■□ 3.98
CHTF18-209ENST00000479976 CCDC7Q96M83 1385 aa39.88■■■■□ 3.97
CHTF18-209ENST00000479976 PEAK1Q9H792 1746 aa39.88■■■■□ 3.97
CHTF18-209ENST00000479976 LTN1O94822 1766 aa39.87■■■■□ 3.97
CHTF18-209ENST00000479976 ERBB3P21860 1342 aa39.86■■■■□ 3.97
CHTF18-209ENST00000479976 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
CHTF18-209ENST00000479976 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
CHTF18-209ENST00000479976 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa39.84■■■■□ 3.97
CHTF18-209ENST00000479976 EXOC5O00471 708 aa39.83■■■■□ 3.97
CHTF18-209ENST00000479976 COG3Q96JB2 828 aa39.82■■■■□ 3.97
CHTF18-209ENST00000479976 NLRP2Q9NX02 1062 aa39.82■■■■□ 3.97
CHTF18-209ENST00000479976 CDCA8Q53HL2 280 aa39.8■■■■□ 3.96
CHTF18-209ENST00000479976 ANKRD24Q8TF21 1146 aa39.8■■■■□ 3.96
CHTF18-209ENST00000479976 SBF2Q86WG5 1849 aa39.79■■■■□ 3.96
CHTF18-209ENST00000479976 IP6K1Q92551 441 aa39.77■■■■□ 3.96
CHTF18-209ENST00000479976 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
CHTF18-209ENST00000479976 BCL9O00512 1426 aa39.76■■■■□ 3.96
CHTF18-209ENST00000479976 RREB1Q92766 1687 aa39.76■■■■□ 3.96
CHTF18-209ENST00000479976 LRP5O75197 1615 aa39.74■■■■□ 3.95
CHTF18-209ENST00000479976 PLSCR1O15162 318 aa39.73■■■■□ 3.95
CHTF18-209ENST00000479976 NBPF14Q5TI25 921 aa39.72■■■■□ 3.95
CHTF18-209ENST00000479976 IL2RBP14784 551 aa39.71■■■■□ 3.95
CHTF18-209ENST00000479976 PTF1AQ7RTS3 328 aa39.71■■■■□ 3.95
CHTF18-209ENST00000479976 FYB1O15117 783 aa39.7■■■■□ 3.95
CHTF18-209ENST00000479976 NUP188Q5SRE5 1749 aa39.69■■■■□ 3.94
CHTF18-209ENST00000479976 TNS2Q63HR2 1409 aa39.69■■■■□ 3.94
CHTF18-209ENST00000479976 FBLN1P23142 703 aa39.69■■■■□ 3.94
CHTF18-209ENST00000479976 MAP3K19Q56UN5 1328 aa39.68■■■■□ 3.94
CHTF18-209ENST00000479976 AMPHP49418 695 aa39.65■■■■□ 3.94
CHTF18-209ENST00000479976 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
CHTF18-209ENST00000479976 GGNBP2Q9H3C7 697 aa39.65■■■■□ 3.94
CHTF18-209ENST00000479976 HOXC9P31274 260 aa39.64■■■■□ 3.94
CHTF18-209ENST00000479976 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
CHTF18-209ENST00000479976 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa39.63■■■■□ 3.93
CHTF18-209ENST00000479976 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
CHTF18-209ENST00000479976 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
CHTF18-209ENST00000479976 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
CHTF18-209ENST00000479976 KCNQ2O43526 872 aa39.56■■■■□ 3.92
CHTF18-209ENST00000479976 PROM2Q8N271 834 aa39.56■■■■□ 3.92
CHTF18-209ENST00000479976 CARD14Q9BXL6 1004 aa39.56■■■■□ 3.92
CHTF18-209ENST00000479976 RTL1A6NKG5 1358 aa39.53■■■■□ 3.92
CHTF18-209ENST00000479976 MYOM1P52179 1685 aa39.52■■■■□ 3.92
CHTF18-209ENST00000479976 ACSBG1Q96GR2 724 aa39.52■■■■□ 3.92
CHTF18-209ENST00000479976 KIF20BQ96Q89 1820 aa39.5■■■■□ 3.91
CHTF18-209ENST00000479976 TXNRD1Q16881 649 aa39.48■■■■□ 3.91
CHTF18-209ENST00000479976 NHSQ6T4R5 1651 aa39.48■■■■□ 3.91
CHTF18-209ENST00000479976 NSD3Q9BZ95 1437 aa39.47■■■■□ 3.91
CHTF18-209ENST00000479976 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
CHTF18-209ENST00000479976 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP39.45■■■■□ 3.91
CHTF18-209ENST00000479976 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
CHTF18-209ENST00000479976 RGPD2P0DJD1 1756 aa39.45■■■■□ 3.91
CHTF18-209ENST00000479976 KAT6BQ8WYB5 2073 aa39.44■■■■□ 3.9
CHTF18-209ENST00000479976 NBPF6Q5VWK0 638 aa39.43■■■■□ 3.9
CHTF18-209ENST00000479976 NBPF4Q96M43 638 aa39.43■■■■□ 3.9
CHTF18-209ENST00000479976 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa39.41■■■■□ 3.9
CHTF18-209ENST00000479976 POLR3GLQ9BT43 218 aa39.4■■■■□ 3.9
CHTF18-209ENST00000479976 KIF24Q5T7B8 1368 aa39.4■■■■□ 3.9
CHTF18-209ENST00000479976 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
CHTF18-209ENST00000479976 INSRP06213 1382 aa39.39■■■■□ 3.9
CHTF18-209ENST00000479976 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
CHTF18-209ENST00000479976 FLT4P35916 1363 aa39.38■■■■□ 3.89
CHTF18-209ENST00000479976 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
CHTF18-209ENST00000479976 SPON1Q9HCB6 807 aa39.38■■■■□ 3.89
CHTF18-209ENST00000479976 CGNL1Q0VF96 1302 aa39.37■■■■□ 3.89
CHTF18-209ENST00000479976 BTAF1O14981 1849 aa39.35■■■■□ 3.89
CHTF18-209ENST00000479976 MEGF6O75095 1541 aa39.35■■■■□ 3.89
CHTF18-209ENST00000479976 USHBP1Q8N6Y0 703 aa39.34■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms