RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477768.1

URGCP-211, Transcript of upregulator of cell proliferation, humanhuman

TSL 4

Gene URGCP, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URGCP-211ENST00000477768 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.86■■■□□ 2.37
URGCP-211ENST00000477768 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
URGCP-211ENST00000477768 LTN1O94822 1766 aa29.85■■■□□ 2.37
URGCP-211ENST00000477768 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.85■■■□□ 2.37
URGCP-211ENST00000477768 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
URGCP-211ENST00000477768 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
URGCP-211ENST00000477768 PANK3Q9H999 370 aa29.84■■■□□ 2.37
URGCP-211ENST00000477768 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.84■■■□□ 2.37
URGCP-211ENST00000477768 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.84■■■□□ 2.37
URGCP-211ENST00000477768 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.83■■■□□ 2.37
URGCP-211ENST00000477768 USP35Q9P2H5 1018 aa29.82■■■□□ 2.36
URGCP-211ENST00000477768 A0A0G2JS52 829 aa29.75■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 MYT1Q01538 1121 aa29.75■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.74■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 EP400Q96L91 3159 aa29.74■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.73■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.73■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.73■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 CRB1P82279 1406 aa29.73■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
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URGCP-211ENST00000477768 ABCC6O95255 1503 aa29.72■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.72■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.72■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 CCDC7Q96M83 1385 aa29.72■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 IP6K1Q92551 441 aa29.71■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.7■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 BARGINQ6ZT62 677 aa29.7■■■□□ 2.35
URGCP-211ENST00000477768 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.68■■■□□ 2.34
URGCP-211ENST00000477768 HOXC9P31274 260 aa29.67■■■□□ 2.34
URGCP-211ENST00000477768 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.67■■■□□ 2.34
URGCP-211ENST00000477768 ERBB3P21860 1342 aa29.67■■■□□ 2.34
URGCP-211ENST00000477768 AMPHP49418 695 aa29.66■■■□□ 2.34
URGCP-211ENST00000477768 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
URGCP-211ENST00000477768 FAM182BQ5T319 152 aa29.65■■■□□ 2.34
URGCP-211ENST00000477768 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
URGCP-211ENST00000477768 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.65■■■□□ 2.34
URGCP-211ENST00000477768 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.65■■■□□ 2.34
URGCP-211ENST00000477768 PEAK1Q9H792 1746 aa29.63■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.61■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.61■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.61■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.59■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.59■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.58■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
URGCP-211ENST00000477768 RTL1A6NKG5 1358 aa29.57■■■□□ 2.32
URGCP-211ENST00000477768 POLKQ9UBT6 870 aa29.55■■■□□ 2.32
URGCP-211ENST00000477768 DISP2A7MBM2 1401 aa29.54■■■□□ 2.32
URGCP-211ENST00000477768 NSD2O96028 1365 aa29.54■■■□□ 2.32
URGCP-211ENST00000477768 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
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URGCP-211ENST00000477768 LRRC37A3O60309 1634 aa29.53■■■□□ 2.32
URGCP-211ENST00000477768 FLT4P35916 1363 aa29.52■■■□□ 2.32
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URGCP-211ENST00000477768 INSRP06213 1382 aa29.52■■■□□ 2.32
URGCP-211ENST00000477768 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
URGCP-211ENST00000477768 DDB1Q16531 1140 aa29.5■■■□□ 2.31
URGCP-211ENST00000477768 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.5■■■□□ 2.31
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URGCP-211ENST00000477768 NBPF4Q96M43 638 aa29.49■■■□□ 2.31
URGCP-211ENST00000477768 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
URGCP-211ENST00000477768 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
URGCP-211ENST00000477768 IL2RBP14784 551 aa29.46■■■□□ 2.31
URGCP-211ENST00000477768 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
URGCP-211ENST00000477768 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.46■■■□□ 2.31
URGCP-211ENST00000477768 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
URGCP-211ENST00000477768 CCDC125Q86Z20 511 aa29.45■■■□□ 2.31
URGCP-211ENST00000477768 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
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URGCP-211ENST00000477768 EXOC5O00471 708 aa29.43■■■□□ 2.3
URGCP-211ENST00000477768 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
URGCP-211ENST00000477768 TRIM37O94972 964 aa29.4■■■□□ 2.3
URGCP-211ENST00000477768 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.4■■■□□ 2.3
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URGCP-211ENST00000477768 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.36■■■□□ 2.29
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URGCP-211ENST00000477768 NCAPD2Q15021 1401 aa29.3■■■□□ 2.28
URGCP-211ENST00000477768 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
URGCP-211ENST00000477768 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.3■■■□□ 2.28
URGCP-211ENST00000477768 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.29■■■□□ 2.28
URGCP-211ENST00000477768 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.29■■■□□ 2.28
URGCP-211ENST00000477768 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
URGCP-211ENST00000477768 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
URGCP-211ENST00000477768 BCL9O00512 1426 aa29.28■■■□□ 2.28
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