RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 DDB1Q16531 1140 aa30.98■■■□□ 2.55
RBMS1-211ENST00000477486 SLC24A1O60721 1099 aa30.97■■■□□ 2.55
RBMS1-211ENST00000477486 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
RBMS1-211ENST00000477486 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.96■■■□□ 2.55
RBMS1-211ENST00000477486 COL18A1P39060 1754 aa30.95■■■□□ 2.55
RBMS1-211ENST00000477486 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
RBMS1-211ENST00000477486 CAMKK2Q96RR4 588 aa30.94■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 DISP2A7MBM2 1401 aa30.93■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.93■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 RGPD5Q99666 1765 aa30.92■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 TESK2Q96S53 571 aa30.92■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.92■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 USP31Q70CQ4 1352 aa30.92■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.91■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 A0A1W2PP64 1363 aa30.9■■■□□ 2.54
RBMS1-211ENST00000477486 NFAT5O94916 1531 aa30.88■■■□□ 2.53
RBMS1-211ENST00000477486 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa30.87■■■□□ 2.53
RBMS1-211ENST00000477486 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa30.87■■■□□ 2.53
RBMS1-211ENST00000477486 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.87■■■□□ 2.53
RBMS1-211ENST00000477486 EXOC5O00471 708 aa30.86■■■□□ 2.53
RBMS1-211ENST00000477486 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.86■■■□□ 2.53
RBMS1-211ENST00000477486 PARD3Q8TEW0 1356 aa30.86■■■□□ 2.53
RBMS1-211ENST00000477486 TMF1P82094 1093 aa30.85■■■□□ 2.53
RBMS1-211ENST00000477486 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.84■■■□□ 2.53
RBMS1-211ENST00000477486 NBPF14Q5TI25 921 aa30.84■■■□□ 2.53
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC7Q96M83 1385 aa30.82■■■□□ 2.52
RBMS1-211ENST00000477486 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa30.82■■■□□ 2.52
RBMS1-211ENST00000477486 USP47Q96K76 1375 aa30.81■■■□□ 2.52
RBMS1-211ENST00000477486 LRRC37A3O60309 1634 aa30.81■■■□□ 2.52
RBMS1-211ENST00000477486 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
RBMS1-211ENST00000477486 COG3Q96JB2 828 aa30.81■■■□□ 2.52
RBMS1-211ENST00000477486 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.79■■■□□ 2.52
RBMS1-211ENST00000477486 ABCC6O95255 1503 aa30.78■■■□□ 2.52
RBMS1-211ENST00000477486 ERBB3P21860 1342 aa30.77■■■□□ 2.52
RBMS1-211ENST00000477486 LTN1O94822 1766 aa30.77■■■□□ 2.52
RBMS1-211ENST00000477486 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
RBMS1-211ENST00000477486 CDCA8Q53HL2 280 aa30.76■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.76■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 USP54Q70EL1 1684 aa30.76■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 WNK3Q9BYP7 1800 aa30.75■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 PEAK1Q9H792 1746 aa30.73■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 IL2RBP14784 551 aa30.73■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 IP6K1Q92551 441 aa30.73■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.72■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 PLSCR1O15162 318 aa30.72■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 AMPHP49418 695 aa30.72■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 PTF1AQ7RTS3 328 aa30.72■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 LRP5O75197 1615 aa30.71■■■□□ 2.51
RBMS1-211ENST00000477486 SBF2Q86WG5 1849 aa30.7■■■□□ 2.5
RBMS1-211ENST00000477486 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.69■■■□□ 2.5
RBMS1-211ENST00000477486 RREB1Q92766 1687 aa30.68■■■□□ 2.5
RBMS1-211ENST00000477486 FBLN1P23142 703 aa30.68■■■□□ 2.5
RBMS1-211ENST00000477486 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.67■■■□□ 2.5
RBMS1-211ENST00000477486 NUP188Q5SRE5 1749 aa30.66■■■□□ 2.5
RBMS1-211ENST00000477486 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.66■■■□□ 2.5
RBMS1-211ENST00000477486 BCL9O00512 1426 aa30.64■■■□□ 2.5
RBMS1-211ENST00000477486 TNS2Q63HR2 1409 aa30.64■■■□□ 2.5
RBMS1-211ENST00000477486 FYB1O15117 783 aa30.64■■■□□ 2.5
RBMS1-211ENST00000477486 ACSBG1Q96GR2 724 aa30.64■■■□□ 2.5
RBMS1-211ENST00000477486 HOXC9P31274 260 aa30.63■■■□□ 2.49
RBMS1-211ENST00000477486 KCNQ2O43526 872 aa30.62■■■□□ 2.49
RBMS1-211ENST00000477486 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
RBMS1-211ENST00000477486 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
RBMS1-211ENST00000477486 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
RBMS1-211ENST00000477486 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.59■■■□□ 2.49
RBMS1-211ENST00000477486 KAT6BQ8WYB5 2073 aa30.59■■■□□ 2.49
RBMS1-211ENST00000477486 TXNRD1Q16881 649 aa30.58■■■□□ 2.49
RBMS1-211ENST00000477486 PROM2Q8N271 834 aa30.57■■■□□ 2.48
RBMS1-211ENST00000477486 SPON1Q9HCB6 807 aa30.55■■■□□ 2.48
RBMS1-211ENST00000477486 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
RBMS1-211ENST00000477486 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa30.55■■■□□ 2.48
RBMS1-211ENST00000477486 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
RBMS1-211ENST00000477486 STK32BQ9NY57 414 aa30.53■■■□□ 2.48
RBMS1-211ENST00000477486 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
RBMS1-211ENST00000477486 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.51■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 RTL1A6NKG5 1358 aa30.5■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 NBPF6Q5VWK0 638 aa30.47■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 NBPF4Q96M43 638 aa30.47■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.47■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 NHSQ6T4R5 1651 aa30.46■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.46■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 USHBP1Q8N6Y0 703 aa30.46■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa30.45■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa30.45■■■□□ 2.47
RBMS1-211ENST00000477486 RGPD2P0DJD1 1756 aa30.44■■■□□ 2.46
RBMS1-211ENST00000477486 SLC15A2Q16348 729 aa30.44■■■□□ 2.46
RBMS1-211ENST00000477486 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
RBMS1-211ENST00000477486 ZBTB7AO95365 584 aa30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms