RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 NUCB2P80303 420 aa21.98■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 RABEP1Q15276 862 aa21.97■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.97■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.97■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 STK26Q9P289 416 aa21.97■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 ADGRL1O94910 1474 aa21.96■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 TSC1Q92574 1164 aa21.96■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 USP26Q9BXU7 913 aa21.96■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 IL16Q14005 1332 aa21.96■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 EVC2Q86UK5 1308 aa21.96■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 TERF1P54274 439 aa21.95■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 KIF1BO60333 1816 aa21.95■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 VAMP4O75379 141 aa21.95■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 HMOX1P09601 288 aa21.94■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 HS1BP3Q53T59 392 aa21.94■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 A0A1W2PP64 1363 aa21.94■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 PRKAR2BP31323 418 aa21.94■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.93■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 FYB1O15117 783 aa21.93■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.93■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 DEPDC5O75140 1603 aa21.92■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.92■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.91■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 TTC22Q5TAA0 569 aa21.91■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 MED14O60244 1454 aa21.9■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 IFT172Q9UG01 1749 aa21.9■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.9■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 FAM177BA6PVY3 158 aa21.89■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PREB-208ENST00000468045 MAP7D2Q96T17 732 aa21.89■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 ADGRB1O14514 1584 aa21.88■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.88■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 SDSP20132 328 aa21.88■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 NSD2O96028 1365 aa21.88■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 USP32Q8NFA0 1604 aa21.88■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.87■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 DYNC1I1O14576 645 aa21.87■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.87■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.87■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.87■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 MBIPQ9NS73 344 aa21.86■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 GGT6Q6P531 493 aa21.86■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.86■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 ATP7AQ04656 1500 aa21.85■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.85■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 ST18O60284 1047 aa21.85■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 ABCC4O15439 1325 aa21.84■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.84■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.84■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 DCTPP1Q9H773 170 aa21.83■■□□□ 1.09
PREB-208ENST00000468045 FAM83GA6ND36 823 aa21.83■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 DCTN1Q14203 1278 aa21.82■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 FGD1P98174 961 aa21.82■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.82■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 PTCH1Q13635 1447 aa21.81■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 FCHSD2O94868 740 aa21.81■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 NEK4P51957 841 aa21.81■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.81■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.81■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 KRT24Q2M2I5 525 aa21.81■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.81■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 PIK3R4Q99570 1358 aa21.8■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 ADGRB3O60242 1522 aa21.8■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 TMX3Q96JJ7 454 aa21.79■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 MCM5P33992 734 aa21.79■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 NFE2L2Q16236 605 aa21.78■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.78■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.78■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 TSPY26PQ9H489 355 aa21.78■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.78■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.77■■□□□ 1.08
PREB-208ENST00000468045 CBX1P83916 185 aa21.76■■□□□ 1.07
PREB-208ENST00000468045 GLI2P10070 1586 aa21.76■■□□□ 1.07
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