RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CB-208	ENST00000455580	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
PPP1CB-208	ENST00000455580	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PPP1CB-208	ENST00000455580	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PPP1CB-208	ENST00000455580	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PPP1CB-208	ENST00000455580	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PPP1CB-208	ENST00000455580	NFAT5	O94916	1531 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PPP1CB-208	ENST00000455580	BAG6	P46379	1132 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMF1	P82094	1093 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PPP1CB-208	ENST00000455580	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP54	Q70EL1	1684 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PPP1CB-208	ENST00000455580	TRIM37	O94972	964 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	ABCC6	O95255	1503 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	RGPD5	Q99666	1765 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	CDCA8	Q53HL2	280 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	DDB1	Q16531	1140 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PPP1CB-208	ENST00000455580	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
PPP1CB-208	ENST00000455580	COG3	Q96JB2	828 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PPP1CB-208	ENST00000455580	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
PPP1CB-208	ENST00000455580	APBA3	O96018	575 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP1CB-208	ENST00000455580	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP1CB-208	ENST00000455580	ERBB3	P21860	1342 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCDC7	Q96M83	1385 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PPP1CB-208	ENST00000455580	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PPP1CB-208	ENST00000455580	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PPP1CB-208	ENST00000455580	IP6K1	Q92551	441 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PPP1CB-208	ENST00000455580	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PPP1CB-208	ENST00000455580	LTN1	O94822	1766 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PPP1CB-208	ENST00000455580	FYB1	O15117	783 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PPP1CB-208	ENST00000455580	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PPP1CB-208	ENST00000455580	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PPP1CB-208	ENST00000455580	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
PPP1CB-208	ENST00000455580	EXOC5	O00471	708 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PPP1CB-208	ENST00000455580	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PPP1CB-208	ENST00000455580	FBLN1	P23142	703 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PPP1CB-208	ENST00000455580	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PPP1CB-208	ENST00000455580	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PPP1CB-208	ENST00000455580	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PPP1CB-208	ENST00000455580	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PPP1CB-208	ENST00000455580	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
PPP1CB-208	ENST00000455580	BCL9	O00512	1426 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PPP1CB-208	ENST00000455580	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PPP1CB-208	ENST00000455580	IL2RB	P14784	551 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	HOXC9	P31274	260 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	AMPH	P49418	695 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	33.38	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	PLSCR1	O15162	318 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	TNS2	Q63HR2	1409 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYOM1	P52179	1685 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	SBF2	Q86WG5	1849 aa		33.32	■■■□□ 2.93
PPP1CB-208	ENST00000455580	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PPP1CB-208	ENST00000455580	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PPP1CB-208	ENST00000455580	RREB1	Q92766	1687 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PPP1CB-208	ENST00000455580	NBPF14	Q5TI25	921 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PPP1CB-208	ENST00000455580	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PPP1CB-208	ENST00000455580	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PPP1CB-208	ENST00000455580	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PPP1CB-208	ENST00000455580	KCNQ2	O43526	872 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PPP1CB-208	ENST00000455580	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PPP1CB-208	ENST00000455580	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PPP1CB-208	ENST00000455580	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PPP1CB-208	ENST00000455580	PROM2	Q8N271	834 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PPP1CB-208	ENST00000455580	NBPF4	Q96M43	638 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PPP1CB-208	ENST00000455580	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PPP1CB-208	ENST00000455580	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.2	■■■□□ 2.9
PPP1CB-208	ENST00000455580	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PPP1CB-208	ENST00000455580	INSR	P06213	1382 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PPP1CB-208	ENST00000455580	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
PPP1CB-208	ENST00000455580	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PPP1CB-208	ENST00000455580	FLT4	P35916	1363 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PPP1CB-208	ENST00000455580	LRP5	O75197	1615 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PPP1CB-208	ENST00000455580	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PPP1CB-208	ENST00000455580	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PPP1CB-208	ENST00000455580	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PPP1CB-208	ENST00000455580	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PPP1CB-208	ENST00000455580	PANK3	Q9H999	370 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PPP1CB-208	ENST00000455580	TXNRD1	Q16881	649 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
PPP1CB-208	ENST00000455580	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PPP1CB-208	ENST00000455580	NHS	Q6T4R5	1651 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PPP1CB-208	ENST00000455580	MEGF6	O75095	1541 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PPP1CB-208	ENST00000455580	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
PPP1CB-208	ENST00000455580	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.07	■■■□□ 2.88

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