RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAMKK2Q96RR4 588 aa37.06■■■■□ 3.52
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFAT5O94916 1531 aa37.05■■■■□ 3.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa37.02■■■■□ 3.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP31Q70CQ4 1352 aa37.02■■■■□ 3.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARD3Q8TEW0 1356 aa37.02■■■■□ 3.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGPD5Q99666 1765 aa37.01■■■■□ 3.52
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NME9Q86XW9 330 aa36.99■■■■□ 3.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRP5O75197 1615 aa36.99■■■■□ 3.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TERF2IPQ9NYB0 399 aa36.98■■■■□ 3.51
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OVOS2Q6IE36 1432 aa36.98■■■■□ 3.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP54Q70EL1 1684 aa36.97■■■■□ 3.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARD10Q9BWT7 1032 aa36.97■■■■□ 3.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCC6O95255 1503 aa36.96■■■■□ 3.51
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNK3Q9BYP7 1800 aa36.96■■■■□ 3.51
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TESK2Q96S53 571 aa36.94■■■■□ 3.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PP64 1363 aa36.93■■■■□ 3.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RREB1Q92766 1687 aa36.91■■■■□ 3.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC24A1O60721 1099 aa36.91■■■■□ 3.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC7Q96M83 1385 aa36.88■■■■□ 3.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.88■■■■□ 3.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP188Q5SRE5 1749 aa36.85■■■■□ 3.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LTN1O94822 1766 aa36.85■■■■□ 3.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SBF2Q86WG5 1849 aa36.85■■■■□ 3.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF14Q5TI25 921 aa36.83■■■■□ 3.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EXOC5O00471 708 aa36.82■■■■□ 3.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERBB3P21860 1342 aa36.82■■■■□ 3.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL9O00512 1426 aa36.79■■■■□ 3.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRP2Q9NX02 1062 aa36.79■■■■□ 3.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLSCR1O15162 318 aa36.77■■■■□ 3.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD24Q8TF21 1146 aa36.77■■■■□ 3.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP47Q96K76 1375 aa36.77■■■■□ 3.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa36.76■■■■□ 3.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTF1AQ7RTS3 328 aa36.75■■■■□ 3.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNS2Q63HR2 1409 aa36.75■■■■□ 3.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMF1P82094 1093 aa36.74■■■■□ 3.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COG3Q96JB2 828 aa36.72■■■■□ 3.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa36.71■■■■□ 3.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IP6K1Q92551 441 aa36.7■■■■□ 3.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL2RBP14784 551 aa36.69■■■■□ 3.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.64■■■■□ 3.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDCA8Q53HL2 280 aa36.62■■■■□ 3.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K19Q56UN5 1328 aa36.61■■■■□ 3.45
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PROM2Q8N271 834 aa36.6■■■■□ 3.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNQ2O43526 872 aa36.59■■■■□ 3.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMPHP49418 695 aa36.59■■■■□ 3.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.59■■■■□ 3.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBLN1P23142 703 aa36.58■■■■□ 3.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXC9P31274 260 aa36.58■■■■□ 3.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.58■■■■□ 3.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NHSQ6T4R5 1651 aa36.58■■■■□ 3.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACSBG1Q96GR2 724 aa36.57■■■■□ 3.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FYB1O15117 783 aa36.56■■■■□ 3.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TXNRD1Q16881 649 aa36.55■■■■□ 3.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GGNBP2Q9H3C7 697 aa36.55■■■■□ 3.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPON1Q9HCB6 807 aa36.54■■■■□ 3.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTL1A6NKG5 1358 aa36.51■■■■□ 3.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STK32BQ9NY57 414 aa36.47■■■■□ 3.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF20BQ96Q89 1820 aa36.46■■■■□ 3.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASZ1Q86V15 1759 aa36.45■■■■□ 3.43
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGPD2P0DJD1 1756 aa36.44■■■■□ 3.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYOM1P52179 1685 aa36.44■■■■□ 3.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KAT6BQ8WYB5 2073 aa36.43■■■■□ 3.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC15A2Q16348 729 aa36.42■■■■□ 3.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARD14Q9BXL6 1004 aa36.41■■■■□ 3.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF6Q5VWK0 638 aa36.38■■■■□ 3.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF4Q96M43 638 aa36.38■■■■□ 3.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSD3Q9BZ95 1437 aa36.38■■■■□ 3.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEGF6O75095 1541 aa36.37■■■■□ 3.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB7AO95365 584 aa36.35■■■■□ 3.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INSRP06213 1382 aa36.35■■■■□ 3.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FLT4P35916 1363 aa36.34■■■■□ 3.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF24Q5T7B8 1368 aa36.34■■■■□ 3.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa36.33■■■■□ 3.41
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