RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436744.2

NICN1-204, Transcript of nicolin 1, humanhuman

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Gene NICN1, Length 1,271 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-204ENST00000436744 RGPD5Q99666 1765 aa24.74■■□□□ 1.55
NICN1-204ENST00000436744 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NICN1-204ENST00000436744 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.73■■□□□ 1.55
NICN1-204ENST00000436744 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NICN1-204ENST00000436744 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NICN1-204ENST00000436744 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.72■■□□□ 1.55
NICN1-204ENST00000436744 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.71■■□□□ 1.55
NICN1-204ENST00000436744 CASZ1Q86V15 1759 aa24.71■■□□□ 1.55
NICN1-204ENST00000436744 PLSCR1O15162 318 aa24.7■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 PROM2Q8N271 834 aa24.7■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 AKAP12Q02952 1782 aa24.7■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.69■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 EVC2Q86UK5 1308 aa24.68■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.68■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.68■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 UTRNP46939 3433 aa24.68■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.68■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 ZBTB7AO95365 584 aa24.67■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.67■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.66■■□□□ 1.54
NICN1-204ENST00000436744 NFAT5O94916 1531 aa24.64■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 MYOM1P52179 1685 aa24.63■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.63■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.61■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 BCL9O00512 1426 aa24.61■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 TXNRD1Q16881 649 aa24.6■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 PTGER2P43116 358 aa24.59■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.58■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 EXOC5O00471 708 aa24.58■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 NEUROD1Q13562 356 aa24.58■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
NICN1-204ENST00000436744 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.58■■□□□ 1.52
NICN1-204ENST00000436744 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.57■■□□□ 1.52
NICN1-204ENST00000436744 STK32BQ9NY57 414 aa24.57■■□□□ 1.52
NICN1-204ENST00000436744 TNS2Q63HR2 1409 aa24.57■■□□□ 1.52
NICN1-204ENST00000436744 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.56■■□□□ 1.52
NICN1-204ENST00000436744 CCDC7Q96M83 1385 aa24.54■■□□□ 1.52
NICN1-204ENST00000436744 SLC15A2Q16348 729 aa24.54■■□□□ 1.52
NICN1-204ENST00000436744 NHSQ6T4R5 1651 aa24.53■■□□□ 1.52
NICN1-204ENST00000436744 NME9Q86XW9 330 aa24.53■■□□□ 1.52
NICN1-204ENST00000436744 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.51■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.51■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 LTN1O94822 1766 aa24.5■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 ERBB3P21860 1342 aa24.5■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 ABCC6O95255 1503 aa24.49■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.48■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 USP31Q70CQ4 1352 aa24.47■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 SYT17Q9BSW7 474 aa24.47■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.47■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 BTAF1O14981 1849 aa24.47■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 USP54Q70EL1 1684 aa24.46■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 PAPPAQ13219 1627 aa24.46■■□□□ 1.51
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NICN1-204ENST00000436744 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.46■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 MTFR1LQ9H019 292 aa24.46■■□□□ 1.51
NICN1-204ENST00000436744 IL2RBP14784 551 aa24.45■■□□□ 1.5
NICN1-204ENST00000436744 ZNF827Q17R98 1081 aa24.45■■□□□ 1.5
NICN1-204ENST00000436744 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.45■■□□□ 1.5
NICN1-204ENST00000436744 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NICN1-204ENST00000436744 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.43■■□□□ 1.5
NICN1-204ENST00000436744 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
NICN1-204ENST00000436744 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.42■■□□□ 1.5
NICN1-204ENST00000436744 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.4■■□□□ 1.5
NICN1-204ENST00000436744 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
NICN1-204ENST00000436744 ARXQ96QS3 562 aa24.39■■□□□ 1.49
NICN1-204ENST00000436744 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
NICN1-204ENST00000436744 A0A1W2PP64 1363 aa24.38■■□□□ 1.49
NICN1-204ENST00000436744 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NICN1-204ENST00000436744 KCNQ4P56696 695 aa24.36■■□□□ 1.49
NICN1-204ENST00000436744 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NICN1-204ENST00000436744 KLHL34Q8N239 644 aa24.34■■□□□ 1.49
NICN1-204ENST00000436744 FBLN1P23142 703 aa24.33■■□□□ 1.49
NICN1-204ENST00000436744 CHD4Q14839 1912 aa24.33■■□□□ 1.49
NICN1-204ENST00000436744 AKT1S1Q96B36 256 aa24.32■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.31■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 IP6K1Q92551 441 aa24.31■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.3■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.3■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.3■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.29■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 MAP3K5Q99683 1374 aa24.28■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.27■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.27■■□□□ 1.48
NICN1-204ENST00000436744 GPR162Q16538 588 aa24.26■■□□□ 1.47
NICN1-204ENST00000436744 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NICN1-204ENST00000436744 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.26■■□□□ 1.47
NICN1-204ENST00000436744 HOXC9P31274 260 aa24.25■■□□□ 1.47
NICN1-204ENST00000436744 NSD2O96028 1365 aa24.25■■□□□ 1.47
NICN1-204ENST00000436744 MEGF6O75095 1541 aa24.25■■□□□ 1.47
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