RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428361.5

CTDSP1-202, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 842 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-202ENST00000428361 USP31Q70CQ4 1352 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP1-202ENST00000428361 TRIM37O94972 964 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP1-202ENST00000428361 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTDSP1-202ENST00000428361 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP1-202ENST00000428361 COL18A1P39060 1754 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP1-202ENST00000428361 SOX12O15370 315 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP1-202ENST00000428361 APBA3O96018 575 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP1-202ENST00000428361 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
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CTDSP1-202ENST00000428361 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP1-202ENST00000428361 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP1-202ENST00000428361 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 USP54Q70EL1 1684 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 DDB1Q16531 1140 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 NFAT5O94916 1531 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 CCDC7Q96M83 1385 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.73■■□□□ 1.07
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CTDSP1-202ENST00000428361 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 A0A1W2PP64 1363 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 LRRC37A3O60309 1634 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 LRP5O75197 1615 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 NME9Q86XW9 330 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 TESK2Q96S53 571 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDSP1-202ENST00000428361 TMF1P82094 1093 aa21.7■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.69■■□□□ 1.06
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CTDSP1-202ENST00000428361 CDCA8Q53HL2 280 aa21.69■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 NBPF14Q5TI25 921 aa21.69■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 BCL9O00512 1426 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 USP47Q96K76 1375 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 RGPD5Q99666 1765 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 ERBB3P21860 1342 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 EXOC5O00471 708 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 COG3Q96JB2 828 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 PEAK1Q9H792 1746 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 LTN1O94822 1766 aa21.64■■□□□ 1.06
CTDSP1-202ENST00000428361 RREB1Q92766 1687 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDSP1-202ENST00000428361 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CTDSP1-202ENST00000428361 PLSCR1O15162 318 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDSP1-202ENST00000428361 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDSP1-202ENST00000428361 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CTDSP1-202ENST00000428361 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDSP1-202ENST00000428361 TNS2Q63HR2 1409 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDSP1-202ENST00000428361 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP1-202ENST00000428361 IL2RBP14784 551 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDSP1-202ENST00000428361 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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CTDSP1-202ENST00000428361 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.59■■□□□ 1.05
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CTDSP1-202ENST00000428361 AMPHP49418 695 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDSP1-202ENST00000428361 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDSP1-202ENST00000428361 RTL1A6NKG5 1358 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDSP1-202ENST00000428361 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.52■■□□□ 1.03
CTDSP1-202ENST00000428361 HOXC9P31274 260 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP1-202ENST00000428361 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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CTDSP1-202ENST00000428361 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP1-202ENST00000428361 SPON1Q9HCB6 807 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP1-202ENST00000428361 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.47■■□□□ 1.03
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CTDSP1-202ENST00000428361 STK32BQ9NY57 414 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP1-202ENST00000428361 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KCNQ2O43526 872 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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CTDSP1-202ENST00000428361 FLT4P35916 1363 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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CTDSP1-202ENST00000428361 INSRP06213 1382 aa21.41■■□□□ 1.02
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CTDSP1-202ENST00000428361 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 MYOM1P52179 1685 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SLC15A2Q16348 729 aa21.39■■□□□ 1.01
CTDSP1-202ENST00000428361 FBLN1P23142 703 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDSP1-202ENST00000428361 BTAF1O14981 1849 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDSP1-202ENST00000428361 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDSP1-202ENST00000428361 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CTDSP1-202ENST00000428361 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CTDSP1-202ENST00000428361 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP1-202ENST00000428361 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.36■■□□□ 1.01
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