RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTFR1LQ9H019 292 aa24.28■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.28■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC15A2Q16348 729 aa24.27■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.27■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TXNRD1Q16881 649 aa24.26■■□□□ 1.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.26■■□□□ 1.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.24■■□□□ 1.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHD4Q14839 1912 aa24.23■■□□□ 1.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.23■■□□□ 1.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UTRNP46939 3433 aa24.22■■□□□ 1.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.21■■□□□ 1.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP3K5Q99683 1374 aa24.2■■□□□ 1.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLRP6P59044 892 aa24.2■■□□□ 1.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARXQ96QS3 562 aa24.2■■□□□ 1.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.19■■□□□ 1.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLIT3O75094 1523 aa24.16■■□□□ 1.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKAP12Q02952 1782 aa24.16■■□□□ 1.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXOC5O00471 708 aa24.15■■□□□ 1.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR162Q16538 588 aa24.14■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.14■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.14■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP6P35125 1406 aa24.13■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.13■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.11■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.1■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL18A1P39060 1754 aa24.1■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.09■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CABP2Q9NPB3 220 aa24.09■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC7Q96M83 1385 aa24.08■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.08■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CABP1Q9NZU7 370 aa24.08■■□□□ 1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNS2Q63HR2 1409 aa24.06■■□□□ 1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.05■■□□□ 1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.05■■□□□ 1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NHSQ6T4R5 1651 aa24.04■■□□□ 1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAPPAQ13219 1627 aa24.03■■□□□ 1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLD1P28340 1107 aa24.03■■□□□ 1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIK3C2AO00443 1686 aa24.02■■□□□ 1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.01■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.01■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLHL34Q8N239 644 aa24■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.99■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF827Q17R98 1081 aa23.99■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.99■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCC6O95255 1503 aa23.99■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP350Q5VT06 3117 aa23.98■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOX12O15370 315 aa23.97■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.96■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.96■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRIN3BO60391 1043 aa23.96■■□□□ 1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.95■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.95■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGPD5Q99666 1765 aa23.95■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.94■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKT1S1Q96B36 256 aa23.94■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EVC2Q86UK5 1308 aa23.93■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL2RBP14784 551 aa23.93■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BTAF1O14981 1849 aa23.91■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NFAT5O94916 1531 aa23.91■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.91■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.9■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERBB3P21860 1342 aa23.89■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.89■■□□□ 1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.89■■□□□ 1.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.89■■□□□ 1.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.89■■□□□ 1.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP10DQ9P241 1426 aa23.84■■□□□ 1.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPA6P17066 643 aa23.82■■□□□ 1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP31Q70CQ4 1352 aa23.8■■□□□ 1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.8■■□□□ 1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.77■■□□□ 1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MSH5O43196 834 aa23.76■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.75■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNQ4P56696 695 aa23.74■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.74■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.73■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADCY9O60503 1353 aa23.72■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP54Q70EL1 1684 aa23.72■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LTN1O94822 1766 aa23.7■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.7■■□□□ 1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NME9Q86XW9 330 aa23.7■■□□□ 1.38
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