RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 SOX12O15370 315 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 SMC5Q8IY18 1101 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 COG3Q96JB2 828 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 DLG5Q8TDM6 1919 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 GSE1Q14687 1217 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 KRT24Q2M2I5 525 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 ALDH1L2Q3SY69 923 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 LTKP29376 864 aa19.72■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 ZNF853P0CG23 659 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 MON2Q7Z3U7 1717 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
NISCH-202ENST00000420808 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 TNRQ92752 1358 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 ANTXR1Q9H6X2 564 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 C3P01024 1663 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 SIRT2Q8IXJ6 389 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 NUCB1Q02818 461 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 IFT57Q9NWB7 429 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 AATKQ6ZMQ8 1374 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 GNAI1P63096 354 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 TMEM2Q9UHN6 1383 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 BECN1Q14457 450 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 C22orf23Q9BZE7 217 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 ACEP12821 1306 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 AKAP12Q02952 1782 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 MCM10Q7L590 875 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 CHD1LQ86WJ1 897 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 TECPR2O15040 1411 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 CFAP44Q96MT7 982 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 ITSN1Q15811 1721 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 UBR1Q8IWV7 1749 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 ANKRD45Q5TZF3 282 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 PTCH1Q13635 1447 aa19.64■□□□□ 0.74
NISCH-202ENST00000420808 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 MIS18AQ9NYP9 233 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 PTPRUQ92729 1446 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 ABCC4O15439 1325 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 PEAK1Q9H792 1746 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 FOXO3O43524 673 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 PIK3R4Q99570 1358 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 ZNF428Q96B54 188 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 SIRT1Q96EB6 747 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 ARHGAP45Q92619 1136 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 NRKQ7Z2Y5 1582 aa19.58■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa19.58■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 OVOS2Q6IE36 1432 aa19.58■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
NISCH-202ENST00000420808 HDGFP51858 240 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 USP6P35125 1406 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 LMOD3Q0VAK6 560 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.55■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 MAP3K19Q56UN5 1328 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 PLEKHG3A1L390 1219 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 NUTM2GQ5VZR2 741 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 RGS12O14924 1447 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 CHL1O00533 1208 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 GCC1Q96CN9 775 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 KIF2CQ99661 725 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 APBB1O00213 710 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-202ENST00000420808 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
NISCH-202ENST00000420808 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
NISCH-202ENST00000420808 ARXQ96QS3 562 aa19.51■□□□□ 0.71
NISCH-202ENST00000420808 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
NISCH-202ENST00000420808 G2E3Q7L622 706 aa19.5■□□□□ 0.71
NISCH-202ENST00000420808 MSH6P52701 1360 aa19.5■□□□□ 0.71
NISCH-202ENST00000420808 SSH2Q76I76 1423 aa19.5■□□□□ 0.71
NISCH-202ENST00000420808 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
NISCH-202ENST00000420808 RBM25P49756 843 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
NISCH-202ENST00000420808 MEIS3Q99687 375 aa19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms