RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 SEMA3FQ13275 785 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-202ENST00000370826 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-202ENST00000370826 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-202ENST00000370826 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGGTB-202ENST00000370826 GLMNQ92990 594 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 TREML4Q6UXN2 200 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 MPNDQ8N594 471 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF592Q92610 1267 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK15Q96Q40 435 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 GRM5P41594 1212 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 ARID5BQ14865 1188 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 DACH1Q9UI36 760 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP4X1Q8N118 509 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-202ENST00000370826 ESPNB1AK53 854 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 ALDH1A1P00352 501 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 UCN2Q96RP3 112 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 PIK3CDO00329 1044 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 AXIN1O15169 862 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 ADH1CP00326 375 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 J3QL48 77 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 WFS1O76024 890 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 FSHRP23945 695 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 NR5A1Q13285 461 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF20Q5VTR2 975 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF135Q8IUD6 432 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.68□□□□□ -1.18
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RABGGTB-202ENST00000370826 RAB15P59190 212 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGGTB-202ENST00000370826 AVPP01185 164 aa7.66□□□□□ -1.18
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RABGGTB-202ENST00000370826 SKIP12755 728 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC125Q86Z20 511 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP9BO43861 1147 aa7.65□□□□□ -1.18
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RABGGTB-202ENST00000370826 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-202ENST00000370826 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.64□□□□□ -1.19
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RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 ARID3AQ99856 593 aa7.64□□□□□ -1.19
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RABGGTB-202ENST00000370826 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
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RABGGTB-202ENST00000370826 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.63□□□□□ -1.19
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RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L5A8MUK1 530 aa7.62□□□□□ -1.19
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RABGGTB-202ENST00000370826 HPS1Q92902 700 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L3A6NCW0 530 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L4A6NCW7 530 aa7.61□□□□□ -1.19
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RABGGTB-202ENST00000370826 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.61□□□□□ -1.19
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RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 NCOA4Q13772 614 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-202ENST00000370826 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.6□□□□□ -1.19
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