RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 NSD2O96028 1365 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-201ENST00000351328 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-201ENST00000351328 COG3Q96JB2 828 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-201ENST00000351328 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-201ENST00000351328 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 JCADQ9P266 1359 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 PIK3C2AO00443 1686 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 USP19O94966 1318 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 GCP02774 474 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 MORC1Q86VD1 984 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 USP54Q70EL1 1684 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 SHPRHQ149N8 1683 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 SLIT3O75094 1523 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 RALBP1Q15311 655 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 SOX12O15370 315 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-201ENST00000351328 ANP32CO43423 234 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 FBLN1P23142 703 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 CPDO75976 1380 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 NFAT5O94916 1531 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 TICAM2Q86XR7 235 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 POLKQ9UBT6 870 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 ABCA3Q99758 1704 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 PPP2R1AP30153 589 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 KIAA0232Q92628 1395 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 USP35Q9P2H5 1018 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 FAM83GA6ND36 823 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 ADAMTS2O95450 1211 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 AMPHP49418 695 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 MTHFSP49914 203 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 IP6K1Q92551 441 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 CLSTN1O94985 981 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 LRP6O75581 1613 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 RTL1A6NKG5 1358 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 HOXC9P31274 260 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 CHRNA2Q15822 529 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 FLT4P35916 1363 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 ABCC6O95255 1503 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 LTN1O94822 1766 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 INSRP06213 1382 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 NGLY1Q96IV0 654 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 C8orf37Q96NL8 207 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 COL18A1P39060 1754 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-201ENST00000351328 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 CFAP53Q96M91 514 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 BTG4Q9NY30 223 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-201ENST00000351328 PRDM4Q9UKN5 801 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143 ms