RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 EPS15P42566 896 aa18.48■□□□□ 0.55
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PTPRO-202ENST00000348962 OLFM4Q6UX06 510 aa18.47■□□□□ 0.55
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PTPRO-202ENST00000348962 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.47■□□□□ 0.55
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PTPRO-202ENST00000348962 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.42■□□□□ 0.54
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PTPRO-202ENST00000348962 MBD3O95983 291 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRO-202ENST00000348962 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
PTPRO-202ENST00000348962 AIDAQ96BJ3 306 aa18.33■□□□□ 0.53
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PTPRO-202ENST00000348962 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRO-202ENST00000348962 MCM10Q7L590 875 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRO-202ENST00000348962 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
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