RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345896.8

CERS2-202, Transcript of ceramide synthase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CERS2, Length 2,170 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2-202ENST00000345896 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
CERS2-202ENST00000345896 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP37.34■■■■□ 3.57
CERS2-202ENST00000345896 SSH1Q8WYL5 1049 aa37.34■■■■□ 3.57
CERS2-202ENST00000345896 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
CERS2-202ENST00000345896 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
CERS2-202ENST00000345896 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
CERS2-202ENST00000345896 TRIM27P14373 513 aa37.33■■■■□ 3.57
CERS2-202ENST00000345896 RIPK4P57078 832 aa37.31■■■■□ 3.56
CERS2-202ENST00000345896 TBC1D32Q96NH3 1257 aa37.31■■■■□ 3.56
CERS2-202ENST00000345896 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
CERS2-202ENST00000345896 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa37.3■■■■□ 3.56
CERS2-202ENST00000345896 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
CERS2-202ENST00000345896 DDX19BQ9UMR2 479 aa37.29■■■■□ 3.56
CERS2-202ENST00000345896 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
CERS2-202ENST00000345896 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
CERS2-202ENST00000345896 NALCNQ8IZF0 1738 aa37.24■■■■□ 3.55
CERS2-202ENST00000345896 ITPRIPQ8IWB1 547 aa37.24■■■■□ 3.55
CERS2-202ENST00000345896 FCHSD2O94868 740 aa37.23■■■■□ 3.55
CERS2-202ENST00000345896 PLEKHG3A1L390 1219 aa37.22■■■■□ 3.55
CERS2-202ENST00000345896 IL27Q8NEV9 243 aa37.22■■■■□ 3.55
CERS2-202ENST00000345896 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
CERS2-202ENST00000345896 ACEP12821 1306 aa37.21■■■■□ 3.55
CERS2-202ENST00000345896 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.21■■■■□ 3.55
CERS2-202ENST00000345896 KIF16BQ96L93 1317 aa37.21■■■■□ 3.55
CERS2-202ENST00000345896 FMN2Q9NZ56 1722 aa37.21■■■■□ 3.55
CERS2-202ENST00000345896 NME9Q86XW9 330 aa37.19■■■■□ 3.54
CERS2-202ENST00000345896 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
CERS2-202ENST00000345896 NRKQ7Z2Y5 1582 aa37.19■■■■□ 3.54
CERS2-202ENST00000345896 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.18■■■■□ 3.54
CERS2-202ENST00000345896 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
CERS2-202ENST00000345896 ALDH1L2Q3SY69 923 aa37.17■■■■□ 3.54
CERS2-202ENST00000345896 TMEM57Q8N5G2 664 aa37.17■■■■□ 3.54
CERS2-202ENST00000345896 SMC5Q8IY18 1101 aa37.15■■■■□ 3.54
CERS2-202ENST00000345896 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa37.15■■■■□ 3.54
CERS2-202ENST00000345896 ZRANB1Q9UGI0 708 aa37.15■■■■□ 3.54
CERS2-202ENST00000345896 RSPH6AQ9H0K4 717 aa37.15■■■■□ 3.54
CERS2-202ENST00000345896 POLKQ9UBT6 870 aa37.14■■■■□ 3.54
CERS2-202ENST00000345896 NWD1Q149M9 1564 aa37.13■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 ANTXR1Q9H6X2 564 aa37.13■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 USP6P35125 1406 aa37.12■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 ANKARQ7Z5J8 1434 aa37.12■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 PRKAR2BP31323 418 aa37.11■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 TBC1D2Q9BYX2 928 aa37.11■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 ZNF428Q96B54 188 aa37.1■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 FBLN1P23142 703 aa37.1■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 HSPA2P54652 639 aa37.09■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa37.09■■■■□ 3.53
CERS2-202ENST00000345896 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa37.07■■■■□ 3.52
CERS2-202ENST00000345896 COG3Q96JB2 828 aa37.05■■■■□ 3.52
CERS2-202ENST00000345896 NFE2L2Q16236 605 aa37.04■■■■□ 3.52
CERS2-202ENST00000345896 SSH2Q76I76 1423 aa37.04■■■■□ 3.52
CERS2-202ENST00000345896 C22orf23Q9BZE7 217 aa37.03■■■■□ 3.52
CERS2-202ENST00000345896 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
CERS2-202ENST00000345896 BRPF3Q9ULD4 1205 aa37.02■■■■□ 3.52
CERS2-202ENST00000345896 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 NUCB1Q02818 461 aa37■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 PHACTR3Q96KR7 559 aa37■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.98■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 C14orf37Q86TY3 774 aa36.97■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 AATKQ6ZMQ8 1374 aa36.96■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 HMOX1P09601 288 aa36.96■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.96■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 IL13P35225 146 aa36.95■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa36.95■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 OVOS2Q6IE36 1432 aa36.95■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 VAMP4O75379 141 aa36.95■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 ARHGAP45Q92619 1136 aa36.95■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa36.95■■■■□ 3.51
CERS2-202ENST00000345896 IFT57Q9NWB7 429 aa36.94■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 GNAI1P63096 354 aa36.93■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 TTC21AQ8NDW8 1320 aa36.92■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 ZNF853P0CG23 659 aa36.91■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 CHD1LQ86WJ1 897 aa36.9■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 PIK3C2AO00443 1686 aa36.89■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 STRCQ7RTU9 1775 aa36.89■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.88■■■■□ 3.5
CERS2-202ENST00000345896 LNPKQ9C0E8 428 aa36.87■■■■□ 3.49
CERS2-202ENST00000345896 TSPYL6Q8N831 410 aa36.86■■■■□ 3.49
CERS2-202ENST00000345896 MBIPQ9NS73 344 aa36.85■■■■□ 3.49
CERS2-202ENST00000345896 LMOD3Q0VAK6 560 aa36.84■■■■□ 3.49
CERS2-202ENST00000345896 GCC1Q96CN9 775 aa36.84■■■■□ 3.49
CERS2-202ENST00000345896 USP31Q70CQ4 1352 aa36.83■■■■□ 3.49
CERS2-202ENST00000345896 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.83■■■■□ 3.49
CERS2-202ENST00000345896 ABCC4O15439 1325 aa36.82■■■■□ 3.48
CERS2-202ENST00000345896 RBM25P49756 843 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
CERS2-202ENST00000345896 BMP2KLQ5H9B9 411 aa36.81■■■■□ 3.48
CERS2-202ENST00000345896 CFAP44Q96MT7 982 aa36.8■■■■□ 3.48
CERS2-202ENST00000345896 CHMP5Q9NZZ3 219 aa36.8■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms