RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 NFAT5O94916 1531 aa32.18■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.18■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 TMC1Q8TDI8 760 aa32.18■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 PARD3Q8TEW0 1356 aa32.17■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 RGPD5Q99666 1765 aa32.16■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 LRRC37A3O60309 1634 aa32.15■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 DDB1Q16531 1140 aa32.14■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 USP31Q70CQ4 1352 aa32.14■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa32.13■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa32.13■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 WNK3Q9BYP7 1800 aa32.12■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa32.12■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa32.12■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 OVOS2Q6IE36 1432 aa32.12■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 NME9Q86XW9 330 aa32.12■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 PEAK1Q9H792 1746 aa32.12■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 USP54Q70EL1 1684 aa32.11■■■□□ 2.73
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CLTB-202ENST00000345807 CARD10Q9BWT7 1032 aa32.1■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 RREB1Q92766 1687 aa32.1■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 ABCC6O95255 1503 aa32.1■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 TERF2IPQ9NYB0 399 aa32.08■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
CLTB-202ENST00000345807 A0A1W2PP64 1363 aa32.07■■■□□ 2.72
CLTB-202ENST00000345807 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa32.06■■■□□ 2.72
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CLTB-202ENST00000345807 NUP188Q5SRE5 1749 aa32.05■■■□□ 2.72
CLTB-202ENST00000345807 CCDC7Q96M83 1385 aa32.03■■■□□ 2.72
CLTB-202ENST00000345807 SBF2Q86WG5 1849 aa32.03■■■□□ 2.72
CLTB-202ENST00000345807 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
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CLTB-202ENST00000345807 NBPF14Q5TI25 921 aa32■■■□□ 2.71
CLTB-202ENST00000345807 NINLQ9Y2I6 1382 aa31.99■■■□□ 2.71
CLTB-202ENST00000345807 SLC24A1O60721 1099 aa31.99■■■□□ 2.71
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CLTB-202ENST00000345807 PTF1AQ7RTS3 328 aa31.95■■■□□ 2.71
CLTB-202ENST00000345807 NLRP2Q9NX02 1062 aa31.95■■■□□ 2.71
CLTB-202ENST00000345807 TNS2Q63HR2 1409 aa31.92■■■□□ 2.7
CLTB-202ENST00000345807 ANKRD24Q8TF21 1146 aa31.92■■■□□ 2.7
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CLTB-202ENST00000345807 COG3Q96JB2 828 aa31.87■■■□□ 2.69
CLTB-202ENST00000345807 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa31.86■■■□□ 2.69
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CLTB-202ENST00000345807 ACSBG1Q96GR2 724 aa31.77■■■□□ 2.68
CLTB-202ENST00000345807 HOXC9P31274 260 aa31.76■■■□□ 2.67
CLTB-202ENST00000345807 AMPHP49418 695 aa31.76■■■□□ 2.67
CLTB-202ENST00000345807 SPON1Q9HCB6 807 aa31.76■■■□□ 2.67
CLTB-202ENST00000345807 CDCA8Q53HL2 280 aa31.75■■■□□ 2.67
CLTB-202ENST00000345807 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.75■■■□□ 2.67
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CLTB-202ENST00000345807 GGNBP2Q9H3C7 697 aa31.72■■■□□ 2.67
CLTB-202ENST00000345807 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.7■■■□□ 2.67
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CLTB-202ENST00000345807 RTL1A6NKG5 1358 aa31.69■■■□□ 2.66
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CLTB-202ENST00000345807 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.69■■■□□ 2.66
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CLTB-202ENST00000345807 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
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CLTB-202ENST00000345807 PAPPAQ13219 1627 aa31.57■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 SHANK3Q9BYB0 1731 aa31.56■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa31.55■■■□□ 2.64
CLTB-202ENST00000345807 USHBP1Q8N6Y0 703 aa31.55■■■□□ 2.64
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