RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329565.5

SNN-201, Transcript of stannin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNN, Length 3,312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNN-201ENST00000329565 SHROOM2Q13796 1616 aa22.87■■□□□ 1.25
SNN-201ENST00000329565 FYB1O15117 783 aa22.86■■□□□ 1.25
SNN-201ENST00000329565 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SNN-201ENST00000329565 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SNN-201ENST00000329565 ABCC11Q96J66 1382 aa22.85■■□□□ 1.25
SNN-201ENST00000329565 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.85■■□□□ 1.25
SNN-201ENST00000329565 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.84■■□□□ 1.25
SNN-201ENST00000329565 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SNN-201ENST00000329565 ATP7AQ04656 1500 aa22.84■■□□□ 1.25
SNN-201ENST00000329565 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.84■■□□□ 1.25
SNN-201ENST00000329565 CDC45O75419 566 aa22.83■■□□□ 1.25
SNN-201ENST00000329565 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SNN-201ENST00000329565 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 GCC1Q96CN9 775 aa22.82■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 FANCAO15360 1455 aa22.82■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 CHD1O14646 1710 aa22.81■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.8■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 VAMP4O75379 141 aa22.8■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.79■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 GPT2Q8TD30 523 aa22.79■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.79■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 MAP7D2Q96T17 732 aa22.79■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 ADGRL1O94910 1474 aa22.78■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 PTMSP20962 102 aa22.78■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 DCTN1Q14203 1278 aa22.78■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.78■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 IL16Q14005 1332 aa22.77■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.77■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 DEPDC5O75140 1603 aa22.77■■□□□ 1.24
SNN-201ENST00000329565 ADGRB2O60241 1585 aa22.76■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 FAM83GA6ND36 823 aa22.76■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.76■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 PRAM1Q96QH2 718 aa22.76■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.75■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.75■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 CABP1Q9NZU7 370 aa22.75■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.75■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 MBIPQ9NS73 344 aa22.75■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.74■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.74■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 NSD2O96028 1365 aa22.74■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.74■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 DYNC1I1O14576 645 aa22.74■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 DTNBO60941 627 aa22.73■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 RABEP1Q15276 862 aa22.73■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 ADGRB1O14514 1584 aa22.73■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.73■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 NPATQ14207 1427 aa22.73■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.72■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 KRT24Q2M2I5 525 aa22.72■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.72■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.71■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 ZNF445P59923 1031 aa22.71■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 NUCB2P80303 420 aa22.71■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 USP26Q9BXU7 913 aa22.71■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.71■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 FCHSD2O94868 740 aa22.7■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.7■■□□□ 1.23
SNN-201ENST00000329565 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.69■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 IFT172Q9UG01 1749 aa22.69■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 TTC22Q5TAA0 569 aa22.69■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.69■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 SDSP20132 328 aa22.68■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 NFE2L2Q16236 605 aa22.68■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 ATP2B3Q16720 1220 aa22.68■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.68■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 POLKQ9UBT6 870 aa22.67■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 ADGRB3O60242 1522 aa22.67■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.67■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.67■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.66■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 FGD1P98174 961 aa22.66■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.66■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 USP25Q9UHP3 1055 aa22.66■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 ST18O60284 1047 aa22.65■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 GNAI1P63096 354 aa22.65■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.65■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 CDK19Q9BWU1 502 aa22.65■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 IDI1Q13907 227 aa22.65■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 GLI2P10070 1586 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms