RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 NLRP6P59044 892 aa34.81■■■■□ 3.16
HOXD8-201ENST00000313173 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.8■■■■□ 3.16
HOXD8-201ENST00000313173 FANCIQ9NVI1 1328 aa34.8■■■■□ 3.16
HOXD8-201ENST00000313173 FLT4P35916 1363 aa34.8■■■■□ 3.16
HOXD8-201ENST00000313173 SOX12O15370 315 aa34.79■■■■□ 3.16
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
HOXD8-201ENST00000313173 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXD8-201ENST00000313173 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.77■■■■□ 3.16
HOXD8-201ENST00000313173 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
HOXD8-201ENST00000313173 RARSP54136 660 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
HOXD8-201ENST00000313173 ABTB2Q8N961 1025 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXD8-201ENST00000313173 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXD8-201ENST00000313173 KIF24Q5T7B8 1368 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXD8-201ENST00000313173 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
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HOXD8-201ENST00000313173 DLG5Q8TDM6 1919 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGEF10O15013 1369 aa34.72■■■■□ 3.15
HOXD8-201ENST00000313173 AMPHP49418 695 aa34.7■■■■□ 3.15
HOXD8-201ENST00000313173 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.7■■■■□ 3.15
HOXD8-201ENST00000313173 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34.7■■■■□ 3.15
HOXD8-201ENST00000313173 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
HOXD8-201ENST00000313173 LMOD3Q0VAK6 560 aa34.69■■■■□ 3.14
HOXD8-201ENST00000313173 AEBP1Q8IUX7 1158 aa34.69■■■■□ 3.14
HOXD8-201ENST00000313173 PSME1Q06323 249 aa34.69■■■■□ 3.14
HOXD8-201ENST00000313173 PDE3AQ14432 1141 aa34.69■■■■□ 3.14
HOXD8-201ENST00000313173 KIF1AQ12756 1690 aa34.68■■■■□ 3.14
HOXD8-201ENST00000313173 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
HOXD8-201ENST00000313173 ATF3P18847 181 aa34.67■■■■□ 3.14
HOXD8-201ENST00000313173 ORAI2Q96SN7 254 aa34.66■■■■□ 3.14
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.65■■■■□ 3.14
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HOXD8-201ENST00000313173 DCCP43146 1447 aa34.64■■■■□ 3.14
HOXD8-201ENST00000313173 RTL1A6NKG5 1358 aa34.63■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 NFAT5O94916 1531 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 MSH6P52701 1360 aa34.61■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 HOXC9P31274 260 aa34.61■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 KDRP35968 1356 aa34.61■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 LTN1O94822 1766 aa34.61■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 IFT57Q9NWB7 429 aa34.6■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 IGSF1Q8N6C5 1336 aa34.6■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 CADPS2Q86UW7 1296 aa34.59■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 MST1RQ04912 1400 aa34.59■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
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HOXD8-201ENST00000313173 BCL2L13Q9BXK5 485 aa34.57■■■■□ 3.13
HOXD8-201ENST00000313173 FOXO3O43524 673 aa34.57■■■■□ 3.12
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF853P0CG23 659 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXD8-201ENST00000313173 EYA1Q99502 592 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXD8-201ENST00000313173 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
HOXD8-201ENST00000313173 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXD8-201ENST00000313173 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
HOXD8-201ENST00000313173 PANK1Q8TE04 598 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXD8-201ENST00000313173 SLIT3O75094 1523 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXD8-201ENST00000313173 SMC4Q9NTJ3 1288 aa34.51■■■■□ 3.12
HOXD8-201ENST00000313173 CFAP44Q96MT7 982 aa34.51■■■■□ 3.11
HOXD8-201ENST00000313173 FAM83GA6ND36 823 aa34.5■■■■□ 3.11
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HOXD8-201ENST00000313173 ZNF428Q96B54 188 aa34.49■■■■□ 3.11
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HOXD8-201ENST00000313173 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa34.48■■■■□ 3.11
HOXD8-201ENST00000313173 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.48■■■■□ 3.11
HOXD8-201ENST00000313173 IP6K1Q92551 441 aa34.48■■■■□ 3.11
HOXD8-201ENST00000313173 MBIPQ9NS73 344 aa34.47■■■■□ 3.11
HOXD8-201ENST00000313173 COG6Q9Y2V7 657 aa34.47■■■■□ 3.11
HOXD8-201ENST00000313173 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
HOXD8-201ENST00000313173 ALDH1L2Q3SY69 923 aa34.47■■■■□ 3.11
HOXD8-201ENST00000313173 DCTN1Q14203 1278 aa34.45■■■■□ 3.11
HOXD8-201ENST00000313173 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
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HOXD8-201ENST00000313173 MS4A1P11836 297 aa34.44■■■■□ 3.1
HOXD8-201ENST00000313173 RLBP1P12271 317 aa34.44■■■■□ 3.1
HOXD8-201ENST00000313173 ALS2Q96Q42 1657 aa34.44■■■■□ 3.1
HOXD8-201ENST00000313173 AAMPQ13685 434 aa34.43■■■■□ 3.1
HOXD8-201ENST00000313173 TNNQ9UQP3 1299 aa34.43■■■■□ 3.1
HOXD8-201ENST00000313173 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
HOXD8-201ENST00000313173 KIF16BQ96L93 1317 aa34.41■■■■□ 3.1
HOXD8-201ENST00000313173 GAS2L2Q8NHY3 880 aa34.41■■■■□ 3.1
HOXD8-201ENST00000313173 CLUAP1Q96AJ1 413 aa34.41■■■■□ 3.1
HOXD8-201ENST00000313173 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
HOXD8-201ENST00000313173 GCP02774 474 aa34.4■■■■□ 3.1
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HOXD8-201ENST00000313173 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
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HOXD8-201ENST00000313173 MCM10Q7L590 875 aa34.38■■■■□ 3.09
HOXD8-201ENST00000313173 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.37■■■■□ 3.09
HOXD8-201ENST00000313173 CRB1P82279 1406 aa34.37■■■■□ 3.09
HOXD8-201ENST00000313173 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa34.36■■■■□ 3.09
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGEF25Q86VW2 580 aa34.36■■■■□ 3.09
HOXD8-201ENST00000313173 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM27P14373 513 aa34.36■■■■□ 3.09
HOXD8-201ENST00000313173 TSPYL6Q8N831 410 aa34.36■■■■□ 3.09
HOXD8-201ENST00000313173 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
HOXD8-201ENST00000313173 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
HOXD8-201ENST00000313173 MVPQ14764 893 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
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