RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.87■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.87■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.86■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 DDB1Q16531 1140 aa23.86■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.86■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.86■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.85■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.85■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.84■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.84■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.84■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 TMC1Q8TDI8 760 aa23.83■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 NFAT5O94916 1531 aa23.83■■□□□ 1.41
TNNT1-201ENST00000291901 NBPF14Q5TI25 921 aa23.82■■□□□ 1.4
TNNT1-201ENST00000291901 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.81■■□□□ 1.4
TNNT1-201ENST00000291901 TONSLQ96HA7 1378 aa23.8■■□□□ 1.4
TNNT1-201ENST00000291901 LTN1O94822 1766 aa23.8■■□□□ 1.4
TNNT1-201ENST00000291901 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.79■■□□□ 1.4
TNNT1-201ENST00000291901 NME9Q86XW9 330 aa23.79■■□□□ 1.4
TNNT1-201ENST00000291901 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
TNNT1-201ENST00000291901 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.79■■□□□ 1.4
TNNT1-201ENST00000291901 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.79■■□□□ 1.4
TNNT1-201ENST00000291901 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
TNNT1-201ENST00000291901 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.78■■□□□ 1.4
TNNT1-201ENST00000291901 USP54Q70EL1 1684 aa23.76■■□□□ 1.39
TNNT1-201ENST00000291901 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
TNNT1-201ENST00000291901 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.75■■□□□ 1.39
TNNT1-201ENST00000291901 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
TNNT1-201ENST00000291901 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
TNNT1-201ENST00000291901 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
TNNT1-201ENST00000291901 EXOC5O00471 708 aa23.73■■□□□ 1.39
TNNT1-201ENST00000291901 USP31Q70CQ4 1352 aa23.73■■□□□ 1.39
TNNT1-201ENST00000291901 ABCC6O95255 1503 aa23.71■■□□□ 1.39
TNNT1-201ENST00000291901 PLSCR1O15162 318 aa23.71■■□□□ 1.39
TNNT1-201ENST00000291901 CCDC7Q96M83 1385 aa23.7■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.7■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 A0A1W2PP64 1363 aa23.69■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.69■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 ERBB3P21860 1342 aa23.67■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 PROM2Q8N271 834 aa23.67■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.66■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.66■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 SPON1Q9HCB6 807 aa23.66■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 BCL9O00512 1426 aa23.66■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 TNS2Q63HR2 1409 aa23.66■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 KCNQ2O43526 872 aa23.65■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
TNNT1-201ENST00000291901 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.64■■□□□ 1.37
TNNT1-201ENST00000291901 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.64■■□□□ 1.37
TNNT1-201ENST00000291901 TESK2Q96S53 571 aa23.63■■□□□ 1.37
TNNT1-201ENST00000291901 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TNNT1-201ENST00000291901 NHSQ6T4R5 1651 aa23.63■■□□□ 1.37
TNNT1-201ENST00000291901 CASZ1Q86V15 1759 aa23.63■■□□□ 1.37
TNNT1-201ENST00000291901 IL2RBP14784 551 aa23.62■■□□□ 1.37
TNNT1-201ENST00000291901 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TNNT1-201ENST00000291901 TXNRD1Q16881 649 aa23.61■■□□□ 1.37
TNNT1-201ENST00000291901 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TNNT1-201ENST00000291901 FBLN1P23142 703 aa23.59■■□□□ 1.37
TNNT1-201ENST00000291901 BTAF1O14981 1849 aa23.58■■□□□ 1.37
TNNT1-201ENST00000291901 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.57■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 ZBTB7AO95365 584 aa23.57■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 IP6K1Q92551 441 aa23.57■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 COG3Q96JB2 828 aa23.56■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 STK32BQ9NY57 414 aa23.56■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.55■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.54■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 SLC15A2Q16348 729 aa23.53■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 AMPHP49418 695 aa23.52■■□□□ 1.36
TNNT1-201ENST00000291901 MYOM1P52179 1685 aa23.51■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 HOXC9P31274 260 aa23.51■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.5■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 USP47Q96K76 1375 aa23.5■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 SLC24A1O60721 1099 aa23.49■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 TMF1P82094 1093 aa23.49■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.48■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 PTGER2P43116 358 aa23.47■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 PAPPAQ13219 1627 aa23.47■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.46■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.46■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.46■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.46■■□□□ 1.35
TNNT1-201ENST00000291901 FYB1O15117 783 aa23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-201ENST00000291901 YY1P25490 414 aa23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-201ENST00000291901 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-201ENST00000291901 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.44■■□□□ 1.34
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF827Q17R98 1081 aa23.42■■□□□ 1.34
TNNT1-201ENST00000291901 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.42■■□□□ 1.34
TNNT1-201ENST00000291901 MTFR1LQ9H019 292 aa23.42■■□□□ 1.34
TNNT1-201ENST00000291901 MEGF6O75095 1541 aa23.42■■□□□ 1.34
TNNT1-201ENST00000291901 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TNNT1-201ENST00000291901 KCNQ4P56696 695 aa23.41■■□□□ 1.34
TNNT1-201ENST00000291901 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.5 ms