RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 TMPOP42166 694 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-201ENST00000284957 FLT4P35916 1363 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-201ENST00000284957 PHACTR3Q96KR7 559 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-201ENST00000284957 RCAN3Q9UKA8 241 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-201ENST00000284957 LTN1O94822 1766 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-201ENST00000284957 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-201ENST00000284957 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-201ENST00000284957 ALS2Q96Q42 1657 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-201ENST00000284957 E9PSI1 815 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 KIF24Q5T7B8 1368 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR63Q8IWG1 891 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXC9P31274 260 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 AMPHP49418 695 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 SLIT3O75094 1523 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 USP19O94966 1318 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 RIPK4P57078 832 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 SULT6B1Q6IMI4 303 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 PXDNQ92626 1479 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 BRINP3Q76B58 766 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 DLG5Q8TDM6 1919 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 GCP02774 474 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 RRP1P56182 461 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 SLAIN2Q9P270 581 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 NPHP3Q7Z494 1330 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 NFE2L2Q16236 605 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 LMOD2Q6P5Q4 547 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 RTL1A6NKG5 1358 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 EYA1Q99502 592 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGEF10O15013 1369 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 KDRP35968 1356 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 IGSF1Q8N6C5 1336 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 IP6K1Q92551 441 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGEF25Q86VW2 580 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHG5O94827 1062 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 NEFMP07197 916 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 ERICH6BQ5W0A0 696 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 TNS3Q68CZ2 1445 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 PLIN1O60240 522 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 IL16Q14005 1332 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 LTBP4Q8N2S1 1624 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 RGPD2P0DJD1 1756 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 FANCIQ9NVI1 1328 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 MYH16Q9H6N6 1097 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 AXIN2Q9Y2T1 843 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 RGPD5Q99666 1765 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB7CA1YPR0 619 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM83GA6ND36 823 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 BCAR3O75815 825 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 NBPF6Q5VWK0 638 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 NBPF4Q96M43 638 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 DCTN1Q14203 1278 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 USHBP1Q8N6Y0 703 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 COL18A1P39060 1754 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP4R2Q9NY27 417 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-201ENST00000284957 C20orf194Q5TEA3 1177 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF853P0CG23 659 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 RARSP54136 660 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 LMOD3Q0VAK6 560 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 NCAPD2Q15021 1401 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 EXOC6Q8TAG9 804 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD24Q8TF21 1146 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 MCM10Q7L590 875 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 IFT57Q9NWB7 429 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 ERBB3P21860 1342 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 LMO7Q8WWI1 1683 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 CFAP44Q96MT7 982 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 MBIPQ9NS73 344 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 CPDO75976 1380 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCA3Q99758 1704 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA0232Q92628 1395 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 GNAI1P63096 354 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 CRB1P82279 1406 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 GAS2L2Q8NHY3 880 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 CHRNA2Q15822 529 aa12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms