RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266254.11

TTLL1-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL1, Length 1,645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-201ENST00000266254 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.48■■■□□ 2.47
TTLL1-201ENST00000266254 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
TTLL1-201ENST00000266254 GCP02774 474 aa30.47■■■□□ 2.47
TTLL1-201ENST00000266254 CHRNA2Q15822 529 aa30.47■■■□□ 2.47
TTLL1-201ENST00000266254 VPS72Q15906 364 aa30.47■■■□□ 2.47
TTLL1-201ENST00000266254 PIK3C2AO00443 1686 aa30.46■■■□□ 2.47
TTLL1-201ENST00000266254 COG3Q96JB2 828 aa30.45■■■□□ 2.47
TTLL1-201ENST00000266254 USP54Q70EL1 1684 aa30.42■■■□□ 2.46
TTLL1-201ENST00000266254 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
TTLL1-201ENST00000266254 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa30.41■■■□□ 2.46
TTLL1-201ENST00000266254 CPDO75976 1380 aa30.41■■■□□ 2.46
TTLL1-201ENST00000266254 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.41■■■□□ 2.46
TTLL1-201ENST00000266254 GLI3P10071 1580 aa30.41■■■□□ 2.46
TTLL1-201ENST00000266254 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30.4■■■□□ 2.46
TTLL1-201ENST00000266254 NRAPQ86VF7 1730 aa30.4■■■□□ 2.46
TTLL1-201ENST00000266254 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.4■■■□□ 2.46
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TTLL1-201ENST00000266254 SOX12O15370 315 aa30.38■■■□□ 2.45
TTLL1-201ENST00000266254 MTHFSP49914 203 aa30.38■■■□□ 2.45
TTLL1-201ENST00000266254 STRN4Q9NRL3 753 aa30.38■■■□□ 2.45
TTLL1-201ENST00000266254 KCNH5Q8NCM2 988 aa30.36■■■□□ 2.45
TTLL1-201ENST00000266254 CFAP53Q96M91 514 aa30.36■■■□□ 2.45
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TTLL1-201ENST00000266254 EVA1CP58658 441 aa30.35■■■□□ 2.45
TTLL1-201ENST00000266254 A0A0G2JS52 829 aa30.33■■■□□ 2.45
TTLL1-201ENST00000266254 MYT1Q01538 1121 aa30.33■■■□□ 2.45
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TTLL1-201ENST00000266254 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa30.31■■■□□ 2.44
TTLL1-201ENST00000266254 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa30.31■■■□□ 2.44
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TTLL1-201ENST00000266254 SEPT12Q8IYM1 358 aa30.3■■■□□ 2.44
TTLL1-201ENST00000266254 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
TTLL1-201ENST00000266254 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa30.3■■■□□ 2.44
TTLL1-201ENST00000266254 LMO7Q8WWI1 1683 aa30.29■■■□□ 2.44
TTLL1-201ENST00000266254 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.44
TTLL1-201ENST00000266254 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.44
TTLL1-201ENST00000266254 POLKQ9UBT6 870 aa30.28■■■□□ 2.44
TTLL1-201ENST00000266254 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
TTLL1-201ENST00000266254 ARHGEF25Q86VW2 580 aa30.25■■■□□ 2.43
TTLL1-201ENST00000266254 USP35Q9P2H5 1018 aa30.25■■■□□ 2.43
TTLL1-201ENST00000266254 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa30.25■■■□□ 2.43
TTLL1-201ENST00000266254 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
TTLL1-201ENST00000266254 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
TTLL1-201ENST00000266254 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
TTLL1-201ENST00000266254 NFAT5O94916 1531 aa30.24■■■□□ 2.43
TTLL1-201ENST00000266254 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
TTLL1-201ENST00000266254 FBLN1P23142 703 aa30.23■■■□□ 2.43
TTLL1-201ENST00000266254 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.23■■■□□ 2.43
TTLL1-201ENST00000266254 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30.21■■■□□ 2.43
TTLL1-201ENST00000266254 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
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TTLL1-201ENST00000266254 KRT27Q7Z3Y8 459 aa30.18■■■□□ 2.42
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TTLL1-201ENST00000266254 EP400Q96L91 3159 aa30.17■■■□□ 2.42
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TTLL1-201ENST00000266254 CRB1P82279 1406 aa30.16■■■□□ 2.42
TTLL1-201ENST00000266254 COL18A1P39060 1754 aa30.16■■■□□ 2.42
TTLL1-201ENST00000266254 BRWD3Q6RI45 1802 aa30.15■■■□□ 2.42
TTLL1-201ENST00000266254 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa30.15■■■□□ 2.42
TTLL1-201ENST00000266254 LTN1O94822 1766 aa30.15■■■□□ 2.42
TTLL1-201ENST00000266254 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30.14■■■□□ 2.42
TTLL1-201ENST00000266254 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.13■■■□□ 2.41
TTLL1-201ENST00000266254 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.13■■■□□ 2.41
TTLL1-201ENST00000266254 BARGINQ6ZT62 677 aa30.13■■■□□ 2.41
TTLL1-201ENST00000266254 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
TTLL1-201ENST00000266254 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.12■■■□□ 2.41
TTLL1-201ENST00000266254 ABCC6O95255 1503 aa30.12■■■□□ 2.41
TTLL1-201ENST00000266254 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.11■■■□□ 2.41
TTLL1-201ENST00000266254 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa30.11■■■□□ 2.41
TTLL1-201ENST00000266254 FLT4P35916 1363 aa30.09■■■□□ 2.41
TTLL1-201ENST00000266254 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
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TTLL1-201ENST00000266254 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 RGPD5Q99666 1765 aa30.06■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 AMPHP49418 695 aa30.06■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 RTL1A6NKG5 1358 aa30.06■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 IL13P35225 146 aa30.04■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 CCDC125Q86Z20 511 aa30.04■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 ERBB3P21860 1342 aa30.04■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 FAM182BQ5T319 152 aa30.04■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 PDE3BQ13370 1112 aa30.03■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.03■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.03■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.02■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 IP6K1Q92551 441 aa30.02■■■□□ 2.4
TTLL1-201ENST00000266254 RUNDC1Q96C34 613 aa30.01■■■□□ 2.39
TTLL1-201ENST00000266254 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa30■■■□□ 2.39
TTLL1-201ENST00000266254 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
TTLL1-201ENST00000266254 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
TTLL1-201ENST00000266254 NLRP2Q9NX02 1062 aa30■■■□□ 2.39
TTLL1-201ENST00000266254 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.99■■■□□ 2.39
TTLL1-201ENST00000266254 HOXC9P31274 260 aa29.99■■■□□ 2.39
TTLL1-201ENST00000266254 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
TTLL1-201ENST00000266254 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
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