RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 PANK3Q9H999 370 aa29.08■■■□□ 2.25
COX5B-201ENST00000258424 RGPD5Q99666 1765 aa29.06■■■□□ 2.24
COX5B-201ENST00000258424 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
COX5B-201ENST00000258424 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.06■■■□□ 2.24
COX5B-201ENST00000258424 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.05■■■□□ 2.24
COX5B-201ENST00000258424 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.04■■■□□ 2.24
COX5B-201ENST00000258424 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.04■■■□□ 2.24
COX5B-201ENST00000258424 COG3Q96JB2 828 aa29.04■■■□□ 2.24
COX5B-201ENST00000258424 EP400Q96L91 3159 aa29.03■■■□□ 2.24
COX5B-201ENST00000258424 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.02■■■□□ 2.24
COX5B-201ENST00000258424 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.01■■■□□ 2.23
COX5B-201ENST00000258424 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.01■■■□□ 2.23
COX5B-201ENST00000258424 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.99■■■□□ 2.23
COX5B-201ENST00000258424 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
COX5B-201ENST00000258424 ABCC6O95255 1503 aa28.99■■■□□ 2.23
COX5B-201ENST00000258424 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.98■■■□□ 2.23
COX5B-201ENST00000258424 STRN4Q9NRL3 753 aa28.98■■■□□ 2.23
COX5B-201ENST00000258424 FBLN1P23142 703 aa28.97■■■□□ 2.23
COX5B-201ENST00000258424 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.96■■■□□ 2.23
COX5B-201ENST00000258424 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.94■■■□□ 2.22
COX5B-201ENST00000258424 EVA1CP58658 441 aa28.93■■■□□ 2.22
COX5B-201ENST00000258424 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.93■■■□□ 2.22
COX5B-201ENST00000258424 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
COX5B-201ENST00000258424 PEAK1Q9H792 1746 aa28.91■■■□□ 2.22
COX5B-201ENST00000258424 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.91■■■□□ 2.22
COX5B-201ENST00000258424 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.89■■■□□ 2.22
COX5B-201ENST00000258424 NSD2O96028 1365 aa28.88■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 BAG6P46379 1132 aa28.88■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 FAM182BQ5T319 152 aa28.88■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 USP35Q9P2H5 1018 aa28.86■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.86■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 CRB1P82279 1406 aa28.86■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 IP6K1Q92551 441 aa28.84■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.84■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.84■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 RTL1A6NKG5 1358 aa28.83■■■□□ 2.21
COX5B-201ENST00000258424 HOXC9P31274 260 aa28.82■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 BARGINQ6ZT62 677 aa28.82■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 ERBB3P21860 1342 aa28.82■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 AMPHP49418 695 aa28.81■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.8■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.8■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.79■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.79■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.79■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.79■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.78■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 PDE3BQ13370 1112 aa28.77■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 FLT4P35916 1363 aa28.76■■■□□ 2.2
COX5B-201ENST00000258424 MORC1Q86VD1 984 aa28.76■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.75■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.75■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.75■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 POLKQ9UBT6 870 aa28.74■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.73■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.73■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 INSRP06213 1382 aa28.73■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 TRIM37O94972 964 aa28.72■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 LRRC37A3O60309 1634 aa28.71■■■□□ 2.19
COX5B-201ENST00000258424 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
COX5B-201ENST00000258424 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.7■■■□□ 2.18
COX5B-201ENST00000258424 DISP2A7MBM2 1401 aa28.69■■■□□ 2.18
COX5B-201ENST00000258424 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
COX5B-201ENST00000258424 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
COX5B-201ENST00000258424 APBA3O96018 575 aa28.67■■■□□ 2.18
COX5B-201ENST00000258424 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
COX5B-201ENST00000258424 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.64■■■□□ 2.18
COX5B-201ENST00000258424 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
COX5B-201ENST00000258424 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.63■■■□□ 2.17
COX5B-201ENST00000258424 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.61■■■□□ 2.17
COX5B-201ENST00000258424 NBPF4Q96M43 638 aa28.61■■■□□ 2.17
COX5B-201ENST00000258424 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
COX5B-201ENST00000258424 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.59■■■□□ 2.17
COX5B-201ENST00000258424 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
COX5B-201ENST00000258424 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
COX5B-201ENST00000258424 MEGF6O75095 1541 aa28.56■■■□□ 2.16
COX5B-201ENST00000258424 IL2RBP14784 551 aa28.56■■■□□ 2.16
COX5B-201ENST00000258424 NCAPD2Q15021 1401 aa28.56■■■□□ 2.16
COX5B-201ENST00000258424 DDB1Q16531 1140 aa28.56■■■□□ 2.16
COX5B-201ENST00000258424 TNS2Q63HR2 1409 aa28.56■■■□□ 2.16
COX5B-201ENST00000258424 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.55■■■□□ 2.16
COX5B-201ENST00000258424 MTHFSP49914 203 aa28.55■■■□□ 2.16
COX5B-201ENST00000258424 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
COX5B-201ENST00000258424 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.54■■■□□ 2.16
COX5B-201ENST00000258424 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
COX5B-201ENST00000258424 EYA1Q99502 592 aa28.52■■■□□ 2.16
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